189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10100 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_10100  universal stress protein UspA-like protein  100 
 
 
145 aa  291  1e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23226  hitchhiker  0.0000145361 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0180  UspA domain protein  57.93 
 
 
146 aa  161  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.242763  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19770  universal stress protein UspA-like protein  51.03 
 
 
147 aa  152  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.078994  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  34.25 
 
 
152 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  34.25 
 
 
152 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  34.25 
 
 
152 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  34.25 
 
 
152 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  34.25 
 
 
152 aa  77  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  34.25 
 
 
152 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  34.25 
 
 
152 aa  77  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  34.25 
 
 
152 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  34.25 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  29.3 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  33.78 
 
 
148 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  31.37 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  31.37 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  28.1 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
162 aa  60.5  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  30.46 
 
 
150 aa  60.1  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  30.46 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  32.69 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 
166 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 
166 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2025  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.17 
 
 
145 aa  56.2  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.404672  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.58 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  30 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1302  hypothetical protein  28.83 
 
 
158 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  31.94 
 
 
187 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  29.53 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  29.8 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  28.97 
 
 
166 aa  52  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  25.33 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  25.34 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  29.11 
 
 
177 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  33.56 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3071  hypothetical protein  30.14 
 
 
317 aa  51.2  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3551  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3342  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537895  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 
155 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  27.4 
 
 
140 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 
156 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  27.4 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  27.4 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  27.4 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  27.4 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  27.4 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  27.4 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  26.92 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  27.97 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  27.97 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  29.53 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  28.86 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  23.84 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  27.4 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  26.71 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  27.39 
 
 
182 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  27.39 
 
 
182 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  23.45 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  24.68 
 
 
175 aa  47.4  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  27.63 
 
 
165 aa  47.4  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  28.37 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.8 
 
 
141 aa  47  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  27.15 
 
 
151 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  25.52 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2992  hypothetical protein  29.17 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0631  UspA family nucleotide-binding protein  24.66 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3036  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  45 
 
 
296 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3007  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  26.75 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  28.67 
 
 
155 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
297 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  25.71 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  26.8 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  27.33 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2291  UspA domain protein  26.42 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000481924  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  28 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0646  UspA domain-containing protein  27.45 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  29.66 
 
 
280 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6198  UspA domain-containing protein  29.03 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  28 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  29.93 
 
 
303 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 
158 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  28.47 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  27.97 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  26.28 
 
 
140 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  27.97 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  27.97 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  27.97 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>