More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1463 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  97.95 
 
 		 442 aa  840    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  100 
 
 		 440 aa  860    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  38.36 
 
 		 440 aa  300  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3452  MATE efflux family protein  39.36 
 
 		 445 aa  291  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000316888  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0967  multi antimicrobial extrusion protein MatE  38.84 
 
 		 434 aa  278  1e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000590306  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  33.71 
 
 		 452 aa  272  9e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  34.87 
 
 		 451 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  34.87 
 
 		 451 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  34.87 
 
 		 451 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  34.87 
 
 		 451 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  34.87 
 
 		 451 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  33.71 
 
 		 451 aa  269  8e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  33.49 
 
 		 451 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  33.49 
 
 		 451 aa  268  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  33.26 
 
 		 451 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  33.03 
 
 		 445 aa  249  6e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2669  multi antimicrobial extrusion protein MatE  36.58 
 
 		 452 aa  240  4e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.612532  normal  0.353791 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  32.77 
 
 		 459 aa  233  5e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2191  multi antimicrobial extrusion protein MatE  34.04 
 
 		 446 aa  227  3e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  33.18 
 
 		 452 aa  224  3e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  33.18 
 
 		 456 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1655  multi antimicrobial extrusion protein MatE  32.94 
 
 		 450 aa  212  9e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.2584 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  32.24 
 
 		 450 aa  211  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  32.74 
 
 		 456 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0819  multi antimicrobial extrusion protein MatE  32.49 
 
 		 459 aa  206  7e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.10085 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  29.49 
 
 		 451 aa  205  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18540  putative efflux protein, MATE family  31.29 
 
 		 435 aa  204  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  32.28 
 
 		 455 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1225  multi anti extrusion protein MatE  34.79 
 
 		 439 aa  204  3e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.874219  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  32.05 
 
 		 455 aa  203  6e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  31.05 
 
 		 458 aa  202  7e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  30.45 
 
 		 449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  31.48 
 
 		 456 aa  200  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0514  multi antimicrobial extrusion protein MatE  30.47 
 
 		 437 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000852803  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0795  multi antimicrobial extrusion protein MatE  31 
 
 		 451 aa  200  5e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  31.53 
 
 		 448 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  29.84 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  31.76 
 
 		 454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  29.16 
 
 		 451 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  29.16 
 
 		 451 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  30.99 
 
 		 496 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  31.91 
 
 		 452 aa  189  8e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  29.67 
 
 		 451 aa  189  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  28.11 
 
 		 442 aa  188  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  31.17 
 
 		 447 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  30.3 
 
 		 448 aa  186  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  28.93 
 
 		 451 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 455 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  30.58 
 
 		 449 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  29.66 
 
 		 450 aa  183  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  29.66 
 
 		 450 aa  183  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  30.25 
 
 		 466 aa  182  7e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  30.75 
 
 		 455 aa  182  7e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  29.66 
 
 		 450 aa  183  7e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  30.05 
 
 		 449 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.93 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  30.44 
 
 		 464 aa  179  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  28.64 
 
 		 455 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 455 aa  178  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  26.52 
 
 		 443 aa  176  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 449 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  30.95 
 
 		 461 aa  175  9.999999999999999e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  27.79 
 
 		 448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  30.7 
 
 		 468 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  31.1 
 
 		 460 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  27.53 
 
 		 467 aa  171  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  26.39 
 
 		 465 aa  171  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  27.62 
 
 		 446 aa  170  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  30.85 
 
 		 464 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3521  multi anti extrusion protein MatE  29.77 
 
 		 455 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1298  MATE efflux family protein  29.88 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 447 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  27.58 
 
 		 477 aa  166  8e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  31.76 
 
 		 447 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  26.39 
 
 		 448 aa  161  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  27.23 
 
 		 455 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  30.02 
 
 		 451 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  27.9 
 
 		 454 aa  156  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  29.21 
 
 		 456 aa  149  8e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  25.93 
 
 		 459 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 460 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1120  MATE efflux family protein  24.65 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  28.5 
 
 		 454 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.42 
 
 		 467 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1822  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.74 
 
 		 447 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.55411e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10480  Na+-driven multidrug efflux pump  27.14 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000234948 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 451 aa  137  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  26.68 
 
 		 451 aa  137  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.11 
 
 		 472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 470 aa  133  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  25.52 
 
 		 452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  27.29 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  27.75 
 
 		 493 aa  127  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 460 aa  127  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  27.69 
 
 		 464 aa  126  6e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>