More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG00900 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06443  ABC multidrug transporter (Eurofung)  39.13 
 
 		 1396 aa  1013    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00225  ABC bile acid transporter (Eurofung)  30.52 
 
 		 1667 aa  656    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.400569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77740  predicted protein  37.39 
 
 		 1423 aa  896    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29845  normal  0.287043 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08000  cadmium ion transporter, putative  35.66 
 
 		 1507 aa  696    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00900  ATP-binding cassette transporter protein YOR1, putative  100 
 
 		 1513 aa  3110    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.243628  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40574  predicted protein  35.05 
 
 		 1381 aa  766    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998296  normal  0.051152 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49071  predicted protein  36.37 
 
 		 1458 aa  894    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60398  predicted protein  35.41 
 
 		 1367 aa  847    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.222643  normal  0.152228 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35503  ABC(ABCC) family transporter: multispecific organic anion/multidrug (ABCC)  38.93 
 
 		 1256 aa  615  9.999999999999999e-175  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000589705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20872  predicted protein  40.07 
 
 		 1317 aa  615  9.999999999999999e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.358862  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69625  predicted protein  37.12 
 
 		 1636 aa  610  1e-173  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0930816 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07729  ABC metal ion transporter (Eurofung)  39.82 
 
 		 1535 aa  601  1e-170  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902977  normal  0.265707 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18197  predicted protein  38.79 
 
 		 1168 aa  597  1e-169  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70510  predicted protein  38.96 
 
 		 1549 aa  591  1e-167  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18826  predicted protein  38.6 
 
 		 1135 aa  586  1.0000000000000001e-165  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0391599  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05860  metal resistance protein ycf1, putative  38.32 
 
 		 1587 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10151  predicted protein  32.42 
 
 		 1127 aa  572  1e-161  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00773421  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30251  Multidrug resistance-associated protein/mitoxantrone resistance protein, ABC superfamily  31.54 
 
 		 1640 aa  568  1e-160  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.126285  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36940  predicted protein  36.91 
 
 		 1157 aa  541  9.999999999999999e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43299  predicted protein  28.8 
 
 		 1416 aa  536  1e-150  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545075  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54822  predicted protein  35.79 
 
 		 1549 aa  535  1e-150  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.445899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32401  ATP-dependent transporter  36.54 
 
 		 1573 aa  511  1e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.375187  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00900  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  36.19 
 
 		 1623 aa  484  1e-135  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626607  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9180  predicted protein  35.61 
 
 		 1248 aa  478  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02840  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  33.22 
 
 		 1659 aa  453  1e-125  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.679539  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01370  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  31.28 
 
 		 1705 aa  444  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00015  ABC multidrug transporter (Eurofung)  33.37 
 
 		 1456 aa  431  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00080  ATP-dependent bile acid transporter, putative  32.63 
 
 		 1607 aa  433  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06779  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  31.11 
 
 		 1514 aa  429  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866258 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07879  ABC transporter (Eurofung)  33.49 
 
 		 1557 aa  425  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.185378 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08957  ABC transporter (Eurofung)  35.29 
 
 		 1611 aa  424  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.576912 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07676  ABC bile acid transporter, putative (Eurofung)  30.29 
 
 		 1463 aa  392  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305866  normal  0.770476 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01240  ABC multidrug transporter (Eurofung)  26.82 
 
 		 1115 aa  392  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.921169  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07700  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  37.05 
 
 		 1669 aa  393  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07839  ABC transporter (Eurofung)  28.29 
 
 		 1511 aa  343  1e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.694911  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01270  ABC transporter ABCC.6, putative  30.45 
 
 		 1562 aa  324  6e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18693  predicted protein  32.37 
 
 		 1351 aa  311  5e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.749806  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08150  ABC multidrug transporter (Eurofung)  29.86 
 
 		 1773 aa  223  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.87117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  30.47 
 
 		 669 aa  205  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03608  ABC transporter protein AtrC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y748]  26 
 
 		 1266 aa  204  8e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02349  ATP-binding cassette multidrug transport protein ATRC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G2]  25.43 
 
 		 1284 aa  201  7e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  28.92 
 
 		 672 aa  199  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  28.16 
 
 		 695 aa  198  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  28.22 
 
 		 613 aa  198  7e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  29.06 
 
 		 575 aa  197  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  30.65 
 
 		 607 aa  196  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  29.65 
 
 		 666 aa  195  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  29.06 
 
 		 640 aa  195  7e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  24.13 
 
 		 1194 aa  194  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  28.36 
 
 		 631 aa  193  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  30.43 
 
 		 671 aa  193  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  30.34 
 
 		 592 aa  192  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  29.12 
 
 		 594 aa  192  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.54 
 
 		 589 aa  192  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  29.12 
 
 		 733 aa  191  7e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  26 
 
 		 1228 aa  189  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  28.94 
 
 		 594 aa  189  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  28.57 
 
 		 601 aa  189  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.23 
 
 		 971 aa  188  6e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.22 
 
 		 721 aa  188  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1467  ABC transporter related  27.7 
 
 		 603 aa  188  6e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000245046  normal  0.820859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.89 
 
 		 590 aa  188  7e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.75 
 
 		 670 aa  188  8e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3638  ABC transporter, transmembrane region  28.72 
 
 		 665 aa  188  9e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  28.36 
 
 		 765 aa  187  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  29.21 
 
 		 598 aa  187  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  28.54 
 
 		 637 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  29.07 
 
 		 590 aa  187  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1937  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.06 
 
 		 599 aa  186  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  28.06 
 
 		 811 aa  186  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  28.49 
 
 		 635 aa  186  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  28.91 
 
 		 652 aa  186  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  27.54 
 
 		 623 aa  186  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  28.54 
 
 		 594 aa  186  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  27.05 
 
 		 663 aa  186  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09342  ABC multidrug transporter (Eurofung)  23.58 
 
 		 1323 aa  186  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3070  ABC transporter related  28.95 
 
 		 604 aa  185  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.195979  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  29.01 
 
 		 600 aa  185  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.22 
 
 		 608 aa  185  6e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  28.17 
 
 		 620 aa  184  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  27.1 
 
 		 663 aa  184  8.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  29.39 
 
 		 672 aa  184  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3399  ABC transporter related  27.37 
 
 		 614 aa  184  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1267  ABC transporter related  28.2 
 
 		 623 aa  183  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00288622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  31.08 
 
 		 594 aa  183  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  28.44 
 
 		 606 aa  184  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  28.9 
 
 		 611 aa  183  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  27.83 
 
 		 582 aa  184  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  29.88 
 
 		 600 aa  183  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0100  ABC transporter related  28.37 
 
 		 584 aa  182  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.995912  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.35 
 
 		 589 aa  182  5.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  26.05 
 
 		 626 aa  182  5.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  27.61 
 
 		 597 aa  181  7e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.7 
 
 		 637 aa  181  8e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.37 
 
 		 608 aa  181  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  28.72 
 
 		 587 aa  181  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3227  ABC transporter-related protein  27.75 
 
 		 675 aa  181  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  27.43 
 
 		 597 aa  181  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3379  ABC transporter transmembrane region  27.67 
 
 		 646 aa  181  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  27.5 
 
 		 634 aa  181  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>