236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_37420 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_37420  putative transmembrane sensor protein  100 
 
 		 318 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  40.51 
 
 		 315 aa  209  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37980  putative Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  40.78 
 
 		 317 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00265184  normal  0.0208679 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1150  anti-FecI sigma factor, FecR  32.8 
 
 		 322 aa  162  8.000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  34.54 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22640  Anti-sigma factor protein, FecR family  38.24 
 
 		 317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  34.7 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  30.22 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3272  anti-FecI sigma factor, FecR  33.64 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  31.76 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0737  anti-FecI sigma factor, FecR  31.13 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  31.35 
 
 		 317 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  31.61 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17700  anti-sigma factor, FecR family  32.35 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0736  anti-FecI sigma factor, FecR  31.15 
 
 		 318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0379  anti-FecI sigma factor, FecR  32.21 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45013  normal  0.45289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3269  anti-FecI sigma factor, FecR  32.73 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  hitchhiker  0.00253082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02240  anti-sigma factor, FecR family  34.06 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0351  anti-FecI sigma factor, FecR  32.72 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.547847  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0703  anti-FecI sigma factor, FecR  31.78 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  31.76 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  29.47 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0850  3-compartiment signal transduction system, component PRHR transmembrane protein  32.72 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.360715  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4851  anti-FecI sigma factor, FecR  32.23 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  32.92 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0377  anti-FecI sigma factor, FecR  30.96 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  33.13 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4595  anti-FecI sigma factor, FecR  32.06 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  31.72 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01110  Anti-sigma factor, FecR family  32.91 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06170  putative transmembrane sensor  31.48 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.202236  normal  0.0195078 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  28.71 
 
 		 318 aa  106  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  32.5 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  30.4 
 
 		 327 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0668  transmembrane sensor, putative  28.92 
 
 		 321 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  30.03 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4480  anti-FecI sigma factor, FecR  28.71 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.876181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5452  putative FecR  30.79 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  29.7 
 
 		 330 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4612  FecR protein, putative  30.25 
 
 		 308 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1050  putative FecR  27.36 
 
 		 318 aa  99.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3275  anti-FecI sigma factor, FecR  28.44 
 
 		 327 aa  99.4  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  29.21 
 
 		 320 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4232  anti-FecI sigma factor, FecR  26.32 
 
 		 329 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0691  anti-FecI sigma factor, FecR  30.06 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  28.75 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  28.83 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3438  anti-FecI sigma factor, FecR  30.56 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.454566  hitchhiker  0.00428994 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  26.88 
 
 		 323 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  30.03 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4367  anti-FecI sigma factor, FecR  26.32 
 
 		 329 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4160  anti-FecI sigma factor, FecR  26.32 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1285  Fe2+-dicitrate sensor membrane component-like protein  26.32 
 
 		 327 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.914748 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  28.35 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3085  transmembrane sensor, putative  27.5 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4645  anti-FecI sigma factor, FecR  29.39 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  31.91 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0924  putative FecR  26.77 
 
 		 305 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0746  anti-FecI sigma factor, FecR  29.5 
 
 		 314 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  27.83 
 
 		 327 aa  93.6  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0694  anti-FecI sigma factor, FecR  29.01 
 
 		 318 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  27.8 
 
 		 311 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  29.57 
 
 		 327 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2674  putative FecR  31.86 
 
 		 318 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  31.08 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  33.49 
 
 		 323 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0577  putative transmembrane sensor  30.5 
 
 		 323 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0179  anti-FecI sigma factor, FecR  27.18 
 
 		 318 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.424869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1039  FecR protein  28.3 
 
 		 325 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.278865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  27.11 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0180  anti-FecI sigma factor, FecR  26.05 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4484  anti-FecI sigma factor, FecR  30.72 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.656085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  30.43 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0161  anti-FecI sigma factor, FecR  25.72 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.39146  hitchhiker  0.0000661034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  27.36 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0122  putative FecR  27.5 
 
 		 333 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.818445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1382  FecR family protein  30.48 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00451744  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2581  FecR protein  27.02 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175988  normal  0.154477 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28980  Fe2+-dicitrate sensor  30.48 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419388 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1934  anti-FecI sigma factor, FecR  29.5 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2338  anti-FecI sigma factor, FecR  32.24 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0206  anti-FecI sigma factor, FecR  29.58 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0878  putative FecR  27.07 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1360  putative FecR  27.07 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690627  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  24.53 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  30.06 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6106  putative transmembrane sensor  28.44 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.655193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0733  anti-FecI sigma factor, FecR  30.03 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  29.79 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0734  anti-FecI sigma factor, FecR  28.71 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721156 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0605  anti-FecI sigma factor, FecR  26.79 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  29.75 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2195  anti-FecI sigma factor, FecR  31.21 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67028  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1208  regulatory protein, putative  29.21 
 
 		 325 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0859  anti-FecI sigma factor, FecR  26.38 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3576  anti-FecI sigma factor, FecR  30.87 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0873  anti-FecI sigma factor, FecR  24.04 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  29.75 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  23.1 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0845  anti-FecI sigma factor, FecR  27.3 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>