More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1094 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1094  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 223 aa  443  1e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.331299  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0872  hypothetical protein  85.65 
 
 		 286 aa  368  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000507301  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1037  phage integrase family site specific recombinase  97.14 
 
 		 116 aa  204  6e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0617  phage integrase family site specific recombinase  40.09 
 
 		 329 aa  146  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0000798153  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3749  phage integrase family protein  36.65 
 
 		 318 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00852374  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1268  integrase family protein  33.78 
 
 		 353 aa  107  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0843  phage integrase family site specific recombinase  35.71 
 
 		 354 aa  106  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00824905  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1991  metallo-beta-lactamase family protein  34.38 
 
 		 353 aa  104  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2090  transport protein  33.48 
 
 		 353 aa  101  8e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0326537  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0105  hydrogenase expression/formation protein  33.48 
 
 		 354 aa  101  9e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0735  integrase/recombinase  34.38 
 
 		 355 aa  92  6e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000138239  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0879  phage integrase family site specific recombinase  33.93 
 
 		 354 aa  91.3  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159654  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0950  phage integrase family site specific recombinase  33.93 
 
 		 354 aa  91.3  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0218535  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1012  phage integrase family site specific recombinase  33.93 
 
 		 354 aa  90.5  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000959514  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1132  phage integrase family site specific recombinase  31.7 
 
 		 352 aa  89.7  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3096  tyrosine recombinase XerD subunit  29.31 
 
 		 311 aa  89.4  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00033868  normal  0.385268 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  30 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.64 
 
 		 322 aa  82.4  0.000000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  32.7 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  30.25 
 
 		 293 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  28.75 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  28.19 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  28.19 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  30.99 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1145  tyrosine recombinase, phage integrase family  28.83 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00135559  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  28.57 
 
 		 284 aa  75.1  0.0000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  30.23 
 
 		 270 aa  75.1  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0687  Phage integrase  32.9 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.004827  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.67 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  34.1 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  30.46 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  29.19 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.67 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.67 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.32 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.67 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.67 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.96 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  29.19 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  30.77 
 
 		 292 aa  72  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  27.32 
 
 		 296 aa  72  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0015  Phage integrase  27.51 
 
 		 310 aa  72  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.230922  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.32 
 
 		 318 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.11 
 
 		 328 aa  72  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.32 
 
 		 318 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.32 
 
 		 318 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.06 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.06 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.06 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.06 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.06 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  28.44 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.57 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  28 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  29.67 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  26.67 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.27 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  25.88 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.81 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.75 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  31.01 
 
 		 326 aa  68.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7620  integrase family protein  25.96 
 
 		 343 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12664  integrase  26.37 
 
 		 332 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000304658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6955  integrase family protein  25.96 
 
 		 343 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  29.52 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.51 
 
 		 321 aa  68.6  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  27.11 
 
 		 289 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  27.48 
 
 		 300 aa  68.6  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1902  phage integrase  24.52 
 
 		 293 aa  68.2  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  29.45 
 
 		 303 aa  68.2  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  29.95 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  28.12 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  27.84 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  30.06 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.41 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  27.31 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  26.42 
 
 		 303 aa  67  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  27.46 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  31.51 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  26.63 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1554  integrase family protein  31.17 
 
 		 339 aa  67  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.86595  decreased coverage  0.00111318 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  26.52 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  28.74 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  29.02 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  26.29 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  28.65 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1317  phage integrase family protein  27.4 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  26.58 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  25.5 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2271  phage integrase family protein  25.96 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  27.17 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  29.38 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  29.45 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  29.38 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  26.18 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.88 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0674  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.39 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2933  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.21 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2064  phage integrase  24.55 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>