More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2970 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2970  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 147 aa  299  9e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  45.54 
 
 		 135 aa  100  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  41.41 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2431  signal transduction protein  38.1 
 
 		 138 aa  96.7  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1838  signal transduction protein  37.3 
 
 		 138 aa  90.5  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2139  signal transduction protein  37.3 
 
 		 138 aa  90.5  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0162016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1896  signal transduction protein  36.51 
 
 		 138 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161177 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2228  CBS domain-containing protein  35.71 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1899  signal transduction protein  36.51 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.288112  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1446  signal transduction protein  33.33 
 
 		 138 aa  87  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1932  signal transduction protein  35.71 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.412842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2387  putative signal transduction protein with CBS domains  35.71 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.851922  normal  0.155065 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1618  CBS domain-containing protein  34.13 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1906  signal transduction protein  35.71 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  34.38 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1909  signal transduction protein  35.71 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.597362  normal  0.0569884 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2685  signal transduction protein  37.3 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1939  signal transduction protein  34.92 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1766  signal transduction protein  32.52 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2064  hypothetical protein  32.31 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1712  CBS domain-containing protein  33.07 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1506  CBS domain-containing protein  34.15 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2859  signal transduction protein  29.01 
 
 		 143 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206571  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0550  CBS domain-containing protein  31.75 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  37.8 
 
 		 191 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2171  CBS domain-containing protein  34.09 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2259  signal transduction protein  28.03 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0497964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  32.39 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1253  CBS domain-containing protein  41.84 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  31.25 
 
 		 558 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0256  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  30.97 
 
 		 483 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  30.33 
 
 		 201 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02402  CBS domain protein  29.41 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.121948  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004008  inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  27.42 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0825  putative signal transduction protein with CBS domains  30.07 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1719  CBS domain-containing protein  27.01 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  29.61 
 
 		 242 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  28.97 
 
 		 537 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  28.7 
 
 		 508 aa  60.1  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1799  putative signal transduction protein with CBS domains  36.94 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446245  normal  0.0519326 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  30.94 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2242  CBS domain-containing protein  25.6 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  33.61 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  25.53 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  30 
 
 		 483 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  28.28 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  27.89 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  29.33 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  32.33 
 
 		 201 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  29.79 
 
 		 233 aa  57  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  32.79 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  32 
 
 		 483 aa  57  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  27.4 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01513  hypothetical protein  25.81 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  28.29 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  30.5 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  27.97 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  27.63 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  26.71 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  27.05 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  28.8 
 
 		 888 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  27.15 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  24.68 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  26.09 
 
 		 493 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  31.97 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  31.15 
 
 		 309 aa  54.3  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  26.24 
 
 		 242 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  26.09 
 
 		 494 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  35.92 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  26.21 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.81 
 
 		 243 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  25.17 
 
 		 243 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  25.69 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  26.81 
 
 		 243 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  25.49 
 
 		 154 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  25.66 
 
 		 683 aa  53.1  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  30.33 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0164  CBS domain-containing protein  30.65 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00289218  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3486  CBS domain-containing protein  30.89 
 
 		 221 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000172668 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  25.85 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  30 
 
 		 231 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  23.65 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.86 
 
 		 903 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  33.59 
 
 		 236 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1405  signal transduction protein  31.06 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  25.69 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  25.22 
 
 		 491 aa  52  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  25.17 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  26.03 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  26.62 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  24.84 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 228 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  28.45 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  29.37 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1395  CBS domain-containing protein  29.84 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1231  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 		 137 aa  50.4  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.022182  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  26.03 
 
 		 153 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  34.65 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  28.93 
 
 		 142 aa  50.1  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>