More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0792 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0792  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.307783 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3825  hypothetical protein  64.22 
 
 		 249 aa  296  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1747  diguanylate phosphodiesterase  59.46 
 
 		 291 aa  280  1e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.087315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2810  diguanylate phosphodiesterase  59.35 
 
 		 257 aa  254  9e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0525  diguanylate phosphodiesterase  57.01 
 
 		 251 aa  248  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3442  diguanylate phosphodiesterase  54.79 
 
 		 254 aa  242  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0264  diguanylate phosphodiesterase  55.76 
 
 		 259 aa  239  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317431 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1172  diguanylate phosphodiesterase  57.14 
 
 		 258 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0914  EAL domain-containing protein  54.3 
 
 		 256 aa  239  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1233  diguanylate phosphodiesterase  56.68 
 
 		 258 aa  238  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1584  diguanylate phosphodiesterase  55.96 
 
 		 263 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0237519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1247  hypothetical protein  52.27 
 
 		 257 aa  236  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000126257  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1408  diguanylate phosphodiesterase  57.92 
 
 		 332 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.939193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0637  hypothetical protein  52.73 
 
 		 257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00815017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3232  diguanylate phosphodiesterase  53.39 
 
 		 266 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72536  normal  0.33635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0236  EAL domain protein  53.18 
 
 		 260 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0171  EAL  52.73 
 
 		 260 aa  228  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0005  diguanylate phosphodiesterase  52.44 
 
 		 259 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3242  EAL domain-containing protein  51.79 
 
 		 283 aa  226  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3566  diguanylate phosphodiesterase  51.79 
 
 		 265 aa  225  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333064  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0806  signal protein  53.42 
 
 		 257 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3438  diguanylate phosphodiesterase  51.35 
 
 		 265 aa  222  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4934  diguanylate phosphodiesterase  48.64 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000539515  normal  0.673945 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0028  diguanylate phosphodiesterase  47.53 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2934  diguanylate phosphodiesterase  52.73 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.780718  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3107  diguanylate phosphodiesterase  51.36 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.757565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0026  diguanylate phosphodiesterase  48.85 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0024  diguanylate phosphodiesterase  48.85 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.481277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2208  diguanylate phosphodiesterase  49.32 
 
 		 254 aa  208  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1902  diguanylate phosphodiesterase  47.51 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.570063 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0883  diguanylate phosphodiesterase  46.88 
 
 		 262 aa  205  4e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0541  diguanylate phosphodiesterase  48.18 
 
 		 257 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3798  diguanylate phosphodiesterase  47.27 
 
 		 257 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0601  diguanylate phosphodiesterase  47.73 
 
 		 258 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0545  diguanylate phosphodiesterase  47.27 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0519  diguanylate phosphodiesterase  47.27 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2342  diguanylate phosphodiesterase  46.88 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2731  putative diguanylate phosphodiesterase  47.44 
 
 		 259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1965  diguanylate phosphodiesterase  47.39 
 
 		 248 aa  181  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2830  diguanylate phosphodiesterase  44.29 
 
 		 253 aa  177  8e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.011956  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3093  cyclic-di-GMP regulatory protein  41.46 
 
 		 239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0272737 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0706  diguanylate phosphodiesterase  37.44 
 
 		 356 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.578959  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1073  diguanylate phosphodiesterase  38.83 
 
 		 367 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0467  EAL domain protein  35.12 
 
 		 351 aa  136  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0116221  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0635  diguanylate phosphodiesterase  39.51 
 
 		 340 aa  135  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2318  diguanylate phosphodiesterase  35.71 
 
 		 371 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440144  normal  0.199138 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2042  diguanylate phosphodiesterase  34.11 
 
 		 352 aa  126  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0220  hypothetical protein  33.66 
 
 		 362 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1138  diguanylate phosphodiesterase  40.1 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0220  hypothetical protein  33.66 
 
 		 360 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0058  diguanylate phosphodiesterase  36.92 
 
 		 357 aa  122  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  32.38 
 
 		 734 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84548  normal  0.140102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2663  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.29 
 
 		 753 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2032  diguanylate phosphodiesterase  33.17 
 
 		 406 aa  112  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.41 
 
 		 572 aa  112  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00175  hypothetical protein ycgF  32.14 
 
 		 390 aa  111  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3724  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.97 
 
 		 580 aa  109  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0883602  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0705  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.93 
 
 		 590 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.62 
 
 		 590 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.81 
 
 		 632 aa  105  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1210  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.82 
 
 		 797 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.489928 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1757  diguanylate phosphodiesterase  32.68 
 
 		 418 aa  105  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388257  hitchhiker  0.000204445 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.29 
 
 		 605 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.396651  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1310  diguanylate phosphodiesterase  35.41 
 
 		 306 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.016111  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0699  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.9 
 
 		 633 aa  102  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1718  diguanylate phosphodiesterase  35.1 
 
 		 379 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0187822  normal  0.029577 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0617  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.85 
 
 		 883 aa  101  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427205 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.48 
 
 		 599 aa  101  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3153  putative diguanylate phosphodiesterase  33.97 
 
 		 584 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.920716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1510  diguanylate phosphodiesterase  33.49 
 
 		 475 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4001  diguanylate phosphodiesterase  34.62 
 
 		 357 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838727  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  32.06 
 
 		 584 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.01 
 
 		 585 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.01 
 
 		 585 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000868734  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.01 
 
 		 585 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.54 
 
 		 581 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.01 
 
 		 585 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3475  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.68 
 
 		 583 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.54 
 
 		 584 aa  99  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.68 
 
 		 583 aa  99  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.54 
 
 		 584 aa  98.2  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2484  diguanylate phosphodiesterase  32.84 
 
 		 403 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1259  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  32.84 
 
 		 403 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2463  diguanylate phosphodiesterase  32.84 
 
 		 403 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.537462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1303  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  32.84 
 
 		 403 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01138  predicted FAD-binding phosphodiesterase  32.84 
 
 		 403 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1986  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  32.84 
 
 		 403 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.758889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01146  hypothetical protein  32.84 
 
 		 403 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.29 
 
 		 584 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  34.33 
 
 		 592 aa  96.3  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  33.82 
 
 		 601 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0421  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.37 
 
 		 574 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0595  sensory box/GGDEF family protein  29.91 
 
 		 567 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0539  sensory box, GGDEF family protein  29.91 
 
 		 567 aa  92.8  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0539  sensory box, GGDEF family protein  29.91 
 
 		 567 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0683  sensory box/GGDEF family protein  29.91 
 
 		 567 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00619208 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0541  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.91 
 
 		 567 aa  92.8  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0628  sensory box/GGDEF family protein  29.91 
 
 		 567 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1358  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.73 
 
 		 723 aa  92.8  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.48099  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1194  hypothetical protein  29.9 
 
 		 284 aa  92.8  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.603137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>