278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA01060 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA01060  ribosomal protein S3, putative  100 
 
 		 252 aa  514  1.0000000000000001e-145  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.229597  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04087  hypothetical protein similar to 40s ribosomal protein s3 (Eurofung)  77.63 
 
 		 264 aa  342  4e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33660  predicted protein  61.02 
 
 		 253 aa  287  1e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.83302  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49305  Ribosomal protein S3, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  65.09 
 
 		 231 aa  286  2e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0399938  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82366  predicted protein  61.07 
 
 		 242 aa  286  2e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0437402 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0104  30S ribosomal protein S3P  35.9 
 
 		 311 aa  125  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2298  30S ribosomal protein S3P  31.73 
 
 		 326 aa  125  8.000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1834  30S ribosomal protein S3P  31.25 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.42538 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2443  30S ribosomal protein S3P  31.73 
 
 		 312 aa  123  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0570  30S ribosomal protein S3P  32.04 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0216  ribosomal protein S3  30.29 
 
 		 335 aa  119  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0448  30S ribosomal protein S3P  35.44 
 
 		 234 aa  118  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0404742  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2224  ribosomal protein S3  29.81 
 
 		 317 aa  118  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0538  30S ribosomal protein S3P  31.72 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172805  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0087  30S ribosomal protein S3P  33.17 
 
 		 231 aa  115  6e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.370765 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1722  30S ribosomal protein S3P  33.5 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0007  30S ribosomal protein S3P  31.52 
 
 		 304 aa  112  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000452289  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2247  30S ribosomal protein S3P  33.99 
 
 		 237 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000824007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1389  30S ribosomal protein S3P  29.25 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1515  ribosomal protein S3  31.71 
 
 		 237 aa  107  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.05815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0174  30S ribosomal protein S3P  30.19 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000147825  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0649  30S ribosomal protein S3P  29.25 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000037377  hitchhiker  0.000300079 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1269  30S ribosomal protein S3P  29.25 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000000296825  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0488  ribosomal protein S3  32.11 
 
 		 187 aa  104  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0715  30S ribosomal protein S3P  27.83 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0204211  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1772  ribosomal protein S3  31.25 
 
 		 229 aa  98.6  8e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0553  30S ribosomal protein S3P  31.88 
 
 		 220 aa  87.4  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0097  30S ribosomal protein S3P  29.79 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000179661  unclonable  0.000000500549 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0747  30S ribosomal protein S3P  31.6 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.641836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1729  30S ribosomal protein S3P  31.67 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0907  30S ribosomal protein S3P  24.02 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0769  30S ribosomal protein S3P  31.67 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0804  30S ribosomal protein S3  26.63 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5079 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  28.22 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  29.35 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  30.46 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  30.46 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  30.46 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  30.46 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  30.95 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  27.46 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1842  ribosomal protein S3  31.76 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000278031  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  27.46 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_002950  PG1932  30S ribosomal protein S3  34.07 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0329  ribosomal protein S3  27.94 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000625588  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0343  ribosomal protein S3  30.22 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000438385  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  30.22 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0809  30S ribosomal protein S3  28.96 
 
 		 224 aa  52.8  0.000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.232608  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  27.37 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1861  30S ribosomal protein S3  28.9 
 
 		 248 aa  52.4  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.10507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00736  30S ribosomal protein S3  31.69 
 
 		 232 aa  52  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2901  ribosomal protein S3  26.74 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0325  30S ribosomal protein S3  24.86 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.85995e-16  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3173  30S ribosomal protein S3  24.4 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000329373  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  26.74 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0285  30S ribosomal protein S3  26.59 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000103964  hitchhiker  0.0000018675 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0202  SSU ribosomal protein S3P  28.16 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0598468  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001736  SSU ribosomal protein S3p (S3e)  31.69 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  25.93 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  29.11 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0255  30S ribosomal protein S3  27.46 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1789  SSU ribosomal protein S3P  29.33 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.309908  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3518  ribosomal protein S3  26.04 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000668296  hitchhiker  0.00000107065 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0065  30S ribosomal protein S3  29.38 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00223028  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  26.74 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3993  30S ribosomal protein S3  24.48 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000371657 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  29.44 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  29.44 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  29.44 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0292  30S ribosomal protein S3  28.32 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00457089  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0326  30S ribosomal protein S3  30.62 
 
 		 232 aa  49.7  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364603  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0065  30S ribosomal protein S3  31.15 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0358705  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  24.47 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  26.55 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2163  ribosomal protein S3  28.41 
 
 		 226 aa  49.7  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0196191  normal  0.200155 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  26.37 
 
 		 237 aa  49.7  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  30.37 
 
 		 224 aa  49.7  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1027  30S ribosomal protein S3  28.65 
 
 		 232 aa  49.7  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000269281  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0333  30S ribosomal protein S3  27.45 
 
 		 266 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000255455  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3453  30S ribosomal protein S3  27.45 
 
 		 266 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000212964  decreased coverage  0.00445176 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0282  30S ribosomal protein S3  27.45 
 
 		 266 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000274054  normal  0.0275687 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2753  30S ribosomal protein S3  27.45 
 
 		 266 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000356119  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  26.59 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0273  30S ribosomal protein S3  27.45 
 
 		 266 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00291944  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  27.27 
 
 		 222 aa  49.3  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0354  30S ribosomal protein S3  27.45 
 
 		 266 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000020511  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0237  30S ribosomal protein S3  31.52 
 
 		 230 aa  49.3  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  30.1 
 
 		 228 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0205  30S ribosomal protein S3  31.52 
 
 		 230 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000415064  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0200  30S ribosomal protein S3  31.52 
 
 		 230 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00835555  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2075  30S ribosomal protein S3  29.48 
 
 		 233 aa  48.9  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000597186  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0205  30S ribosomal protein S3  31.52 
 
 		 230 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  hitchhiker  0.00000000149632 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1771  30S ribosomal protein S3  28.65 
 
 		 232 aa  48.9  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000585037  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4921  ribosomal protein S3  29.09 
 
 		 230 aa  48.9  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0969238  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3013  30S ribosomal protein S3  25.41 
 
 		 264 aa  48.9  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000335081  decreased coverage  0.002387 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0590  30S ribosomal protein S3  29.94 
 
 		 232 aa  48.5  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336971  normal  0.465615 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2944  30S ribosomal protein S3  25.41 
 
 		 264 aa  48.9  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012288  decreased coverage  0.000000133007 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3311  30S ribosomal protein S3  25 
 
 		 265 aa  48.5  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000058787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3291  30S ribosomal protein S3  25.41 
 
 		 262 aa  48.5  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000159884  hitchhiker  0.00000252184 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  29.94 
 
 		 232 aa  48.5  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>