More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF04190 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006691  CNF04190  vesicular-fusion protein sec18, putative  100 
 
 
844 aa  1721    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86905  cytoplasmic protein involved in protein transport between ER and Golgi ATPase  45.31 
 
 
794 aa  628  1e-178  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30476  predicted protein  46.73 
 
 
737 aa  593  1e-168  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.59852  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03098  vesicular fusion ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12510)  44.61 
 
 
775 aa  579  1e-164  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.166413  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12620  predicted protein  55.09 
 
 
532 aa  558  1e-157  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41487  predicted protein  44.44 
 
 
550 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00314101  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_3366  predicted protein  58.62 
 
 
225 aa  246  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.851714  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.51 
 
 
738 aa  214  7e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  35.4 
 
 
776 aa  211  6e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.94 
 
 
757 aa  204  4e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.39 
 
 
719 aa  204  7e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33 
 
 
718 aa  204  8e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.56 
 
 
760 aa  203  9.999999999999999e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.04 
 
 
731 aa  201  7e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  32.58 
 
 
739 aa  200  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42768  predicted protein  39.32 
 
 
599 aa  198  3e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.69 
 
 
731 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.2 
 
 
769 aa  195  4e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.41 
 
 
754 aa  194  4e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.47 
 
 
731 aa  194  4e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.73 
 
 
754 aa  194  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.9 
 
 
754 aa  194  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.73 
 
 
768 aa  194  5e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.26 
 
 
739 aa  194  5e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.71 
 
 
754 aa  194  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.57 
 
 
742 aa  194  6e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.38 
 
 
732 aa  194  8e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  32.31 
 
 
699 aa  192  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.47 
 
 
727 aa  192  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  33.93 
 
 
746 aa  192  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  34.22 
 
 
718 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  32.75 
 
 
703 aa  191  4e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  34.4 
 
 
764 aa  191  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.54 
 
 
731 aa  191  7e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.57 
 
 
740 aa  190  9e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.07 
 
 
743 aa  189  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.78 
 
 
740 aa  189  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.04 
 
 
757 aa  188  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  33.99 
 
 
713 aa  188  3e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.82 
 
 
730 aa  188  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.09 
 
 
721 aa  188  4e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.47 
 
 
756 aa  188  4e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.6 
 
 
757 aa  187  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.06 
 
 
763 aa  187  6e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.12 
 
 
723 aa  187  7e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.56 
 
 
755 aa  187  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  34.47 
 
 
763 aa  187  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.55 
 
 
715 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  31.4 
 
 
722 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.11 
 
 
709 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.66 
 
 
804 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.45 
 
 
773 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  35.41 
 
 
703 aa  185  3e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  31.83 
 
 
810 aa  185  3e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13383  predicted protein  55.69 
 
 
164 aa  184  9.000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.65 
 
 
736 aa  182  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  33.71 
 
 
754 aa  182  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.83 
 
 
808 aa  182  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.17 
 
 
701 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.54 
 
 
742 aa  182  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.07 
 
 
759 aa  181  4e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.12 
 
 
801 aa  181  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.73 
 
 
805 aa  181  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.33 
 
 
805 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  34.34 
 
 
829 aa  180  1e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.45 
 
 
806 aa  180  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  32.52 
 
 
806 aa  179  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  33.66 
 
 
804 aa  178  4e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.45 
 
 
735 aa  177  6e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.52 
 
 
738 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.66 
 
 
704 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  33.59 
 
 
814 aa  175  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  34.18 
 
 
810 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3574  vesicle-fusing ATPase  34.3 
 
 
647 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  33.33 
 
 
732 aa  175  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.55 
 
 
781 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  32.92 
 
 
721 aa  174  5e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  30.16 
 
 
639 aa  174  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33 
 
 
736 aa  174  7.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.62 
 
 
737 aa  173  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.73 
 
 
772 aa  172  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.55 
 
 
753 aa  171  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.69 
 
 
738 aa  171  4e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.86 
 
 
800 aa  171  5e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
826 aa  170  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.17 
 
 
781 aa  169  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.96 
 
 
810 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  31.63 
 
 
613 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.15 
 
 
784 aa  168  5e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.9 
 
 
852 aa  167  5.9999999999999996e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.08 
 
 
737 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  42.53 
 
 
407 aa  167  9e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.93 
 
 
801 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  32.74 
 
 
601 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  43.6 
 
 
407 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  38.79 
 
 
412 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0215  vesicle-fusing ATPase  40.16 
 
 
513 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  33.5 
 
 
930 aa  166  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  42.15 
 
 
407 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  39.86 
 
 
412 aa  165  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>