184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1285 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1285  Fe2+-dicitrate sensor membrane component-like protein  100 
 
 		 327 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.914748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3438  anti-FecI sigma factor, FecR  38.76 
 
 		 327 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.454566  hitchhiker  0.00428994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4645  anti-FecI sigma factor, FecR  37.82 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0206  anti-FecI sigma factor, FecR  37.66 
 
 		 322 aa  186  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37420  putative transmembrane sensor protein  27.87 
 
 		 318 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1150  anti-FecI sigma factor, FecR  23.96 
 
 		 322 aa  102  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0737  anti-FecI sigma factor, FecR  25.49 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  27.78 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  28.52 
 
 		 316 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02240  anti-sigma factor, FecR family  26.42 
 
 		 320 aa  99  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0736  anti-FecI sigma factor, FecR  25.16 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  27.36 
 
 		 315 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  24.03 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22640  Anti-sigma factor protein, FecR family  27.64 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0703  anti-FecI sigma factor, FecR  25.16 
 
 		 316 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  23.47 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0850  3-compartiment signal transduction system, component PRHR transmembrane protein  30.06 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.360715  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17700  anti-sigma factor, FecR family  24.18 
 
 		 323 aa  90.5  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  26.13 
 
 		 320 aa  90.5  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  25.65 
 
 		 323 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06170  putative transmembrane sensor  26.95 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.202236  normal  0.0195078 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  24.69 
 
 		 329 aa  87  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  29.08 
 
 		 316 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2674  putative FecR  25.82 
 
 		 318 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4480  anti-FecI sigma factor, FecR  25.57 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.876181  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  24.44 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  25.57 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0577  putative transmembrane sensor  26.22 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  25.16 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1050  putative FecR  25.08 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  23.91 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  23.15 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  24.68 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  26.65 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  25.32 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  26.33 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6106  putative transmembrane sensor  27.63 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.655193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  24.35 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1225  FecR protein  20.2 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.615104  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  26.48 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  25.49 
 
 		 338 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  25.95 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4851  anti-FecI sigma factor, FecR  23.87 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  26.05 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  23.38 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  25.48 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  24.42 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2218  putative FecR  24.49 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0319287  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0734  anti-FecI sigma factor, FecR  23.91 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721156 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1733  FecR protein  28.12 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.204897 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  24.83 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  24.18 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  24.38 
 
 		 327 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  25.16 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  24.04 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0873  anti-FecI sigma factor, FecR  24.14 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0746  anti-FecI sigma factor, FecR  26.38 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37980  putative Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  24.29 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00265184  normal  0.0208679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  25.15 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0377  anti-FecI sigma factor, FecR  24.3 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0161  anti-FecI sigma factor, FecR  21.86 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  hitchhiker  0.0000661034 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01110  Anti-sigma factor, FecR family  25.17 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0884  putative FecR  27.99 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0379  anti-FecI sigma factor, FecR  22.12 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45013  normal  0.45289 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  29.68 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  25.57 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  22.32 
 
 		 313 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0351  anti-FecI sigma factor, FecR  24.6 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.547847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2581  FecR protein  24.92 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175988  normal  0.154477 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  27.24 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2396  putative FecR  29.1 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0170576  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  24.5 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  24.68 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0859  anti-FecI sigma factor, FecR  24.48 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  26.67 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  25.99 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  22.05 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  26.16 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  27.13 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  26.61 
 
 		 350 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  25.72 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3269  anti-FecI sigma factor, FecR  26.73 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  hitchhiker  0.00253082 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  26.88 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0180  anti-FecI sigma factor, FecR  21.22 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  35.14 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3085  transmembrane sensor, putative  24.76 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  22.01 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2218  Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  25.85 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  24.74 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  22.86 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  23.94 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4300  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  21.9 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.060712 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  25.82 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0122  putative FecR  22.33 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.818445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0694  anti-FecI sigma factor, FecR  23.28 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0179  anti-FecI sigma factor, FecR  21.86 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.424869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4217  anti-FecI sigma factor, FecR  23.96 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  25.85 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  23.61 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44140  PupR/FecR-like anti-sigma factor protein  26.6 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.272255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>