More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4213 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  100 
 
 		 504 aa  1017    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  52.75 
 
 		 462 aa  420  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  44.42 
 
 		 483 aa  332  9e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  45.35 
 
 		 530 aa  301  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  45.03 
 
 		 530 aa  292  8e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  44.02 
 
 		 486 aa  286  4e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  44.15 
 
 		 505 aa  281  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  36.88 
 
 		 476 aa  277  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  38.23 
 
 		 475 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  45.7 
 
 		 640 aa  273  5.000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  45.3 
 
 		 487 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  42.01 
 
 		 503 aa  210  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  32.22 
 
 		 476 aa  167  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  31.11 
 
 		 524 aa  143  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  34.04 
 
 		 323 aa  135  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  28.62 
 
 		 395 aa  127  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  29.82 
 
 		 363 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  27.55 
 
 		 340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  30.41 
 
 		 380 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  30.41 
 
 		 380 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.82 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02500  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.97 
 
 		 308 aa  114  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1634  beta-lactamase  28.87 
 
 		 416 aa  113  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.374388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  25.73 
 
 		 598 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3265  beta-lactamase  32.82 
 
 		 304 aa  111  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000437182  hitchhiker  0.000159955 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  24.56 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  30.43 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  29.55 
 
 		 328 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  23.76 
 
 		 305 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  26.47 
 
 		 315 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  23.49 
 
 		 305 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  30.79 
 
 		 401 aa  103  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  23.84 
 
 		 305 aa  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.13 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  26.47 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  25.99 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  26.47 
 
 		 315 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  26.47 
 
 		 315 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  26.53 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  26.56 
 
 		 315 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  22.42 
 
 		 309 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  22.42 
 
 		 309 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  25.71 
 
 		 396 aa  98.6  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  22.42 
 
 		 305 aa  98.2  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  30.5 
 
 		 389 aa  97.8  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  26.73 
 
 		 315 aa  96.7  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  29.55 
 
 		 366 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  26.23 
 
 		 314 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  25.9 
 
 		 315 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  26.98 
 
 		 397 aa  95.5  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  24.58 
 
 		 305 aa  95.1  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  28.33 
 
 		 412 aa  94.4  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.71 
 
 		 305 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  29.08 
 
 		 473 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  28.71 
 
 		 378 aa  92.8  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  29.08 
 
 		 473 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  23.64 
 
 		 387 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  29.08 
 
 		 473 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  21.88 
 
 		 305 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.96 
 
 		 425 aa  91.3  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3770  beta-lactamase  26.38 
 
 		 428 aa  91.3  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000344014  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  26.2 
 
 		 337 aa  90.5  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  26.08 
 
 		 384 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  30.68 
 
 		 396 aa  89.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  24 
 
 		 383 aa  88.6  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1083  beta-lactamase  28.94 
 
 		 328 aa  88.2  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  26.67 
 
 		 414 aa  87  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1926  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.28 
 
 		 419 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  27.74 
 
 		 405 aa  86.7  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  26.88 
 
 		 466 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1841  hypothetical protein  25.62 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  26.58 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  26.1 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4964  beta-lactamase  27.56 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663595  normal  0.0104106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  27.18 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.86 
 
 		 419 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3306  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.52 
 
 		 419 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177135  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.19 
 
 		 468 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  27.78 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  28.01 
 
 		 456 aa  82.4  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.04 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0869  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.21 
 
 		 443 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  24.83 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.03 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.03 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3346  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.03 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4500  beta-lactamase  25.33 
 
 		 421 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00711948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  26.87 
 
 		 505 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  21.05 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2259  beta-lactamase  27.38 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777809  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1376  hypothetical protein  24.78 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  27.42 
 
 		 475 aa  80.1  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.52 
 
 		 419 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  26.79 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0910  beta-lactamase  27.27 
 
 		 353 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3310  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  25.68 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  27.59 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  27.12 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2235  hypothetical protein  27.43 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  25.34 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>