239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3438 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3438  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 327 aa  627  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.454566  hitchhiker  0.00428994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0206  anti-FecI sigma factor, FecR  55.38 
 
 		 322 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4645  anti-FecI sigma factor, FecR  48.75 
 
 		 325 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1285  Fe2+-dicitrate sensor membrane component-like protein  38.76 
 
 		 327 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.914748 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1150  anti-FecI sigma factor, FecR  29.75 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17700  anti-sigma factor, FecR family  33.33 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  31.58 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  31.58 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  32.39 
 
 		 316 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  32.05 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  33.12 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  31.96 
 
 		 324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06170  putative transmembrane sensor  33.43 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.202236  normal  0.0195078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4595  anti-FecI sigma factor, FecR  29.63 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  32.19 
 
 		 330 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0850  3-compartiment signal transduction system, component PRHR transmembrane protein  32.02 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.360715  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  29.18 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4612  FecR protein, putative  28.57 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  30.49 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  29.52 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  31.21 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02240  anti-sigma factor, FecR family  31.87 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  31.86 
 
 		 316 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22640  Anti-sigma factor protein, FecR family  33.55 
 
 		 317 aa  106  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  27.84 
 
 		 329 aa  106  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0746  anti-FecI sigma factor, FecR  30.93 
 
 		 314 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  30.82 
 
 		 313 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  30.61 
 
 		 323 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  29.91 
 
 		 320 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0736  anti-FecI sigma factor, FecR  30.45 
 
 		 318 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0737  anti-FecI sigma factor, FecR  29.17 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  31.52 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0703  anti-FecI sigma factor, FecR  30.48 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0577  putative transmembrane sensor  32.28 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3085  transmembrane sensor, putative  31.19 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37420  putative transmembrane sensor protein  30.56 
 
 		 318 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267456  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1208  regulatory protein, putative  27.52 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  27.91 
 
 		 319 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  30.65 
 
 		 327 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0744  fec operon regulator FecR  28.75 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117429  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  31.13 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04158  transmembrane signal transducer for ferric citrate transport  28.75 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3708  anti-FecI sigma factor, FecR  28.75 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.142917  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2581  FecR protein  29.13 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175988  normal  0.154477 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4869  fec operon regulator FecR  29.6 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  32.33 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04121  hypothetical protein  28.75 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  29.81 
 
 		 307 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  30.34 
 
 		 313 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  29.23 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1050  putative FecR  30.23 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  30.95 
 
 		 353 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  29.57 
 
 		 335 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  29.36 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  28.93 
 
 		 321 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0377  anti-FecI sigma factor, FecR  31.35 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  30.7 
 
 		 317 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0379  anti-FecI sigma factor, FecR  32.72 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45013  normal  0.45289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  29.5 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0859  anti-FecI sigma factor, FecR  32.18 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4480  anti-FecI sigma factor, FecR  28.3 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.876181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0845  anti-FecI sigma factor, FecR  30.89 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1039  FecR protein  27.5 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.278865 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0019  FecR family protein  29.47 
 
 		 334 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32658  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1421  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  29.47 
 
 		 334 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133192  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1508  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  29.47 
 
 		 334 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4367  anti-FecI sigma factor, FecR  27.08 
 
 		 329 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0122  putative FecR  27.08 
 
 		 333 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.818445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4160  anti-FecI sigma factor, FecR  27.08 
 
 		 329 aa  92.4  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  31.72 
 
 		 324 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0351  anti-FecI sigma factor, FecR  31.25 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.547847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  30.79 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  29.08 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0694  anti-FecI sigma factor, FecR  29.39 
 
 		 318 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3562  anti-FecI sigma factor, FecR  28.8 
 
 		 323 aa  90.5  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.252432  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  30 
 
 		 320 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  28.96 
 
 		 327 aa  89.7  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0668  transmembrane sensor, putative  27.69 
 
 		 321 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4851  anti-FecI sigma factor, FecR  30.77 
 
 		 318 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4232  anti-FecI sigma factor, FecR  26.46 
 
 		 329 aa  89.4  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  27.95 
 
 		 311 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  28.21 
 
 		 315 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1382  FecR family protein  28.39 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00451744  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  29.32 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1733  FecR protein  32.23 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.204897 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4498  anti FecI sigma factor, regulatory protein iron uptake  26.96 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  normal  0.0499598 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  29.85 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0605  anti-FecI sigma factor, FecR  27.5 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  28.62 
 
 		 328 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  29.11 
 
 		 301 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  30.23 
 
 		 340 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  28.57 
 
 		 314 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  29.04 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3269  anti-FecI sigma factor, FecR  30.79 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  hitchhiker  0.00253082 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1934  anti-FecI sigma factor, FecR  32.1 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  31.94 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2674  putative FecR  30.52 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  28.31 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4300  sigma factor regulatory protein FecR/PupR family  23.17 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.060712 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0895  FecR protein  27.3 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.281234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>