More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0564 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 285 aa  583  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  59.3 
 
 		 343 aa  362  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 326 aa  341  8e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  58.91 
 
 		 332 aa  336  1.9999999999999998e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  59.93 
 
 		 327 aa  335  5e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  52 
 
 		 344 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  53.55 
 
 		 341 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  48.04 
 
 		 331 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 330 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 330 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0974  helix-turn-helix domain-containing protein  43.44 
 
 		 314 aa  226  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  42.74 
 
 		 320 aa  223  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  39.91 
 
 		 325 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  40.35 
 
 		 340 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  34.56 
 
 		 336 aa  176  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 321 aa  176  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 347 aa  175  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.33 
 
 		 326 aa  175  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2398  cyclic nucleotide-binding protein  42.48 
 
 		 355 aa  172  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00401511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 324 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 324 aa  170  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  36.24 
 
 		 336 aa  169  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 326 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.48 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  33.63 
 
 		 324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  32 
 
 		 329 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1772  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.81 
 
 		 293 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0120296 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  35.23 
 
 		 331 aa  165  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1705  helix-turn-helix domain-containing protein  31.89 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  35.1 
 
 		 331 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 334 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  34.63 
 
 		 351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  34.73 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 326 aa  162  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 332 aa  162  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  33.85 
 
 		 334 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  39.02 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0442  hypothetical protein  34.51 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  33.85 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.8 
 
 		 327 aa  159  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 319 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  35.5 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  32.95 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 		 360 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  40.09 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  34.05 
 
 		 361 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1229  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.98 
 
 		 327 aa  155  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  32.59 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  32.41 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 347 aa  153  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  36.24 
 
 		 347 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1489  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.32 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.616641 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  37.6 
 
 		 320 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  35.78 
 
 		 347 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  37.33 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  35.37 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 334 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 323 aa  149  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 387 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  36.05 
 
 		 328 aa  148  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  28.63 
 
 		 326 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  31.85 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.12 
 
 		 325 aa  146  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  35.34 
 
 		 321 aa  146  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  33.08 
 
 		 332 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.81 
 
 		 338 aa  145  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 335 aa  144  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  35.5 
 
 		 338 aa  144  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  34.93 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  36.28 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 348 aa  143  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 338 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 325 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 344 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 347 aa  143  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  34.19 
 
 		 329 aa  143  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  36.24 
 
 		 349 aa  142  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 316 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  33.62 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3556  transcriptional regulator  36.29 
 
 		 319 aa  142  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253425 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  34.6 
 
 		 344 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>