130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2329 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2329  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
284 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.125738  decreased coverage  0.000000741736 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.75 
 
 
255 aa  102  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2508  competence protein F  43.44 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  40.24 
 
 
299 aa  86.7  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  35.85 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  44.5 
 
 
238 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  38.4 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  35.83 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  39.67 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  39.45 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  39.45 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  37.56 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  39.45 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  38.81 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  33.17 
 
 
246 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.25 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  28.88 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  25.4 
 
 
297 aa  67  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  38.94 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  40.6 
 
 
244 aa  63.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  39.57 
 
 
202 aa  63.2  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  35.87 
 
 
213 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  41.54 
 
 
259 aa  62.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  25.33 
 
 
239 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  38.33 
 
 
227 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  36.91 
 
 
234 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  38.99 
 
 
265 aa  60.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  33.73 
 
 
244 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  40.27 
 
 
284 aa  58.9  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 
237 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  28.09 
 
 
223 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  25.73 
 
 
226 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2902  competence protein F, putative  33.19 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  33.61 
 
 
253 aa  57.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  36.07 
 
 
227 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  27.75 
 
 
232 aa  57  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  30.89 
 
 
246 aa  57  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  33.47 
 
 
241 aa  56.2  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  28.27 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  30.7 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  24.12 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  35.75 
 
 
241 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  30.81 
 
 
244 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  31.28 
 
 
263 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  32.3 
 
 
230 aa  52.8  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  31.84 
 
 
237 aa  52.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  24.12 
 
 
217 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  48.68 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  24.12 
 
 
217 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  23.08 
 
 
219 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  23.89 
 
 
231 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.24 
 
 
215 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2568  ComF family protein  39.53 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  34.34 
 
 
233 aa  50.8  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  22.52 
 
 
230 aa  50.4  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  39.29 
 
 
213 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  34.25 
 
 
235 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  30.69 
 
 
231 aa  50.4  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  25.62 
 
 
220 aa  50.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  27.51 
 
 
232 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  32.03 
 
 
259 aa  50.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  30.64 
 
 
246 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  47.31 
 
 
246 aa  49.7  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  33.52 
 
 
241 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  30.63 
 
 
245 aa  49.7  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  22.86 
 
 
245 aa  48.9  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0756  putative amidophosphoribosyltransferase  38.54 
 
 
107 aa  48.5  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  37.55 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  32.87 
 
 
238 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  27.75 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  29.41 
 
 
230 aa  48.1  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  36.2 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  31.67 
 
 
242 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  39.6 
 
 
207 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  35.86 
 
 
255 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25 
 
 
206 aa  47.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  27.84 
 
 
286 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  33.53 
 
 
245 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  40.59 
 
 
239 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  32.3 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  38.33 
 
 
239 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4707  hypothetical protein  36.94 
 
 
208 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00978047 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12410  predicted amidophosphoribosyltransferase  41 
 
 
254 aa  47  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 
229 aa  47.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001878  predicted amidophosphoribosyltransferase  27.71 
 
 
180 aa  47  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  25.6 
 
 
273 aa  46.2  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  23.64 
 
 
219 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  46.97 
 
 
217 aa  46.6  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  34.78 
 
 
247 aa  45.8  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.28 
 
 
238 aa  45.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  37.5 
 
 
220 aa  45.8  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1873  hypothetical protein  32.52 
 
 
190 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  60.98 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  29.22 
 
 
243 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  30.18 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  27.95 
 
 
243 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  26.4 
 
 
230 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3813  adenine phosphoribosyltransferase  56.52 
 
 
179 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0904052  normal  0.50341 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.32 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>