295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4645 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4645  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 325 aa  646    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0206  anti-FecI sigma factor, FecR  52.19 
 
 		 322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3438  anti-FecI sigma factor, FecR  48.75 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.454566  hitchhiker  0.00428994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1285  Fe2+-dicitrate sensor membrane component-like protein  37.5 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.914748 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  31.66 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1150  anti-FecI sigma factor, FecR  26.9 
 
 		 322 aa  125  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  29.52 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06170  putative transmembrane sensor  32.69 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.202236  normal  0.0195078 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  29.11 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3269  anti-FecI sigma factor, FecR  32.09 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  hitchhiker  0.00253082 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  30 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  29.43 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4612  FecR protein, putative  27.71 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  27.16 
 
 		 329 aa  112  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02240  anti-sigma factor, FecR family  32.02 
 
 		 320 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  29.49 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  28.84 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0577  putative transmembrane sensor  32.42 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  27.39 
 
 		 320 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  28.71 
 
 		 327 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  30.19 
 
 		 324 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  29.39 
 
 		 323 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4595  anti-FecI sigma factor, FecR  27.92 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  27.86 
 
 		 313 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  27.13 
 
 		 311 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0161  anti-FecI sigma factor, FecR  27.48 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  hitchhiker  0.0000661034 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17700  anti-sigma factor, FecR family  26.56 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  29.17 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  28.79 
 
 		 315 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  30.43 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0180  anti-FecI sigma factor, FecR  27.48 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  28.4 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  27.71 
 
 		 324 aa  102  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1208  regulatory protein, putative  27.19 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  28.21 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  28.48 
 
 		 327 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  28.74 
 
 		 328 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  29.04 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0179  anti-FecI sigma factor, FecR  27.27 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.424869  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0850  3-compartiment signal transduction system, component PRHR transmembrane protein  29.05 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.360715  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1050  putative FecR  27.8 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  30.67 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0703  anti-FecI sigma factor, FecR  25.8 
 
 		 316 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0737  anti-FecI sigma factor, FecR  26.23 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1421  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  28.75 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133192  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  29.43 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0019  FecR family protein  28.75 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32658  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0736  anti-FecI sigma factor, FecR  25.32 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4498  anti FecI sigma factor, regulatory protein iron uptake  26.84 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  normal  0.0499598 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1508  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  28.75 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4160  anti-FecI sigma factor, FecR  28.3 
 
 		 329 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2674  putative FecR  29.68 
 
 		 318 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249504  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3085  transmembrane sensor, putative  25.54 
 
 		 321 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04158  transmembrane signal transducer for ferric citrate transport  25.08 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3708  anti-FecI sigma factor, FecR  25.08 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04121  hypothetical protein  25.08 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  25.62 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0744  fec operon regulator FecR  25.08 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117429  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  28.18 
 
 		 335 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  27.66 
 
 		 323 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  27.13 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37420  putative transmembrane sensor protein  29.39 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0746  anti-FecI sigma factor, FecR  27.76 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4232  anti-FecI sigma factor, FecR  27.67 
 
 		 329 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0924  putative FecR  25.9 
 
 		 305 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  28.62 
 
 		 320 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  29.09 
 
 		 377 aa  92.8  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4367  anti-FecI sigma factor, FecR  27.67 
 
 		 329 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0694  anti-FecI sigma factor, FecR  27.71 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0379  anti-FecI sigma factor, FecR  27.65 
 
 		 318 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45013  normal  0.45289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  26.9 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4869  fec operon regulator FecR  25 
 
 		 317 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1382  FecR family protein  27.9 
 
 		 334 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00451744  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1934  anti-FecI sigma factor, FecR  28.12 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1181  FecR family protein  31.39 
 
 		 314 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  27.8 
 
 		 318 aa  90.9  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0140  FecR family protein  31.39 
 
 		 314 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0998258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0122  putative FecR  27.62 
 
 		 333 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.818445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  29.06 
 
 		 315 aa  90.1  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  26.56 
 
 		 315 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4851  anti-FecI sigma factor, FecR  28.43 
 
 		 318 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22640  Anti-sigma factor protein, FecR family  30.19 
 
 		 317 aa  90.1  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0878  putative FecR  25.97 
 
 		 330 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1360  putative FecR  25.97 
 
 		 330 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690627  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  26.21 
 
 		 317 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  28.53 
 
 		 340 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0419  FecR family protein  30.94 
 
 		 314 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0605  anti-FecI sigma factor, FecR  24.13 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  28.57 
 
 		 316 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0845  anti-FecI sigma factor, FecR  28.24 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  27.73 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4480  anti-FecI sigma factor, FecR  26.35 
 
 		 318 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.876181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  28.27 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0377  anti-FecI sigma factor, FecR  27.92 
 
 		 318 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44140  PupR/FecR-like anti-sigma factor protein  29.05 
 
 		 324 aa  87  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.272255  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  28.29 
 
 		 328 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0351  anti-FecI sigma factor, FecR  27.51 
 
 		 318 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.547847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  28.89 
 
 		 316 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  29.22 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0859  anti-FecI sigma factor, FecR  28.11 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>