More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0311 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0311  periplasmic binding protein  100 
 
 		 304 aa  606  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0241  periplasmic binding protein  49.49 
 
 		 310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3093  periplasmic binding protein  51.36 
 
 		 297 aa  271  7e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712568 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2939  periplasmic binding protein  50.68 
 
 		 297 aa  267  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0108677  hitchhiker  0.00600632 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3164  periplasmic binding protein  50.52 
 
 		 309 aa  266  5e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0831  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  48.12 
 
 		 309 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.3337 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1852  periplasmic binding protein  41.91 
 
 		 309 aa  255  6e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.416782  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3425  putative iron transport system substrate-binding protein  42.91 
 
 		 310 aa  249  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2945  putative iron transport system substrate-binding protein  40.2 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3494  periplasmic binding protein  45.95 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1084  periplasmic binding protein  43.43 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0139725  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3943  periplasmic binding protein  39.86 
 
 		 309 aa  236  5.0000000000000005e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979003 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3141  substrate-binding protein of ABC transporter  40.45 
 
 		 308 aa  234  9e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1767  putative periplasmic substrate-binding protein  45.05 
 
 		 296 aa  231  8.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1533  hypothetical protein  40.84 
 
 		 350 aa  223  4e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0278  periplasmic binding protein  45.05 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.10405  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0976  periplasmic binding protein  34.93 
 
 		 308 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0429383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4139  putative periplasmic substrate-binding protein  44.59 
 
 		 318 aa  203  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0990029 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1836  periplasmic binding protein  41.22 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0957  periplasmic binding protein  42.41 
 
 		 282 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00790982  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0233  putative periplasmic substrate-binding protein  39.31 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35058  predicted protein  31.53 
 
 		 672 aa  140  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  30.51 
 
 		 351 aa  119  9e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  29.63 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  29.63 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  29.57 
 
 		 338 aa  112  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35596  ABC(binding protein) family transporter: iron compound  35.8 
 
 		 207 aa  110  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.076386 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 337 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  29.63 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  31.19 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  32.54 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  30.27 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  30 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  30 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  27.96 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  29.37 
 
 		 517 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  33.1 
 
 		 287 aa  103  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1304  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 293 aa  102  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  24.49 
 
 		 341 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  26.87 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2879  periplasmic binding protein  28.47 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3024  periplasmic binding protein  28.62 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  26.42 
 
 		 318 aa  99.8  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  25.6 
 
 		 331 aa  99.8  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1960  periplasmic binding protein  29.47 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137759  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  25.25 
 
 		 315 aa  98.2  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  24.34 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  25.57 
 
 		 379 aa  97.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  26 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  25.91 
 
 		 318 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  28.14 
 
 		 293 aa  96.3  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1119  periplasmic binding protein  28.52 
 
 		 270 aa  95.9  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00373301  normal  0.860622 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0137  periplasmic binding protein  27.21 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4715  periplasmic binding protein  30.48 
 
 		 264 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1216  periplasmic binding protein  25.95 
 
 		 312 aa  93.2  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1523  periplasmic binding protein  26.28 
 
 		 299 aa  92.8  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.137922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  26.78 
 
 		 289 aa  90.9  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  30.03 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  24.67 
 
 		 363 aa  88.2  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2656  periplasmic binding protein  29.59 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.76 
 
 		 304 aa  87.4  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0995  periplasmic binding protein  25.35 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  26.55 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.4 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2491  periplasmic binding protein  28.62 
 
 		 261 aa  87.4  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  27.3 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  25.57 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1112  periplasmic binding protein  24.91 
 
 		 293 aa  87  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  25.17 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3615  periplasmic binding protein  32.78 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1499  periplasmic binding protein  29.49 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5271  periplasmic binding protein  29.35 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  24.92 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0602  iron/cobalamin ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.19 
 
 		 258 aa  82  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1145  periplasmic binding protein  29.35 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.676996  normal  0.936441 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  26.53 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0840  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  29.17 
 
 		 339 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154461  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3547  periplasmic binding protein  32.12 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  25.5 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2652  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  27.03 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  28.28 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0151  periplasmic binding protein  22.9 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0266  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  22.6 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1041  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  27.78 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4146  periplasmic binding protein  26.87 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0746656  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1959  hypothetical protein  25.61 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1196  putaive vitamin B12 transport protein  27.78 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3106  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compount-binding protein, putative  27.65 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0632  periplasmic binding protein  24.5 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  24.17 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0647  periplasmic binding protein  24.5 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3574  periplasmic binding protein  33.11 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136612 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2320  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  27.43 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169217  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0693  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  27.43 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2967  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  27.43 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956046  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0904  putative substrate-binding protein  30.61 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  29.79 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1632  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  27.43 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3464  periplasmic binding protein  32.44 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328176  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0419  periplasmic binding protein  27.33 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.892372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>