More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4216 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  655    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  43.57 
 
 		 364 aa  206  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2554  hypothetical protein  41.59 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3895  hypothetical protein  39.94 
 
 		 340 aa  194  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467618  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3439  hypothetical protein  38.55 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.242294 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  36.1 
 
 		 350 aa  161  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4286  hypothetical protein  38.39 
 
 		 343 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  34.6 
 
 		 372 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1984  hypothetical protein  36.89 
 
 		 340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372704  normal  0.185401 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0783  hypothetical protein  37.91 
 
 		 365 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.930721  normal  0.646408 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0340  hypothetical protein  36.89 
 
 		 340 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0244  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 376 aa  121  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0956  hypothetical protein  35.97 
 
 		 349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0392869 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  26.79 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0915  hypothetical protein  27.3 
 
 		 346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  30.36 
 
 		 379 aa  116  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  29.41 
 
 		 372 aa  116  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2262  hypothetical protein  38.71 
 
 		 381 aa  112  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141033  normal  0.407022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1787  protein of unknown function UPF0118  40.88 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.190485  normal  0.0890558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1508  hypothetical protein  40.88 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0662165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1905  hypothetical protein  35.64 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.358826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1508  protein of unknown function UPF0118  40.33 
 
 		 395 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07661  permease  30.9 
 
 		 358 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0134  hypothetical protein  32 
 
 		 358 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07191  permease  27.78 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1078  protein of unknown function UPF0118  29.34 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  28.13 
 
 		 354 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  26.96 
 
 		 382 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  27.6 
 
 		 396 aa  94.4  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  25.31 
 
 		 340 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4585  putative transport protein/permease  34.46 
 
 		 382 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1195  hypothetical protein  36.82 
 
 		 329 aa  92.4  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2711  hypothetical protein  29.65 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.569285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3110  protein of unknown function UPF0118  30.46 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  32.29 
 
 		 369 aa  90.1  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0518  hypothetical protein  26.65 
 
 		 387 aa  90.1  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  35.6 
 
 		 371 aa  90.1  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  33.54 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1275  hypothetical protein  32.82 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1196  hypothetical protein  31.37 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  30.39 
 
 		 349 aa  87.8  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  30.96 
 
 		 371 aa  87  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4793  hypothetical protein  25.69 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3863  hypothetical protein  28.09 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.596541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2700  hypothetical protein  32.99 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0306531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2675  hypothetical protein  31.55 
 
 		 391 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.173775  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2235  hypothetical protein  29.33 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.55122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  24.78 
 
 		 348 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16401  permease  35.11 
 
 		 333 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.199558 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  24.78 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  24.78 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  24.78 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  24.78 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  24.78 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  24.34 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  24.35 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  24.78 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  24.34 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  28.48 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  34.04 
 
 		 436 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3369  protein of unknown function UPF0118  32.18 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2742  protein of unknown function UPF0118  32.18 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  unclonable  0.00000000268058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  25.23 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  28.42 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  30.06 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  30.59 
 
 		 390 aa  79.3  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0873  hypothetical protein  29.1 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.475897  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3407  hypothetical protein  28.61 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  23.42 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  21.63 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  32.47 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1751  hypothetical protein  36.76 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.903333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  36.5 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  24.49 
 
 		 368 aa  75.9  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  30.68 
 
 		 348 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2189  protein of unknown function UPF0118  31.92 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  28.86 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  34.1 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  30.26 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  28.8 
 
 		 384 aa  75.1  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09331  permease  28.04 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  31.5 
 
 		 435 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  33.04 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10101  permease  26.67 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09321  permease  28.04 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  25.85 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  25.25 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1029  hypothetical protein  26.46 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.951774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1010  hypothetical protein  26.46 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.389096  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  25.63 
 
 		 365 aa  72.8  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0602  hypothetical protein  28.33 
 
 		 361 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0876326  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  27.41 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0546  hypothetical protein  31.13 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  29.12 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  28.28 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16391  permease  35.11 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.216071 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  26.37 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  32.65 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  29.66 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  28.42 
 
 		 438 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>