269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2103 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2103  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 326 aa  649    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.678011 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3127  putative FecR  39.76 
 
 		 326 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.892412  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4834  transmembrane sensor  37.92 
 
 		 322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55540  transmembrane sensor  37.35 
 
 		 319 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2904  putative FecR  39.45 
 
 		 327 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.161194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2218  putative FecR  35.71 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0319287  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2218  Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  38.63 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3197  putative FecR  36.53 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0381932  hitchhiker  0.0038104 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1077  putative FecR  35.4 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428658  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2206  putative FecR  34.76 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.964925  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2213  putative FecR  38.11 
 
 		 325 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2233  putative FecR  33.74 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.761744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0481  putative FecR  34.59 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.133336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6087  anti-FecI sigma factor, FecR  35.91 
 
 		 332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  29.08 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  32.84 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  32.16 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  31.68 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  31.15 
 
 		 329 aa  100  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  29.05 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  29.72 
 
 		 330 aa  97.1  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  32.57 
 
 		 321 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  31.22 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0734  anti-FecI sigma factor, FecR  26.67 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721156 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  30.86 
 
 		 321 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  34.3 
 
 		 301 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  31.47 
 
 		 320 aa  92.4  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  35.02 
 
 		 331 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  28.85 
 
 		 320 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  28.35 
 
 		 321 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  27.24 
 
 		 334 aa  90.1  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1150  anti-FecI sigma factor, FecR  29.8 
 
 		 322 aa  90.1  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  30.06 
 
 		 324 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2727  anti-FecI sigma factor, FecR  28.25 
 
 		 325 aa  89.4  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  28.62 
 
 		 329 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  27.22 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  28.18 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  27.6 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  25.79 
 
 		 317 aa  86.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  26.4 
 
 		 337 aa  87  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  33.78 
 
 		 329 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  29.93 
 
 		 309 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  31.46 
 
 		 324 aa  86.7  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  28.28 
 
 		 327 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  31.46 
 
 		 324 aa  86.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  27.95 
 
 		 315 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  29.11 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  30.2 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0733  anti-FecI sigma factor, FecR  25.72 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  26.46 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  24.6 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  28.4 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  30.9 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  25.88 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  28.53 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  29.23 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  28.23 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  28.52 
 
 		 353 aa  82.4  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  33.02 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  29.35 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  30.15 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  26.44 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0691  anti-FecI sigma factor, FecR  30.75 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  29.65 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17700  anti-sigma factor, FecR family  29.21 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  26.9 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  28.07 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  29.01 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  29.65 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2195  anti-FecI sigma factor, FecR  30.66 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4217  anti-FecI sigma factor, FecR  31.73 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  27.94 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4484  anti-FecI sigma factor, FecR  26.22 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.656085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  29.82 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  27.97 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  27.98 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  27.42 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3576  anti-FecI sigma factor, FecR  30.55 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  28.03 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  28.76 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  27.9 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  28.48 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  27.78 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0873  anti-FecI sigma factor, FecR  27.55 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  27.1 
 
 		 351 aa  75.9  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  27.39 
 
 		 351 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  27.22 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  26.28 
 
 		 320 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1044  anti-FecI sigma factor, FecR  30.77 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  33.17 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  33.14 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  27.02 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4645  anti-FecI sigma factor, FecR  25.86 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  29.59 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  28.91 
 
 		 328 aa  72.4  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3438  anti-FecI sigma factor, FecR  30.46 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.454566  hitchhiker  0.00428994 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  29.6 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  28.43 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4367  anti-FecI sigma factor, FecR  26.94 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  30 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>