More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_57225 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_32571  ABC transporter family protein  54.75 
 
 
1253 aa  1411    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.318533  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57225  ATP-dependent ABC transporter  100 
 
 
1271 aa  2622    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.229844  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01300  conserved hypothetical protein  32.25 
 
 
1275 aa  281  5e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08489  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78577]  24.11 
 
 
1425 aa  262  4e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08928  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78576]  25.21 
 
 
1466 aa  261  6e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0515148 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35308  ABC(ABCG) family transporter: pleiotropic drug  24.78 
 
 
1268 aa  253  1e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10949  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VK5]  23.88 
 
 
1501 aa  251  8e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08813  ABC multidrug transporter (Eurofung)  24.1 
 
 
1480 aa  244  6e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03329  ABC multidrug transporter (Eurofung)  23.68 
 
 
1361 aa  243  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.829089  normal  0.85182 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06490  ABC transporter, putative  23.69 
 
 
1463 aa  243  2e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03247  ABC multidrug transporter (Eurofung)  24.15 
 
 
1457 aa  241  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00680  ABC transporter PMR5, putative  25.39 
 
 
1420 aa  233  1e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08892  ABC multidrug transporter (Eurofung)  24.14 
 
 
1448 aa  233  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21664  predicted protein  25.04 
 
 
1186 aa  232  4e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00770  ABC transporter PMR5, putative  24.88 
 
 
1421 aa  231  7e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00771  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VK4]  23.67 
 
 
1499 aa  224  7e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.280948  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08344  ABC multidrug transporter (Eurofung)  23.94 
 
 
1462 aa  222  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0543017  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57529  ATP dependent transporter multidrug resistance (SNQ2)  24.14 
 
 
1455 aa  222  5e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.088165  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34685  predicted protein  28.62 
 
 
602 aa  220  1e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.535361  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31433  predicted protein  28.33 
 
 
641 aa  218  7e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00201267  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_83  predicted protein  24.2 
 
 
1164 aa  215  4.9999999999999996e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897392  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04749  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P884]  23.83 
 
 
1498 aa  213  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.717358  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77736  Opaque-specific ABC transporter CDR3  23.09 
 
 
1470 aa  208  6e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01174  ABC multidrug transporter (Eurofung)  22.72 
 
 
1490 aa  203  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09344  ABC multidrug transporter (Eurofung)  23.54 
 
 
1486 aa  203  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.815172  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05770  xenobiotic-transporting ATPase, putative  22.77 
 
 
1536 aa  203  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16705  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14894  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  29.51 
 
 
556 aa  203  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.496486  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00090  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  22.69 
 
 
1558 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.120947  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22629  predicted protein  23.48 
 
 
1367 aa  199  3e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125908  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82629  predicted protein  29.5 
 
 
589 aa  197  8.000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0724503  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06581  ABC multidrug transporter (Eurofung)  23.34 
 
 
1517 aa  196  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.375174 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36892  ABC(ABCG) family transporter: multidrug (ABCG)  30.83 
 
 
655 aa  196  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140325  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49726  predicted protein  29.45 
 
 
741 aa  196  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03952  ABC multidrug transporter (Eurofung)  23.9 
 
 
1478 aa  194  9e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.833442 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59143  ABC transporter  22.38 
 
 
1476 aa  193  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233353  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25217  predicted protein  26.64 
 
 
635 aa  193  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_992  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  26.88 
 
 
585 aa  189  4e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00803049 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14778  predicted protein  26.92 
 
 
515 aa  185  5.0000000000000004e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0096196  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94849  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  32.94 
 
 
664 aa  183  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.855588  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85570  Multidrug resistance protein  24.38 
 
 
1505 aa  182  2.9999999999999997e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.408248  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38326  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  30.09 
 
 
551 aa  179  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.843576  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06369  ABC transporter, putative (Eurofung)  28.96 
 
 
559 aa  176  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33002  predicted protein  26.85 
 
 
1033 aa  175  5.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_1450  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  28.7 
 
 
515 aa  174  7.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49856  predicted protein  27.12 
 
 
810 aa  173  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88422  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  26.99 
 
 
640 aa  171  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17821  normal  0.28517 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25218  predicted protein  29.73 
 
 
545 aa  169  5e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_1441  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  26.41 
 
 
523 aa  164  8.000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.958865  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04860  ATP-dependent permease, putative  36.23 
 
 
1090 aa  158  7e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39403  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  39.36 
 
 
242 aa  157  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50096  predicted protein  25.81 
 
 
640 aa  156  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41766  ABC transporter  24.54 
 
 
1445 aa  151  7e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0215088  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05194  ABC transporter (Eurofung)  35.4 
 
 
963 aa  149  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177656  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44756  predicted protein  24.92 
 
 
641 aa  150  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07090  ABC transporter, putative  27.08 
 
 
1543 aa  149  5e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2932  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.89 
 
 
802 aa  141  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  34.48 
 
 
1108 aa  133  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  24.64 
 
 
1004 aa  129  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.95 
 
 
777 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  31.46 
 
 
796 aa  127  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  29.64 
 
 
863 aa  122  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.21 
 
 
899 aa  120  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.9 
 
 
838 aa  120  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.63 
 
 
903 aa  119  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  30.14 
 
 
851 aa  119  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.72 
 
 
910 aa  118  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  25.72 
 
 
856 aa  118  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38932  ABC(ATP-binding) family transporter  36.54 
 
 
253 aa  118  8.999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0950167 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.05 
 
 
890 aa  117  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  30.47 
 
 
799 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.34 
 
 
933 aa  114  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  30.19 
 
 
799 aa  113  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  26.22 
 
 
895 aa  112  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  25.91 
 
 
878 aa  112  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.34 
 
 
851 aa  111  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  33.18 
 
 
291 aa  111  8.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  31.22 
 
 
848 aa  110  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6416  ABC transporter related  32.12 
 
 
702 aa  111  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00507697  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  28.28 
 
 
869 aa  109  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.49 
 
 
849 aa  109  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  27.09 
 
 
770 aa  107  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  29.18 
 
 
861 aa  107  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  29.41 
 
 
863 aa  106  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0361  ABC transporter related  28.11 
 
 
1194 aa  105  7e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  32.75 
 
 
307 aa  103  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  28.76 
 
 
866 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  28.76 
 
 
866 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  28.76 
 
 
866 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0214  ferrichrome ABC transporter  30.74 
 
 
259 aa  100  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0021  ABC transporter, ATP-binding protein  30.14 
 
 
252 aa  99.4  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0215  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  30.74 
 
 
259 aa  98.6  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4302  ABC transporter related protein  28.37 
 
 
312 aa  98.6  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.27 
 
 
339 aa  97.8  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1580  ABC transporter related  31.05 
 
 
237 aa  96.3  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.289327  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  31.75 
 
 
327 aa  95.9  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  29.92 
 
 
260 aa  95.1  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.98 
 
 
328 aa  95.1  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0314  ABC transporter, ATP-binding protein  29.36 
 
 
253 aa  94.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.924183  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.74 
 
 
323 aa  94.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  33.63 
 
 
308 aa  94.4  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>