More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7170 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  100 
 
 
777 aa  1556    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  43.82 
 
 
851 aa  611  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  49.04 
 
 
838 aa  600  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  44.97 
 
 
856 aa  559  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  47.97 
 
 
933 aa  546  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  47.44 
 
 
895 aa  543  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  51.1 
 
 
1108 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  44.13 
 
 
849 aa  534  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6416  ABC transporter related  49.84 
 
 
702 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00507697  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  45.61 
 
 
910 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  40.69 
 
 
861 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  41.93 
 
 
869 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  41.16 
 
 
863 aa  449  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  40.38 
 
 
866 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  40.38 
 
 
866 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  40.38 
 
 
866 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  42.9 
 
 
851 aa  444  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  40.3 
 
 
848 aa  426  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.46 
 
 
863 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.38 
 
 
1004 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.9 
 
 
899 aa  379  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.05 
 
 
903 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  33.43 
 
 
796 aa  353  8.999999999999999e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  38.19 
 
 
890 aa  349  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.94 
 
 
878 aa  346  8.999999999999999e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.93 
 
 
799 aa  334  4e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.71 
 
 
799 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2932  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.5 
 
 
802 aa  330  6e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  31.43 
 
 
770 aa  278  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6943  ABC transporter related  29.45 
 
 
972 aa  224  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.144831 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0963  ABC transporter related  30.24 
 
 
590 aa  175  2.9999999999999996e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0361  ABC transporter related  25.65 
 
 
1194 aa  157  6e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_992  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  28.26 
 
 
585 aa  144  7e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00803049 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31433  predicted protein  28.25 
 
 
641 aa  143  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00201267  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14778  predicted protein  26.92 
 
 
515 aa  141  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0096196  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08928  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78576]  27.99 
 
 
1466 aa  140  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0515148 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08892  ABC multidrug transporter (Eurofung)  39.91 
 
 
1448 aa  137  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  41.26 
 
 
284 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57529  ATP dependent transporter multidrug resistance (SNQ2)  27.67 
 
 
1455 aa  135  3.9999999999999996e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.088165  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04749  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P884]  27.62 
 
 
1498 aa  134  7.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.717358  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01174  ABC multidrug transporter (Eurofung)  26.67 
 
 
1490 aa  133  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25217  predicted protein  26.24 
 
 
635 aa  133  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59143  ABC transporter  37.55 
 
 
1476 aa  132  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233353  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  40.61 
 
 
568 aa  132  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77736  Opaque-specific ABC transporter CDR3  38.7 
 
 
1470 aa  132  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49726  predicted protein  25.28 
 
 
741 aa  130  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01300  conserved hypothetical protein  36.6 
 
 
1275 aa  130  9.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41766  ABC transporter  39.74 
 
 
1445 aa  130  9.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0215088  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00771  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VK4]  40.27 
 
 
1499 aa  130  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.280948  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34685  predicted protein  25.39 
 
 
602 aa  130  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.535361  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4751  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.16 
 
 
269 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00318924  hitchhiker  0.00202738 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06490  ABC transporter, putative  26.77 
 
 
1463 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36892  ABC(ABCG) family transporter: multidrug (ABCG)  29.26 
 
 
655 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140325  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.61 
 
 
321 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0490  ABC transporter related  33.81 
 
 
241 aa  129  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  33.46 
 
 
304 aa  128  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10949  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VK5]  36.76 
 
 
1501 aa  128  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.03 
 
 
305 aa  128  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  34.8 
 
 
307 aa  128  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_006686  CND00090  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  27.19 
 
 
1558 aa  127  6e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.120947  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.78 
 
 
301 aa  127  6e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  33.79 
 
 
298 aa  127  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  35.19 
 
 
309 aa  127  8.000000000000001e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5813  ABC transporter ATP-binding protein  38.5 
 
 
244 aa  126  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05770  xenobiotic-transporting ATPase, putative  32.58 
 
 
1536 aa  127  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16705  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4302  ABC transporter related protein  34.04 
 
 
312 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85570  Multidrug resistance protein  38.46 
 
 
1505 aa  127  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.408248  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0060  ABC transporter related  39.19 
 
 
312 aa  126  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67030  ABC transporter ATP-binding protein  38.5 
 
 
244 aa  126  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57225  ATP-dependent ABC transporter  32.95 
 
 
1271 aa  127  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.229844  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03247  ABC multidrug transporter (Eurofung)  41.59 
 
 
1457 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  34.7 
 
 
326 aa  126  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50096  predicted protein  26.03 
 
 
640 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  34.04 
 
 
310 aa  126  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  35.44 
 
 
319 aa  125  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  34.69 
 
 
309 aa  125  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4704  ABC transporter-related protein  36.09 
 
 
257 aa  125  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.874551  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  36.68 
 
 
321 aa  125  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  34.95 
 
 
300 aa  125  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  37 
 
 
256 aa  125  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  36.68 
 
 
321 aa  125  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  37.76 
 
 
1171 aa  125  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.55 
 
 
326 aa  124  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  34.67 
 
 
319 aa  124  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28.2 
 
 
305 aa  124  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  33.17 
 
 
369 aa  124  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06581  ABC multidrug transporter (Eurofung)  36.53 
 
 
1517 aa  124  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.375174 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2578  ABC transporter related protein  39.91 
 
 
282 aa  124  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  37.02 
 
 
319 aa  124  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  36.24 
 
 
322 aa  124  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  36.02 
 
 
305 aa  124  9e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1708  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  34.43 
 
 
242 aa  124  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.871153  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  33.91 
 
 
266 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  37.22 
 
 
322 aa  123  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  35.68 
 
 
325 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  35.35 
 
 
243 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  35.58 
 
 
250 aa  123  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  37.12 
 
 
593 aa  123  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  35.15 
 
 
335 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  35.21 
 
 
243 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>