More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK03200 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_09008  PhytochromePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5K039]  40.14 
 
 
1280 aa  694    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03200  bacteriophytochrome histidine kinase, putative  100 
 
 
1871 aa  3842    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.796961  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.35 
 
 
1002 aa  251  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.19 
 
 
1002 aa  250  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4021  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.39 
 
 
1013 aa  244  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1796  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
756 aa  230  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.232536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2356  phytochrome family protein, putative  29.03 
 
 
755 aa  224  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1956  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 
748 aa  221  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727974  normal  0.121547 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1902  bacteriophytochrome histidine kinase  29.71 
 
 
745 aa  220  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333534  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 
748 aa  217  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0539  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 
751 aa  211  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.802089  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0383  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 
746 aa  208  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.269133 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2652  bacteriophytochrome, putative  27.9 
 
 
993 aa  207  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.163581  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.83 
 
 
1002 aa  207  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  28.16 
 
 
1003 aa  206  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2402  ATP-binding region, ATPase-like  27.35 
 
 
762 aa  203  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0299776 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03481  Multi-sensor Signal Transduction Histidine Kinase  27.5 
 
 
908 aa  202  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0652805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.66 
 
 
769 aa  201  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0099  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 
746 aa  199  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 
916 aa  199  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
791 aa  199  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 
760 aa  198  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4111  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 
760 aa  198  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2162  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
745 aa  197  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894867  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 
760 aa  197  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3852  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  24.21 
 
 
765 aa  194  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.02 
 
 
833 aa  194  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4270  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 
751 aa  193  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.235212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3425  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 
775 aa  194  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0531418  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 
758 aa  192  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 
762 aa  191  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15596  normal  0.128973 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 
799 aa  189  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721204  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 
779 aa  188  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689927  normal  0.970382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3424  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 
758 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3458  putative PAS/PAC sensor protein  36.94 
 
 
760 aa  186  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0932578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1003  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 
751 aa  184  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.972748  hitchhiker  0.000165551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  34.21 
 
 
772 aa  184  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.03 
 
 
1788 aa  182  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000544  hypothetical protein  27.94 
 
 
828 aa  182  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00897  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  27.29 
 
 
884 aa  180  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.717501  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  26.9 
 
 
1442 aa  179  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2818  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 
769 aa  178  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0945314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3820  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 
755 aa  178  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 
1126 aa  177  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 
749 aa  176  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541129  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.21 
 
 
1131 aa  174  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3740  phytochrome  31.25 
 
 
732 aa  173  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103591  decreased coverage  0.000116427 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1726  putative PAS/PAC sensor protein  31.61 
 
 
731 aa  173  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3985  putative PAS/PAC sensor protein  28.6 
 
 
732 aa  172  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525883  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.88 
 
 
932 aa  173  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 
775 aa  172  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2403  ATP-binding region, ATPase-like  25.43 
 
 
776 aa  171  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  35.03 
 
 
755 aa  169  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2940  PAS  26.6 
 
 
1353 aa  169  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.37 
 
 
700 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4428  PAS sensor protein  26.86 
 
 
693 aa  168  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.426756 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1670  ATPase domain-containing protein  29.06 
 
 
750 aa  167  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.081803  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  26.96 
 
 
932 aa  167  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  25.31 
 
 
923 aa  166  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  29.66 
 
 
855 aa  166  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.83 
 
 
1611 aa  164  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2978  putative GAF sensor protein  32.17 
 
 
567 aa  164  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186  normal  0.0306937 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.31 
 
 
927 aa  163  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  29.95 
 
 
856 aa  162  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.51 
 
 
929 aa  162  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
977 aa  162  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1309  putative PAS/PAC sensor protein  29.05 
 
 
722 aa  161  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.543635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  30.73 
 
 
770 aa  160  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  25.35 
 
 
1014 aa  160  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.3 
 
 
774 aa  160  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.960478  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.91 
 
 
1313 aa  160  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.22 
 
 
957 aa  159  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6428  bacteriophytochrome  28.04 
 
 
723 aa  159  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688062  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.18 
 
 
1397 aa  159  5.0000000000000005e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.46 
 
 
1692 aa  159  6e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  26.48 
 
 
758 aa  158  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03310  GAF domain protein  31.48 
 
 
625 aa  158  7e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0453757  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4127  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 
743 aa  158  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313016  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003637  hypothetical protein  25.7 
 
 
1055 aa  157  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  30.83 
 
 
842 aa  157  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.47 
 
 
1582 aa  157  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.46 
 
 
849 aa  157  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.13 
 
 
1202 aa  157  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.86 
 
 
1266 aa  157  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.6 
 
 
682 aa  156  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4938  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.74 
 
 
686 aa  157  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.269297 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.04 
 
 
1398 aa  156  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 
721 aa  156  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.18 
 
 
738 aa  156  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10700  putative bacteriophytochrome  27.35 
 
 
728 aa  155  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0975  putative bacteriophytochrome  27.01 
 
 
728 aa  155  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  32.56 
 
 
852 aa  155  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3550  hybrid sensory histidine kinase BarA  25.09 
 
 
928 aa  155  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54330  diatom PHytochrome 1  24.06 
 
 
1010 aa  155  8e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.784777  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0082  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24.51 
 
 
866 aa  155  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0375698  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  31.87 
 
 
847 aa  154  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0150  phytochrome sensor signal transduction histidine kinase  25.8 
 
 
752 aa  154  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.48 
 
 
2213 aa  154  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.03 
 
 
914 aa  154  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  31.87 
 
 
847 aa  153  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>