140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1585 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  100 
 
 
422 aa  800    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  42.78 
 
 
432 aa  205  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  29.07 
 
 
432 aa  123  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  30.72 
 
 
463 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  30.37 
 
 
423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  29.37 
 
 
463 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  30.25 
 
 
564 aa  116  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  34.68 
 
 
429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  30.07 
 
 
415 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  34.62 
 
 
431 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  32.57 
 
 
439 aa  107  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  28.94 
 
 
418 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  28.24 
 
 
479 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  34.03 
 
 
422 aa  100  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  32.53 
 
 
413 aa  99.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  33.24 
 
 
431 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  35.66 
 
 
393 aa  98.2  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  35.54 
 
 
424 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  32.05 
 
 
392 aa  94  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  34.94 
 
 
491 aa  89  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  33.61 
 
 
497 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  41.46 
 
 
405 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  37.8 
 
 
395 aa  77  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  40.22 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  34.84 
 
 
391 aa  76.3  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3273  protein of unknown function DUF58  30.23 
 
 
453 aa  76.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765487  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  29.84 
 
 
452 aa  75.1  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  26.9 
 
 
407 aa  74.3  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  26.8 
 
 
552 aa  74.3  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  36.13 
 
 
387 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  30.9 
 
 
419 aa  69.7  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  31.76 
 
 
426 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  28.73 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  33.55 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  27.48 
 
 
442 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  30.36 
 
 
442 aa  66.6  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  28.07 
 
 
428 aa  66.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  35.48 
 
 
411 aa  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  28.48 
 
 
399 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  29.74 
 
 
412 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  28.14 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  32.94 
 
 
375 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  25.88 
 
 
294 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4248  hypothetical protein  30.47 
 
 
334 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  27.94 
 
 
395 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  28.42 
 
 
453 aa  61.2  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  25.61 
 
 
426 aa  60.5  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  31.47 
 
 
410 aa  60.1  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2239  protein of unknown function DUF58  30.23 
 
 
451 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  32.24 
 
 
333 aa  58.9  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  30.18 
 
 
391 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  29.17 
 
 
448 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2294  hypothetical protein  28.9 
 
 
436 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.284249  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  31.05 
 
 
561 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  30.38 
 
 
382 aa  57  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  19.91 
 
 
401 aa  57  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  26.15 
 
 
384 aa  57  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  36.79 
 
 
370 aa  56.6  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  29.44 
 
 
315 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1612  hypothetical protein  27.16 
 
 
412 aa  55.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0111246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  27.54 
 
 
436 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  39.45 
 
 
453 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  22.14 
 
 
398 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0911  hypothetical protein  25.66 
 
 
428 aa  55.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  26.85 
 
 
384 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  21.88 
 
 
443 aa  55.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  31.48 
 
 
402 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  23.84 
 
 
458 aa  54.3  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  33.96 
 
 
325 aa  53.5  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2227  hypothetical protein  22.31 
 
 
428 aa  53.1  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  32.64 
 
 
394 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  25.82 
 
 
349 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  22.4 
 
 
446 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  20.79 
 
 
404 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  26.57 
 
 
421 aa  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  28.63 
 
 
391 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  25.62 
 
 
391 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0319  hypothetical protein  27.78 
 
 
369 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  20.79 
 
 
404 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  31.33 
 
 
317 aa  51.2  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  27.14 
 
 
440 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1678  hypothetical protein  23.66 
 
 
412 aa  51.2  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.44892  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0449  protein of unknown function DUF58  23.46 
 
 
381 aa  50.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  25.65 
 
 
384 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  25.65 
 
 
384 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  18.62 
 
 
363 aa  50.1  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  32.04 
 
 
431 aa  50.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  25.6 
 
 
402 aa  49.7  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  20.43 
 
 
404 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  29.73 
 
 
450 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  20.43 
 
 
404 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1173  conserved repeat domain protein  28.36 
 
 
469 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  27.08 
 
 
450 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  24.05 
 
 
444 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  26.49 
 
 
395 aa  48.5  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3811  hypothetical protein  22.54 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0281  hypothetical protein  18.25 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0262766  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  22.46 
 
 
374 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  20.75 
 
 
405 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  20.43 
 
 
404 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>