273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1077 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1077  putative FecR  100 
 
 
331 aa  662    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428658  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55540  transmembrane sensor  42.07 
 
 
319 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3127  putative FecR  41.12 
 
 
326 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.892412  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4834  transmembrane sensor  41.46 
 
 
322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2206  putative FecR  38.94 
 
 
328 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.964925  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2233  putative FecR  38.32 
 
 
327 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.761744  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2904  putative FecR  36.66 
 
 
327 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.161194 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2218  Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  39.13 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108208  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3197  putative FecR  37.43 
 
 
312 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0381932  hitchhiker  0.0038104 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0481  putative FecR  36.56 
 
 
327 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.133336  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2218  putative FecR  34.94 
 
 
322 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0319287  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2213  putative FecR  39.04 
 
 
325 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2103  anti-FecI sigma factor, FecR  36.05 
 
 
326 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.678011 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  32.61 
 
 
315 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  29.07 
 
 
321 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  29.62 
 
 
319 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6087  anti-FecI sigma factor, FecR  29.77 
 
 
332 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223277  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  25.75 
 
 
350 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  29.65 
 
 
324 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  32 
 
 
318 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  31.53 
 
 
353 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  29.34 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  30.29 
 
 
327 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  30.29 
 
 
320 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  29.36 
 
 
328 aa  93.2  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  29.94 
 
 
327 aa  92.4  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  28.97 
 
 
320 aa  92.4  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  28.66 
 
 
326 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  26.96 
 
 
311 aa  90.9  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  28.98 
 
 
329 aa  89.7  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  29.21 
 
 
323 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  30.86 
 
 
329 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  30.95 
 
 
328 aa  89  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 
326 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0691  anti-FecI sigma factor, FecR  31.48 
 
 
332 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2674  putative FecR  34.52 
 
 
318 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249504  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  28.57 
 
 
320 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  28.4 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  30.99 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  29.39 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  29.8 
 
 
374 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  29.82 
 
 
313 aa  86.3  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3085  transmembrane sensor, putative  29.43 
 
 
321 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  28.36 
 
 
337 aa  85.9  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4484  anti-FecI sigma factor, FecR  26.16 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.656085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  27.44 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  27.83 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  27.74 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  31.07 
 
 
316 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  29.51 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  29.14 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  29.68 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  29.39 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5618  putative transmembrane sensor  29.09 
 
 
340 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.680128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  28.84 
 
 
340 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  30.99 
 
 
274 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4000  FecR-like transmembrane sensor, Fe2+-dicitrate sensor  29.55 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0775508  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2076  anti-FecI sigma factor, FecR  29.34 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  30.35 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2142  FecR protein  27.57 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0332173  normal  0.0487008 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0850  3-compartiment signal transduction system, component PRHR transmembrane protein  28.33 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.360715  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  26.46 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  25.6 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  30.42 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0689  anti-FecI sigma factor, FecR  26.1 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  26.15 
 
 
320 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  26.9 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  27.67 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0122  putative FecR  27.13 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.818445  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  30.22 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  26.91 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4217  anti-FecI sigma factor, FecR  27.3 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  25.44 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  22.67 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  30.98 
 
 
314 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  28.44 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  31.23 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  27.61 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  30.57 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1208  regulatory protein, putative  25.24 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  29.1 
 
 
320 aa  77  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  27.78 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  26.78 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0379  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45013  normal  0.45289 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  28.43 
 
 
335 aa  76.3  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2219  anti-FecI sigma factor, FecR  28.49 
 
 
335 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1039  FecR protein  29.35 
 
 
325 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.278865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0924  putative FecR  25.41 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  26.49 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  27.31 
 
 
328 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  26.61 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3555  anti-FecI sigma factor, FecR  28.88 
 
 
335 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170441  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  27.87 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  27.57 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0733  anti-FecI sigma factor, FecR  22.98 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0878  putative FecR  29.96 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1360  putative FecR  29.96 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690627  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  26.53 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  22.7 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  27.08 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>