More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_41766 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06581  ABC multidrug transporter (Eurofung)  34.74 
 
 
1517 aa  897    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.375174 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03952  ABC multidrug transporter (Eurofung)  37.76 
 
 
1478 aa  884    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.833442 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04749  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P884]  48.59 
 
 
1498 aa  1411    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.717358  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08813  ABC multidrug transporter (Eurofung)  35.75 
 
 
1480 aa  876    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10949  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VK5]  51.8 
 
 
1501 aa  1545    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08344  ABC multidrug transporter (Eurofung)  49.11 
 
 
1462 aa  1375    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0543017  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08489  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78577]  36.4 
 
 
1425 aa  910    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03247  ABC multidrug transporter (Eurofung)  36.95 
 
 
1457 aa  878    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03329  ABC multidrug transporter (Eurofung)  35.41 
 
 
1361 aa  833    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.829089  normal  0.85182 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08892  ABC multidrug transporter (Eurofung)  33.93 
 
 
1448 aa  796    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08928  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78576]  45.98 
 
 
1466 aa  1272    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0515148 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00771  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VK4]  51.47 
 
 
1499 aa  1446    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.280948  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01174  ABC multidrug transporter (Eurofung)  44.26 
 
 
1490 aa  1210    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09344  ABC multidrug transporter (Eurofung)  42.68 
 
 
1486 aa  1227    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.815172  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57529  ATP dependent transporter multidrug resistance (SNQ2)  39.12 
 
 
1455 aa  1058    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.088165  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41766  ABC transporter  100 
 
 
1445 aa  3025    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0215088  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77736  Opaque-specific ABC transporter CDR3  59.08 
 
 
1470 aa  1808    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07090  ABC transporter, putative  36.77 
 
 
1543 aa  827    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06490  ABC transporter, putative  36.44 
 
 
1463 aa  852    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00680  ABC transporter PMR5, putative  33.21 
 
 
1420 aa  771    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00770  ABC transporter PMR5, putative  32.39 
 
 
1421 aa  775    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05770  xenobiotic-transporting ATPase, putative  48.61 
 
 
1536 aa  1451    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16705  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00090  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  49.61 
 
 
1558 aa  1425    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.120947  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85570  Multidrug resistance protein  59.4 
 
 
1505 aa  1846    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.408248  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59143  ABC transporter  82.53 
 
 
1476 aa  2586    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233353  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22629  predicted protein  27.32 
 
 
1367 aa  414  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125908  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35308  ABC(ABCG) family transporter: pleiotropic drug  26.24 
 
 
1268 aa  396  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21664  predicted protein  26.92 
 
 
1186 aa  377  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_83  predicted protein  26.1 
 
 
1164 aa  378  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897392  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_992  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  27.34 
 
 
585 aa  180  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00803049 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14778  predicted protein  28.04 
 
 
515 aa  177  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0096196  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50096  predicted protein  25.75 
 
 
640 aa  176  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31433  predicted protein  26.93 
 
 
641 aa  172  5e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00201267  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05194  ABC transporter (Eurofung)  34.59 
 
 
963 aa  165  7e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177656  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82629  predicted protein  27.49 
 
 
589 aa  164  8.000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0724503  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04860  ATP-dependent permease, putative  37.32 
 
 
1090 aa  160  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25217  predicted protein  34.55 
 
 
635 aa  160  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38326  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  29.15 
 
 
551 aa  158  8e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.843576  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34685  predicted protein  34.24 
 
 
602 aa  155  5e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.535361  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36892  ABC(ABCG) family transporter: multidrug (ABCG)  27.47 
 
 
655 aa  154  8.999999999999999e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140325  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25218  predicted protein  34.38 
 
 
545 aa  153  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33002  predicted protein  25.98 
 
 
1033 aa  152  7e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57225  ATP-dependent ABC transporter  24.54 
 
 
1271 aa  151  9e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.229844  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49726  predicted protein  33.55 
 
 
741 aa  146  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32571  ABC transporter family protein  25.84 
 
 
1253 aa  144  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.318533  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94849  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  28.24 
 
 
664 aa  143  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.855588  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01300  conserved hypothetical protein  27.37 
 
 
1275 aa  140  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_1441  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  26.17 
 
 
523 aa  139  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.958865  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.93 
 
 
890 aa  139  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  29.13 
 
 
1004 aa  136  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06369  ABC transporter, putative (Eurofung)  24.25 
 
 
559 aa  134  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.93 
 
 
910 aa  132  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88422  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  28.97 
 
 
640 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17821  normal  0.28517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  39.74 
 
 
777 aa  130  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_1450  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  26.5 
 
 
515 aa  129  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44756  predicted protein  35.74 
 
 
641 aa  129  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  35.71 
 
 
796 aa  127  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  30.35 
 
 
863 aa  125  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14894  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  26.84 
 
 
556 aa  124  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.496486  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.99 
 
 
899 aa  123  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  26.61 
 
 
851 aa  122  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.12 
 
 
903 aa  122  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  33.61 
 
 
1108 aa  120  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49856  predicted protein  29.43 
 
 
810 aa  118  6.9999999999999995e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.77 
 
 
878 aa  117  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39403  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  37.25 
 
 
242 aa  117  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2932  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.84 
 
 
802 aa  116  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  35.02 
 
 
861 aa  115  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  34.86 
 
 
869 aa  115  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  29.5 
 
 
799 aa  115  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  30.41 
 
 
866 aa  115  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  31.46 
 
 
866 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  31.46 
 
 
866 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  35.75 
 
 
770 aa  114  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.26 
 
 
851 aa  113  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  32.39 
 
 
848 aa  112  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  33.47 
 
 
863 aa  112  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  28.91 
 
 
799 aa  111  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.71 
 
 
838 aa  112  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38932  ABC(ATP-binding) family transporter  33.84 
 
 
253 aa  109  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0950167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  26 
 
 
856 aa  108  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  32.48 
 
 
895 aa  104  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0361  ABC transporter related  26.71 
 
 
1194 aa  103  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.09 
 
 
933 aa  102  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6416  ABC transporter related  32.64 
 
 
702 aa  97.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00507697  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  29.55 
 
 
297 aa  90.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.74 
 
 
849 aa  88.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  32.83 
 
 
345 aa  88.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  30.28 
 
 
249 aa  87  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0785  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.08 
 
 
324 aa  86.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0018  ABC transporter related  28.79 
 
 
581 aa  85.9  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0718  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  29.52 
 
 
251 aa  85.5  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000110627  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  32.66 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  33 
 
 
339 aa  85.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6943  ABC transporter related  29.11 
 
 
972 aa  85.5  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.144831 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  33 
 
 
339 aa  85.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.43 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  29.87 
 
 
227 aa  84.7  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5036  ABC transporter related  29.45 
 
 
325 aa  84  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1061  ABC transporter related  32.88 
 
 
592 aa  84  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.809273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>