More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1640 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



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Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_1640  mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 173 aa  343  6e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0204845  n/a   
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  98.84 
 
 		 173 aa  339  1e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
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NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  37.89 
 
 		 261 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  32.5 
 
 		 534 aa  90.9  9e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  38.22 
 
 		 330 aa  86.3  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  35.33 
 
 		 270 aa  85.9  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011726  PCC8801_2771  MscS Mechanosensitive ion channel  34.87 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  35.67 
 
 		 334 aa  82  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  33.85 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  31.29 
 
 		 533 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 		 406 aa  81.6  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1853  MscS mechanosensitive ion channel  33.55 
 
 		 290 aa  81.3  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  31.79 
 
 		 304 aa  80.9  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  30.77 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  33.97 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  35.33 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02189  hypothetical protein  34.48 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  35.04 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  32.39 
 
 		 538 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  32.61 
 
 		 544 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  33.57 
 
 		 624 aa  77.8  0.00000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  35 
 
 		 274 aa  78.2  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  33.06 
 
 		 540 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  35.97 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  40.48 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  31.76 
 
 		 547 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  29.37 
 
 		 532 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  28.47 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  35.04 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2128  MscS mechanosensitive ion channel  33.77 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  45.68 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  30.99 
 
 		 547 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0226  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  41.25 
 
 		 473 aa  75.1  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.512445  normal  0.203081 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  35.2 
 
 		 350 aa  74.3  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  32.64 
 
 		 373 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  30.41 
 
 		 549 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  30.41 
 
 		 549 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13183  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  31.58 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  30.41 
 
 		 549 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  29.85 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 551 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 551 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  30.72 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
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NC_013926  Aboo_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  33.52 
 
 		 484 aa  73.2  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  39.64 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 550 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  29.37 
 
 		 563 aa  72  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  33.79 
 
 		 338 aa  72.4  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1730  MscS Mechanosensitive ion channel  30.22 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.351236  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  29.86 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0773  MscS mechanosensitive ion channel  40.66 
 
 		 401 aa  72.4  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  43.21 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0767  small-conductance mechanosensitive ion channel  39.56 
 
 		 401 aa  72  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.967765  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  29.48 
 
 		 344 aa  72  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0015  MscS mechanosensitive ion channel  30.07 
 
 		 287 aa  72  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0330  hypothetical protein  42.35 
 
 		 287 aa  71.6  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  29.05 
 
 		 275 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1496  MscS Mechanosensitive ion channel  33.12 
 
 		 295 aa  70.9  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  37.38 
 
 		 304 aa  70.9  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 362 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  27.81 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  35.77 
 
 		 1166 aa  70.1  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  34.74 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  34.4 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  32.17 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  29.73 
 
 		 806 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  33.1 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2422  MscS mechanosensitive ion channel  28.9 
 
 		 572 aa  69.7  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00678  mechanosensitive ion channel family protein  31.98 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.096226  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  29.37 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  32.56 
 
 		 843 aa  68.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  38.46 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0427  MscS mechanosensitive ion channel  30.88 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0918944  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  31.88 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
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NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  32.32 
 
 		 1111 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
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NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  29.53 
 
 		 561 aa  68.9  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  32.17 
 
 		 288 aa  68.6  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_1189  MscS Mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 		 445 aa  68.6  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 298 aa  68.6  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 288 aa  68.6  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  27.21 
 
 		 275 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  27.03 
 
 		 280 aa  68.2  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  30.36 
 
 		 682 aa  68.2  0.00000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_0421  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1115 aa  68.2  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.693078  hitchhiker  0.0000017841 
 
 
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NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  28.38 
 
 		 275 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  36.89 
 
 		 270 aa  67.8  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 362 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  34.11 
 
 		 307 aa  67.8  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  29.66 
 
 		 275 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_2666  MscS Mechanosensitive ion channel  28.03 
 
 		 911 aa  67.8  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.232424  normal  0.397707 
 
 
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NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  27.94 
 
 		 633 aa  67.4  0.00000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  32.2 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
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NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  33.76 
 
 		 308 aa  67  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
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