More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2149 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1645  signal transduction protein  56.69 
 
 
773 aa  895    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000104597  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2149  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 
786 aa  1587    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.78 
 
 
1466 aa  292  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.765492  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1710  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.59 
 
 
720 aa  286  7e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.425295  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2003  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.04 
 
 
770 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000215856  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5032  hypothetical protein  34.84 
 
 
892 aa  284  6.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5197  sensory box/GGDEF family protein  34.84 
 
 
892 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.619616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5593  sensory box/GGDEF family protein  34.84 
 
 
892 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05432  hypothetical protein  32.8 
 
 
915 aa  282  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5048  sensory box/GGDEF family protein  35.07 
 
 
892 aa  283  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1647  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  28.26 
 
 
750 aa  280  6e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0560963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5441  sensory box/GGDEF family protein  35.17 
 
 
735 aa  279  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4327  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.35 
 
 
916 aa  277  4e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0127578 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4217  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.35 
 
 
916 aa  277  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5527  sensory box/GGDEF family protein  35.43 
 
 
604 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5479  sensory box/GGDEF family protein  34.46 
 
 
892 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1533  sensory box protein  33.8 
 
 
965 aa  273  7e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76081  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0672  sensory box protein  34.7 
 
 
1276 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321974  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0704  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.7 
 
 
1276 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.116377  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0703  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.7 
 
 
1276 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26462  normal  0.0640291 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4631  sensory box/GGDEF domain/EAL domain protein  34.25 
 
 
1278 aa  272  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4876  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.92 
 
 
1282 aa  272  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0958088  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0088  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.54 
 
 
1108 aa  272  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0221086  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3328  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.7 
 
 
711 aa  271  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0458  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.56 
 
 
1037 aa  270  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160814  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4512  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.93 
 
 
1276 aa  271  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.292373  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2972  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.82 
 
 
761 aa  270  8e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.542463  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3255  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.59 
 
 
774 aa  270  8.999999999999999e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.449187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3192  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.81 
 
 
736 aa  270  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4512  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.71 
 
 
960 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4493  PAS:GGDEF  33.26 
 
 
972 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.267938  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5146  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.71 
 
 
892 aa  269  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4265  PAS:GGDEF  34.25 
 
 
1278 aa  267  7e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2447  signal transduction protein  33.73 
 
 
965 aa  267  7e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.936876  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0693  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  35.17 
 
 
646 aa  267  7e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2314  sensory box/GGDEF family protein  33.94 
 
 
912 aa  266  8e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.6229  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7110  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.03 
 
 
694 aa  266  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0633557 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0946  sensory box/GGDEF family protein  34.16 
 
 
842 aa  266  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0760  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.41 
 
 
1404 aa  266  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.231921  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0528  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.11 
 
 
707 aa  266  1e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0672  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  33.7 
 
 
646 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0388  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.58 
 
 
790 aa  266  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0159193 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2272  sensory box/GGDEF family protein  33.71 
 
 
912 aa  265  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.82349  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07910  intracellular signalling protein with diguanylate cyclase and phosphodiesterase activities  32.65 
 
 
802 aa  265  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.909152  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2242  diguanylate cyclase  35.36 
 
 
961 aa  265  2e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.031286  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0703  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  33.7 
 
 
646 aa  265  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.879487 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2357  sensory box/GGDEF family protein  33.48 
 
 
912 aa  265  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3133  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.06 
 
 
658 aa  265  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2533  sensory box/GGDEF family protein  33.48 
 
 
912 aa  265  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5242  motility regulator  33.03 
 
 
1410 aa  265  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1451  sensory box/ggdef family  33.94 
 
 
914 aa  264  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000257716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0659  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  33.41 
 
 
646 aa  265  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2548  sensory box/GGDEF family protein  33.71 
 
 
828 aa  264  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19879e-34 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.05 
 
 
1355 aa  264  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60870  motility regulator  32.8 
 
 
1415 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.739569  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2024  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.53 
 
 
665 aa  264  6e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3847  sensory box/ggdef family  33.49 
 
 
906 aa  263  8e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1311  hypothetical protein  32.33 
 
 
792 aa  263  8e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.82 
 
 
695 aa  263  8e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2048  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.11 
 
 
827 aa  263  8e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589876  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3306  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.58 
 
 
883 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.660449  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1752  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.18 
 
 
659 aa  263  8.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0247  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.18 
 
 
890 aa  263  8.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37050  PAS domain S-box/diguanylate cyclase (GGDEF) domain-containing protein  33.72 
 
 
919 aa  263  8.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.790153  normal  0.0286025 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3018  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.26 
 
 
1147 aa  263  8.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3284  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  32.67 
 
 
645 aa  262  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000411961 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0662  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.09 
 
 
742 aa  262  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.47145e-25 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1308  hypothetical protein  32.09 
 
 
792 aa  263  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0488  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.73 
 
 
685 aa  263  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3722  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.69 
 
 
727 aa  263  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6063  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  34.16 
 
 
913 aa  263  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0041  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.26 
 
 
1094 aa  263  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0626  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.62 
 
 
856 aa  262  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3594  sensory box/GGDEF family protein  33.56 
 
 
911 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3494  sensory box/GGDEF family protein  33.56 
 
 
911 aa  262  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0435317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3506  sensory box/GGDEF family protein  33.56 
 
 
911 aa  262  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.143738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3879  sensory box/GGDEF family protein  33.56 
 
 
911 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1062  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.2 
 
 
1027 aa  262  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.782086  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2997  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  31.67 
 
 
876 aa  262  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3681  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  33.48 
 
 
650 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2565  two component signal transduction response regulator  31.02 
 
 
703 aa  261  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1946  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.94 
 
 
722 aa  261  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146362  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2146  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.28 
 
 
709 aa  261  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3761  sensory box/GGDEF family protein  33.56 
 
 
908 aa  261  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000038986 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3344  signal transduction protein  34.71 
 
 
1055 aa  261  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.8 
 
 
743 aa  261  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.766687  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4297  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.11 
 
 
734 aa  261  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.92876  hitchhiker  0.00384983 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1577  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.63 
 
 
911 aa  261  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.286617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2629  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.07 
 
 
821 aa  261  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000585262  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2327  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.94 
 
 
1158 aa  261  5.0000000000000005e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3794  sensory box/GGDEF family protein  33.1 
 
 
908 aa  260  6e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.620688  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0926  sensory box protein  33.33 
 
 
1063 aa  260  6e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3912  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  32.01 
 
 
1209 aa  260  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3630  sensory box/GGDEF family protein  33.41 
 
 
828 aa  260  7e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.931883  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0568  diguanylate cyclase  34.81 
 
 
586 aa  260  8e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0680  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  32.48 
 
 
651 aa  259  9e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3781  sensory box/GGDEF family protein  33.1 
 
 
910 aa  260  9e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.424975  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7654  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.33 
 
 
892 aa  260  9e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.577778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.79 
 
 
574 aa  259  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0649  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.86 
 
 
742 aa  259  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>