277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3429 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2666  RND efflux transporter  47.93 
 
 		 821 aa  704    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0970775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  51.3 
 
 		 799 aa  805    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3202  transporter, putative  48.42 
 
 		 826 aa  717    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.320198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2809  transporter, putative  47.68 
 
 		 821 aa  701    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0254275  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  43.97 
 
 		 772 aa  647    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  100 
 
 		 787 aa  1600    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  44.19 
 
 		 771 aa  639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  52.15 
 
 		 796 aa  820    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  51.85 
 
 		 796 aa  824    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  44.21 
 
 		 772 aa  643    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  49.22 
 
 		 799 aa  714    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  52.97 
 
 		 790 aa  823    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  51.34 
 
 		 794 aa  820    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2244  putative transporter  46.78 
 
 		 831 aa  691    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.166877  hitchhiker  0.0000000000000152774 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2165  transporter, putative  47.47 
 
 		 808 aa  693    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119631 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  52.28 
 
 		 784 aa  823    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  51.3 
 
 		 799 aa  807    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0133  transporter, putative  48.31 
 
 		 808 aa  691    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134014  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0645  RND family transporter  46.83 
 
 		 834 aa  715    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0103634  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6867  putative transporter  45.33 
 
 		 827 aa  656    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0544338  normal  0.0493157 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  43.93 
 
 		 771 aa  640    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  43.93 
 
 		 771 aa  640    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  51.43 
 
 		 799 aa  808    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  52.84 
 
 		 793 aa  821    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  44.27 
 
 		 771 aa  640    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  44.85 
 
 		 768 aa  645    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  44.83 
 
 		 767 aa  645    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  53.89 
 
 		 795 aa  843    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  50.57 
 
 		 799 aa  814    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0967  putative transporter  47.66 
 
 		 813 aa  686    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.108319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2554  hypothetical protein  43.91 
 
 		 771 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0631379  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  43.91 
 
 		 771 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  44.2 
 
 		 767 aa  633  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2441  hypothetical protein  43.91 
 
 		 771 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1910  hypothetical protein  43.91 
 
 		 771 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0338156  normal  0.0625477 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  43.67 
 
 		 771 aa  623  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4062  RND superfamily transporter, putative  43.15 
 
 		 813 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  44.07 
 
 		 771 aa  620  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  43.44 
 
 		 770 aa  620  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4029  RND superfamily transporter, putative  43.78 
 
 		 813 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.622803  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  43.63 
 
 		 769 aa  618  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  41.48 
 
 		 784 aa  618  1e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  42.86 
 
 		 768 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3922  RND superfamily transporter  43.08 
 
 		 809 aa  601  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  41.58 
 
 		 820 aa  592  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  41.51 
 
 		 816 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  41.82 
 
 		 787 aa  582  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2006  RND superfamily exporter  39.02 
 
 		 794 aa  557  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0027  RND superfamily exporter  39.54 
 
 		 783 aa  554  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1574  hypothetical protein  40.79 
 
 		 810 aa  552  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.390542  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  37.67 
 
 		 799 aa  491  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  36.9 
 
 		 786 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  36.9 
 
 		 786 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  36.64 
 
 		 786 aa  489  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  36.56 
 
 		 786 aa  488  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  36.59 
 
 		 786 aa  482  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  36.27 
 
 		 786 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  36.27 
 
 		 786 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  37.62 
 
 		 804 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2749  transporter, putative  37.69 
 
 		 804 aa  474  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00176897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  36.51 
 
 		 786 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  35.93 
 
 		 786 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  36.07 
 
 		 797 aa  461  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  25 
 
 		 808 aa  229  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  25 
 
 		 790 aa  224  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  24.55 
 
 		 797 aa  219  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  23.79 
 
 		 791 aa  217  7e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  23.21 
 
 		 799 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  24.64 
 
 		 792 aa  207  7e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  22.88 
 
 		 796 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  23.16 
 
 		 830 aa  188  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  22.72 
 
 		 806 aa  187  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  22.46 
 
 		 805 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  22.55 
 
 		 805 aa  179  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  22.55 
 
 		 805 aa  179  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  21.61 
 
 		 773 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  22.42 
 
 		 1051 aa  110  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  20.81 
 
 		 806 aa  99  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  19.95 
 
 		 727 aa  98.2  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  19.75 
 
 		 808 aa  97.4  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  22.58 
 
 		 778 aa  96.3  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  22.07 
 
 		 788 aa  92.8  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  24.81 
 
 		 804 aa  89  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  21.34 
 
 		 747 aa  88.6  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  19.22 
 
 		 764 aa  85.1  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  27.78 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  21.17 
 
 		 803 aa  84.7  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  20.6 
 
 		 831 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  27.73 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  27.73 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  30.61 
 
 		 905 aa  76.3  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  19.78 
 
 		 755 aa  75.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  20.74 
 
 		 811 aa  75.5  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  20.61 
 
 		 864 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  21.75 
 
 		 764 aa  73.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  26.27 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  21.78 
 
 		 779 aa  70.5  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  25 
 
 		 388 aa  70.1  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.4 
 
 		 746 aa  69.3  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  21.58 
 
 		 752 aa  68.6  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>