More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8291 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 480 aa  931    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  46.35 
 
 		 492 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  47.97 
 
 		 486 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  46.59 
 
 		 484 aa  322  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 555 aa  313  4.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  41.06 
 
 		 481 aa  311  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  45.01 
 
 		 494 aa  307  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  41.04 
 
 		 488 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6465  transporter  41.55 
 
 		 484 aa  292  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265131  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  37.3 
 
 		 492 aa  290  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  37.44 
 
 		 480 aa  279  7e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  38.62 
 
 		 493 aa  276  5e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  39.24 
 
 		 477 aa  276  8e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2726  major facilitator transporter  38.33 
 
 		 484 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5462  major facilitator superfamily MFS_1  36.5 
 
 		 528 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1118  major facilitator transporter  39.14 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.93 
 
 		 502 aa  271  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  38.14 
 
 		 630 aa  269  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6286  major facilitator transporter  38.72 
 
 		 493 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  39.51 
 
 		 509 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.88 
 
 		 583 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6454  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 493 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6689  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 493 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3421  major facilitator superfamily MFS_1  42.32 
 
 		 488 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1465  major facilitator transporter  39.01 
 
 		 473 aa  263  4.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.31 
 
 		 564 aa  261  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5344  membrane efflux protein  40.17 
 
 		 503 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1114  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 486 aa  260  4e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.90955  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1147  major facilitator superfamily drug efflux transporter  37.23 
 
 		 516 aa  260  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777739  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5108  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 		 480 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.099358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3500  major facilitator superfamily MFS_1  36.57 
 
 		 513 aa  249  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.021178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 		 524 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4177  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 486 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4699  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 486 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0738  major facilitator superfamily transporter  38.48 
 
 		 488 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2572  major facilitator superfamily MFS_1  40.49 
 
 		 505 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000778794  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3574  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 514 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4793  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 514 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3808  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 487 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49982  hitchhiker  0.00947833 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5489  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 486 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157895 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0918  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 486 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3597  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 		 488 aa  240  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0748  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 480 aa  236  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  34.51 
 
 		 483 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1308  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 		 459 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.845167 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15790  arabinose efflux permease family protein  36.84 
 
 		 481 aa  231  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.267513  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3275  major facilitator superfamily MFS_1  39.42 
 
 		 467 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5462  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 491 aa  229  8e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3532  major facilitator superfamily MFS_1  34.7 
 
 		 480 aa  228  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.602824 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  36.21 
 
 		 485 aa  226  7e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  33.65 
 
 		 471 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5456  major facilitator transporter  36.76 
 
 		 505 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2393  major facilitator transporter  35.17 
 
 		 481 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.74684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3405  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 471 aa  215  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00287902  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2963  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 512 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0316634  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.52 
 
 		 609 aa  213  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 		 504 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.05 
 
 		 478 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.82 
 
 		 522 aa  210  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.84 
 
 		 522 aa  209  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2726  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.78 
 
 		 500 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2788  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 		 487 aa  208  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2459  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 		 516 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.13 
 
 		 478 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2596  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.31 
 
 		 527 aa  206  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  31.07 
 
 		 476 aa  206  7e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10400  arabinose efflux permease family protein  33.71 
 
 		 489 aa  206  8e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0449426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 518 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.18 
 
 		 487 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3267  major facilitator superfamily MFS_1  35.5 
 
 		 471 aa  206  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533145  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0775  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 470 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.589082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  34.64 
 
 		 479 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.96 
 
 		 493 aa  204  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 		 478 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 471 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 478 aa  203  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 484 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2542  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 481 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000721597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2551  major facilitator superfamily MFS_1  37.95 
 
 		 477 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3894  major facilitator superfamily MFS_1  35.88 
 
 		 490 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.925451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1720  major facilitator transporter  37.36 
 
 		 473 aa  200  5e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.50289  normal  0.409594 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1430  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 480 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164938 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2701  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 		 503 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417248  normal  0.482514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2644  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 		 484 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.24 
 
 		 498 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3947  transporter  38.26 
 
 		 478 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000887257  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2045  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 506 aa  195  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.706094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 486 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 486 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 486 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 486 aa  195  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 486 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 486 aa  195  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.51 
 
 		 627 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2727  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 		 480 aa  194  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254035  normal  0.0453681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.02 
 
 		 478 aa  193  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  33.94 
 
 		 467 aa  193  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.73 
 
 		 528 aa  192  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.07 
 
 		 540 aa  192  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>