297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2058 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 170 aa  342  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  57.35 
 
 		 140 aa  156  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  60.77 
 
 		 149 aa  147  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  57.66 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  57.66 
 
 		 149 aa  147  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  57.35 
 
 		 154 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  56.93 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  42.75 
 
 		 140 aa  89  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  41.88 
 
 		 142 aa  88.6  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 155 aa  84  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  42.24 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  40.77 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  40.71 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  42.24 
 
 		 156 aa  77  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  40.95 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  35.83 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  41.07 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  39.17 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  37.19 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  39.25 
 
 		 183 aa  63.9  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00960  transcriptional regulator  31.93 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  34.51 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 		 157 aa  62  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 148 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  32.56 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06415  transcriptional regulator marR family protein  34.04 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  30.47 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  39.6 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  34.82 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  0.000001019 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  26.23 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  33.86 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  39.51 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1565  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.891062  normal  0.889497 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4886  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 153 aa  52.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0545519  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 169 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  28.81 
 
 		 158 aa  51.6  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 160 aa  51.2  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2059  regulatory protein, MarR  42.17 
 
 		 166 aa  51.2  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0666418  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 167 aa  51.2  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 150 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  31.3 
 
 		 160 aa  50.8  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 147 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 147 aa  50.8  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 160 aa  50.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  38.04 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  36.64 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2272  transcriptional regulator, MarR family  33.07 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>