More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0505 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0505  protein-export membrane protein SecF  100 
 
 
333 aa  667    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0158635  hitchhiker  0.00187348 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3325  protein-export membrane protein SecF  66.87 
 
 
324 aa  425  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3983  protein-export membrane protein SecF  65.94 
 
 
324 aa  424  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586193  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3103  protein-export membrane protein SecF  56.1 
 
 
322 aa  333  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0080  protein-export membrane protein SecF  46.85 
 
 
317 aa  275  9e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0332  preprotein translocase subunit SecF  39.5 
 
 
301 aa  219  5e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.496269  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_274  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecF subunit  39.18 
 
 
302 aa  219  5e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00850837  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1271  preprotein translocase subunit SecF  42.9 
 
 
296 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1124  preprotein translocase subunit SecF  39.61 
 
 
291 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0312  preprotein translocase subunit SecF  38.56 
 
 
301 aa  216  5e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  33.74 
 
 
735 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2885  preprotein translocase subunit SecF  37.03 
 
 
310 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5076  preprotein translocase subunit SecF  35.42 
 
 
328 aa  186  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1670  preprotein translocase subunit SecF  39.54 
 
 
292 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00270917  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3211  preprotein translocase subunit SecF  35.76 
 
 
310 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.828599  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1355  preprotein translocase subunit SecF  35.54 
 
 
293 aa  176  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12250  protein-export membrane protein SecF  36.16 
 
 
286 aa  175  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000312155  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1489  preprotein translocase subunit SecF  35.33 
 
 
325 aa  172  9e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.921272  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1690  preprotein translocase subunit SecF  37.76 
 
 
310 aa  169  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.113213  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1424  preprotein translocase subunit SecF  37.42 
 
 
280 aa  169  7e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000449698  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  35.35 
 
 
761 aa  169  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4538  protein-export membrane protein SecF  36.71 
 
 
320 aa  169  9e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0935  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.81 
 
 
750 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1027  preprotein translocase subunit SecF  33.12 
 
 
312 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0198826 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4258  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35 
 
 
755 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0141  preprotein translocase subunit SecF  34.81 
 
 
314 aa  151  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4144  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.13 
 
 
754 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4491  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.13 
 
 
754 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000282789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  33.77 
 
 
989 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4545  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.49 
 
 
754 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.49 
 
 
754 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4306  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.18 
 
 
754 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4641  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.18 
 
 
754 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1719  preprotein translocase subunit SecF  34.19 
 
 
302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  34.64 
 
 
977 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0705  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.87 
 
 
754 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.52 
 
 
750 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4155  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.18 
 
 
754 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4530  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.54 
 
 
754 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.566924  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2256  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.94 
 
 
991 aa  145  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.09 
 
 
911 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0537  protein-export membrane protein SecF  30.59 
 
 
327 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000416815  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5129  preprotein translocase subunit SecF  35.38 
 
 
336 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.642857  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  29.36 
 
 
323 aa  142  5e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2616  preprotein translocase subunit SecF  34.13 
 
 
302 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0008  preprotein translocase subunit SecF  32.61 
 
 
311 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748405  normal  0.104556 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0013  preprotein translocase subunit SecF  33.75 
 
 
309 aa  142  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245212 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1727  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.69 
 
 
759 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.347489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.69 
 
 
759 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  33.33 
 
 
748 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0014  preprotein translocase subunit SecF  32.81 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00246116  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  32.02 
 
 
307 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1216  protein-export membrane protein SecF  34.75 
 
 
291 aa  140  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0233184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1463  preprotein translocase subunit SecF  35.37 
 
 
303 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000137336  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3127  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.47 
 
 
752 aa  139  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1201  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.92 
 
 
763 aa  139  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.732454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0855  preprotein translocase subunit SecF  31.8 
 
 
302 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  37.03 
 
 
315 aa  138  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2101  protein-export membrane protein SecF  33.43 
 
 
308 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116132  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2737  protein-export membrane protein SecF  32.44 
 
 
308 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.468895  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2432  preprotein translocase subunit SecF  33.22 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.604218  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1797  preprotein translocase subunit SecF  30.89 
 
 
307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1415  preprotein translocase subunit SecF  34.56 
 
 
330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661465  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  36.8 
 
 
313 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1785  preprotein translocase subunit SecF  32.16 
 
 
301 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00817769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.4 
 
 
756 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3993  preprotein translocase subunit SecF  31.38 
 
 
316 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117459  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.43 
 
 
995 aa  135  8e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  36.06 
 
 
315 aa  135  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1117  preprotein translocase subunit SecF  36.03 
 
 
316 aa  135  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  33.1 
 
 
1029 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  35.84 
 
 
900 aa  135  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.27 
 
 
990 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1603  protein-export membrane protein SecF  32.15 
 
 
290 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.232098  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  31.38 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  36.56 
 
 
855 aa  134  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  34.96 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0626  protein-export membrane protein SecF  31.41 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000549124  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  30.36 
 
 
305 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  30.36 
 
 
305 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  29.22 
 
 
323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2836  protein translocase subunit secF  35.37 
 
 
302 aa  133  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  32.56 
 
 
306 aa  132  6.999999999999999e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.87 
 
 
856 aa  132  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  37.17 
 
 
316 aa  132  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2443  preprotein translocase subunit SecF  29.01 
 
 
347 aa  132  9e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000105757  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.83 
 
 
995 aa  132  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0027  preprotein translocase subunit SecF  32.09 
 
 
310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  31.51 
 
 
316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0997  preprotein translocase subunit SecF  31.97 
 
 
322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1312  preprotein translocase subunit SecF  32.9 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  29.85 
 
 
323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1289  preprotein translocase subunit SecF  32.47 
 
 
304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000106623  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1238  preprotein translocase subunit SecF  32.47 
 
 
304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132934  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1219  preprotein translocase subunit SecF  34.46 
 
 
314 aa  130  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.417925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4310  protein-export membrane protein SecF  29.17 
 
 
357 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  31.16 
 
 
316 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1162  preprotein translocase subunit SecF  31.51 
 
 
313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2811  preprotein translocase subunit SecF  30.61 
 
 
323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2570  preprotein translocase subunit SecF  31.51 
 
 
313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>