More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN01650 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006683  CNN01650  DNA dependent ATPase, putative  100 
 
 		 1036 aa  2144    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03811  DNA excision repair protein (Rad26L), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03750)  34.12 
 
 		 1016 aa  362  2e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0279051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.61 
 
 		 1112 aa  228  6e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  31.38 
 
 		 918 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  31.38 
 
 		 918 aa  223  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  31.38 
 
 		 918 aa  223  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  31.19 
 
 		 918 aa  221  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  26.82 
 
 		 1193 aa  221  6e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  31.19 
 
 		 918 aa  221  7e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  31 
 
 		 918 aa  220  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  31 
 
 		 918 aa  220  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  31 
 
 		 918 aa  220  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  31 
 
 		 918 aa  219  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  31.55 
 
 		 918 aa  219  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 		 918 aa  214  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  28.82 
 
 		 711 aa  213  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  26.41 
 
 		 1067 aa  213  2e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  31.52 
 
 		 1072 aa  209  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  29.04 
 
 		 1111 aa  208  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.87 
 
 		 1112 aa  208  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53653  protein required for X-ray damage repair, mitotic recombination, and full meiotic recombination. mRNA increases in meiosis  28.23 
 
 		 821 aa  207  6e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194325  normal  0.270019 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14180  predicted protein  29.91 
 
 		 545 aa  207  6e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364389  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  30.78 
 
 		 1077 aa  206  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  31.18 
 
 		 1078 aa  206  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  30.43 
 
 		 1185 aa  205  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  29.84 
 
 		 1222 aa  204  7e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10677  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  27.68 
 
 		 833 aa  204  7e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.250944 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  32.5 
 
 		 886 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00855  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  30.43 
 
 		 1011 aa  202  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  32.3 
 
 		 924 aa  202  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  32.07 
 
 		 985 aa  201  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.83 
 
 		 1047 aa  201  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  28.86 
 
 		 1259 aa  201  5e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  31.64 
 
 		 1047 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  29.21 
 
 		 956 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  29.86 
 
 		 1087 aa  198  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 		 1108 aa  199  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  29.76 
 
 		 1175 aa  197  9e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  31.26 
 
 		 1134 aa  197  9e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.3 
 
 		 925 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  30.25 
 
 		 1080 aa  197  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  30.5 
 
 		 1084 aa  196  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  30.89 
 
 		 1084 aa  196  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02890  DNA supercoiling, putative  28.87 
 
 		 818 aa  196  3e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.525864  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.12 
 
 		 1139 aa  196  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  31.46 
 
 		 1019 aa  195  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  31.62 
 
 		 1048 aa  194  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.01 
 
 		 1091 aa  193  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  29.23 
 
 		 663 aa  193  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.42 
 
 		 1082 aa  192  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  29.35 
 
 		 1021 aa  191  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  31.78 
 
 		 1070 aa  191  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  30.45 
 
 		 1566 aa  191  5.999999999999999e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  28.63 
 
 		 1096 aa  191  7e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  30.61 
 
 		 621 aa  190  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  30.17 
 
 		 1105 aa  190  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  30.9 
 
 		 1025 aa  190  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.08 
 
 		 1048 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35059  predicted protein  27.89 
 
 		 688 aa  189  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.896252  normal  0.769408 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  29.64 
 
 		 1326 aa  189  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16860  predicted protein  30.04 
 
 		 821 aa  189  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210208  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  30.52 
 
 		 959 aa  189  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.31 
 
 		 1026 aa  189  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  28.83 
 
 		 1769 aa  189  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  28.31 
 
 		 1407 aa  188  6e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49572  predicted protein  26.04 
 
 		 975 aa  187  6e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280952  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  32.13 
 
 		 1088 aa  187  8e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.59 
 
 		 933 aa  187  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.73 
 
 		 1102 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  31.3 
 
 		 1033 aa  187  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  29.37 
 
 		 1071 aa  187  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  27.08 
 
 		 1517 aa  186  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  30.37 
 
 		 1105 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  30.56 
 
 		 666 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  31.12 
 
 		 988 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  28.52 
 
 		 1023 aa  186  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.55 
 
 		 1082 aa  186  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  29.86 
 
 		 1120 aa  185  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  29.66 
 
 		 1068 aa  185  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  29.71 
 
 		 977 aa  186  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  30.46 
 
 		 1082 aa  186  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  31.51 
 
 		 1194 aa  185  4.0000000000000006e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  29.34 
 
 		 1055 aa  185  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  29.42 
 
 		 848 aa  185  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  30.59 
 
 		 1127 aa  184  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  28.96 
 
 		 1250 aa  185  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  29.43 
 
 		 1848 aa  185  5.0000000000000004e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  26.81 
 
 		 1431 aa  184  5.0000000000000004e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  30.65 
 
 		 1082 aa  185  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  29.51 
 
 		 964 aa  184  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  29.67 
 
 		 1112 aa  184  8.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  30.1 
 
 		 1069 aa  184  8.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  27.81 
 
 		 1152 aa  184  8.000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  30.44 
 
 		 1082 aa  184  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 		 1068 aa  183  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  29.92 
 
 		 1064 aa  182  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  31.36 
 
 		 1125 aa  183  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.37 
 
 		 1104 aa  182  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  29.78 
 
 		 1120 aa  182  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  30.89 
 
 		 1019 aa  183  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>