More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_59143 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06581  ABC multidrug transporter (Eurofung)  36.13 
 
 
1517 aa  902    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.375174 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03952  ABC multidrug transporter (Eurofung)  36.91 
 
 
1478 aa  859    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.833442 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04749  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P884]  47.84 
 
 
1498 aa  1391    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.717358  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08813  ABC multidrug transporter (Eurofung)  34.86 
 
 
1480 aa  878    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10949  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VK5]  50.81 
 
 
1501 aa  1489    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08344  ABC multidrug transporter (Eurofung)  48.54 
 
 
1462 aa  1368    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0543017  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08489  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78577]  37.82 
 
 
1425 aa  932    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03247  ABC multidrug transporter (Eurofung)  36.7 
 
 
1457 aa  886    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03329  ABC multidrug transporter (Eurofung)  35.78 
 
 
1361 aa  853    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.829089  normal  0.85182 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08892  ABC multidrug transporter (Eurofung)  33.01 
 
 
1448 aa  793    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08928  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78576]  45.18 
 
 
1466 aa  1256    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0515148 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00771  ABC transporter protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VK4]  50.71 
 
 
1499 aa  1425    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.280948  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01174  ABC multidrug transporter (Eurofung)  43.75 
 
 
1490 aa  1192    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09344  ABC multidrug transporter (Eurofung)  42.33 
 
 
1486 aa  1222    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.815172  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59143  ABC transporter  100 
 
 
1476 aa  3093    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.233353  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77736  Opaque-specific ABC transporter CDR3  59.34 
 
 
1470 aa  1810    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57529  ATP dependent transporter multidrug resistance (SNQ2)  38.92 
 
 
1455 aa  1066    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.088165  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07090  ABC transporter, putative  37.28 
 
 
1543 aa  836    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06490  ABC transporter, putative  35.44 
 
 
1463 aa  837    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00680  ABC transporter PMR5, putative  32.3 
 
 
1420 aa  760    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00770  ABC transporter PMR5, putative  32.04 
 
 
1421 aa  766    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05770  xenobiotic-transporting ATPase, putative  48.18 
 
 
1536 aa  1424    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16705  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00090  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  48.87 
 
 
1558 aa  1407    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.120947  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85570  Multidrug resistance protein  60.63 
 
 
1505 aa  1893    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.408248  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41766  ABC transporter  82.53 
 
 
1445 aa  2586    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0215088  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35308  ABC(ABCG) family transporter: pleiotropic drug  26.53 
 
 
1268 aa  394  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_22629  predicted protein  26.66 
 
 
1367 aa  382  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125908  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_83  predicted protein  27 
 
 
1164 aa  382  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.897392  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21664  predicted protein  26.88 
 
 
1186 aa  369  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57225  ATP-dependent ABC transporter  22.41 
 
 
1271 aa  193  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.229844  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14778  predicted protein  27.96 
 
 
515 aa  184  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0096196  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31433  predicted protein  26.45 
 
 
641 aa  177  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00201267  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_992  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  28.18 
 
 
585 aa  174  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00803049 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05194  ABC transporter (Eurofung)  38.95 
 
 
963 aa  171  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177656  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50096  predicted protein  26.1 
 
 
640 aa  169  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33002  predicted protein  27.31 
 
 
1033 aa  167  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36892  ABC(ABCG) family transporter: multidrug (ABCG)  28.44 
 
 
655 aa  164  8.000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140325  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34685  predicted protein  28.22 
 
 
602 aa  164  9e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.535361  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82629  predicted protein  26.83 
 
 
589 aa  163  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0724503  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49726  predicted protein  34.43 
 
 
741 aa  162  5e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04860  ATP-dependent permease, putative  38.1 
 
 
1090 aa  161  8e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25217  predicted protein  34.39 
 
 
635 aa  157  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25218  predicted protein  34.31 
 
 
545 aa  156  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01300  conserved hypothetical protein  29.19 
 
 
1275 aa  152  4e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_94849  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  27.67 
 
 
664 aa  152  5e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.855588  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38326  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  27.82 
 
 
551 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.843576  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_1441  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  27.69 
 
 
523 aa  149  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.958865  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  26.89 
 
 
1004 aa  144  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44756  predicted protein  29.15 
 
 
641 aa  143  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2211  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  39.25 
 
 
910 aa  135  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.913993 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_1450  ABC(ABCG) family transporter: multidrug  27.03 
 
 
515 aa  135  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32571  ABC transporter family protein  27.13 
 
 
1253 aa  135  6.999999999999999e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.318533  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  29 
 
 
890 aa  132  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7170  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.55 
 
 
777 aa  132  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14894  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  26.52 
 
 
556 aa  129  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.496486  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06369  ABC transporter, putative (Eurofung)  23.7 
 
 
559 aa  129  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4431  FHA domain-containing protein  26.55 
 
 
796 aa  128  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  25.5 
 
 
851 aa  127  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39403  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  37.65 
 
 
242 aa  127  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  32.59 
 
 
1108 aa  127  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.55 
 
 
899 aa  125  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88422  ABC(ABCG) family transporter: White protein-like protein (ABCG)  24.86 
 
 
640 aa  125  6e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17821  normal  0.28517 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.93 
 
 
863 aa  124  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.86 
 
 
903 aa  124  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49856  predicted protein  29.43 
 
 
810 aa  124  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.25 
 
 
838 aa  121  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28591  hypothetical protein  35.81 
 
 
770 aa  119  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.71 
 
 
851 aa  119  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1546  ABC transporter-related protein  35.02 
 
 
861 aa  119  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.687102  normal  0.160264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2932  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.94 
 
 
802 aa  118  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4882  ABC transporter related  35.02 
 
 
869 aa  118  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.32 
 
 
878 aa  118  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11765  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter  35.94 
 
 
863 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000591365 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1639  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.49 
 
 
799 aa  116  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1228  ABC transporter related  33.19 
 
 
866 aa  115  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708642 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1666  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.04 
 
 
799 aa  115  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1201  FHA domain-containing protein  34.56 
 
 
866 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137794  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1218  ABC transporter related  34.56 
 
 
866 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  31.71 
 
 
848 aa  113  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1183  FHA domain-containing protein  27.94 
 
 
895 aa  111  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1473  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38932  ABC(ATP-binding) family transporter  34.34 
 
 
253 aa  110  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0950167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5286  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.1 
 
 
933 aa  106  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135201  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  36.15 
 
 
856 aa  103  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0361  ABC transporter related  25.63 
 
 
1194 aa  102  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6416  ABC transporter related  33.33 
 
 
702 aa  100  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00507697  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3181  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  29.97 
 
 
849 aa  94.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  34.29 
 
 
339 aa  93.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  34.29 
 
 
339 aa  93.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  29.91 
 
 
297 aa  91.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6943  ABC transporter related  29.54 
 
 
972 aa  91.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.144831 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.77 
 
 
326 aa  90.5  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1061  ABC transporter related  34.68 
 
 
592 aa  89  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15960  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.68 
 
 
547 aa  87.8  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221964  normal  0.345832 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  33.83 
 
 
260 aa  88.2  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1367  ABC transporter related  33.18 
 
 
254 aa  87.8  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.181085  normal  0.116332 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  30.32 
 
 
293 aa  88.2  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  34.67 
 
 
339 aa  87.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5036  ABC transporter related  28.1 
 
 
325 aa  87.8  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0718  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  29.78 
 
 
251 aa  86.3  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000110627  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0498  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.37 
 
 
360 aa  85.5  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>