181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06295 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_06295  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 200 aa  403  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05280  short chain dehydrogenase  62.12 
 
 		 200 aa  267  5.9999999999999995e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0657  short chain dehydrogenase  49.25 
 
 		 202 aa  197  9e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.769936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5629  short chain dehydrogenase  45.23 
 
 		 198 aa  187  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1238  short chain dehydrogenase  43.43 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4312  short chain dehydrogenase  42.71 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50610  short chain dehydrogenase  42.21 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0391945 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3670  short chain dehydrogenase  41.5 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3793  short chain dehydrogenase  41.5 
 
 		 207 aa  175  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0789  short chain dehydrogenase  42 
 
 		 205 aa  168  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1664  short chain dehydrogenase  37.88 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl362  short chain dehydrogenase  45.05 
 
 		 202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.68833e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0313  short chain dehydrogenase  40.51 
 
 		 199 aa  165  5e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0297  short chain dehydrogenase  40.51 
 
 		 199 aa  165  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3138  short chain dehydrogenase  39.39 
 
 		 200 aa  165  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4883  short chain dehydrogenase  39 
 
 		 202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2493  short chain dehydrogenase  39.5 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5475  short chain dehydrogenase  39.5 
 
 		 202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5387  short chain dehydrogenase  39.5 
 
 		 202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3331  short chain dehydrogenase  40.5 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4284  short chain dehydrogenase  37.56 
 
 		 201 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.206363 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4306  short chain dehydrogenase  40.1 
 
 		 197 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1726  short chain dehydrogenase  38.5 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0613  short chain dehydrogenase  37.06 
 
 		 201 aa  158  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0886445 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4448  short chain dehydrogenase  37.56 
 
 		 201 aa  158  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2512  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296656  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0927  short chain dehydrogenase  35.5 
 
 		 200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.115438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3526  short chain dehydrogenase  42.11 
 
 		 233 aa  153  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0150103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2520  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0216463  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3613  short chain dehydrogenase  44.65 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3200  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1873  short chain dehydrogenase  37.56 
 
 		 201 aa  141  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2619  short chain dehydrogenase  38.27 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6188  short chain dehydrogenase  43.86 
 
 		 198 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1736  short chain dehydrogenase  37.37 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.157452 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1778  short chain dehydrogenase  40.1 
 
 		 202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  26.53 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2087  short chain dehydrogenase  28.98 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.319948  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  28.11 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  28.41 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.97 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2086  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.59 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879174  normal  0.332592 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.06 
 
 		 238 aa  62  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2779  short chain dehydrogenase  29.02 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000967722 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2546  short chain dehydrogenase  27.98 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3870  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.97 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.213287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.51 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.92 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.06 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5398  short chain dehydrogenase  24.5 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.448232  normal  0.960589 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1392  short chain dehydrogenase  22.35 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.11 
 
 		 256 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.01 
 
 		 246 aa  54.7  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.49 
 
 		 238 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1106  short chain dehydrogenase  23.7 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.256004  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1548  short chain dehydrogenase  23.7 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0211  short chain dehydrogenase  23.7 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0327074  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0953  short chain dehydrogenase  23.7 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.04 
 
 		 288 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306467  normal  0.765133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.42 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.49 
 
 		 249 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 		 259 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.95 
 
 		 248 aa  52.4  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1880  short chain dehydrogenase  23.7 
 
 		 270 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0386097  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.9 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.261739  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0938  Short-chain alcohol dehydrogenase  23.9 
 
 		 242 aa  52.4  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1701  short chain dehydrogenase  23.12 
 
 		 240 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1727  short chain dehydrogenase  23.12 
 
 		 240 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.98 
 
 		 255 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1592  short chain dehydrogenase  26.83 
 
 		 236 aa  52  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.512946  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1917  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  24.31 
 
 		 293 aa  51.6  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.54 
 
 		 241 aa  51.2  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.68 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.996874 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0259  hypothetical protein  23.7 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.99 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.35 
 
 		 257 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.79 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1352  short chain dehydrogenase  23.33 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297804  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.96 
 
 		 258 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.58 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.100156  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.58 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0985  short chain dehydrogenase  23.97 
 
 		 237 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1445  short chain dehydrogenase  23.97 
 
 		 237 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1467  short chain dehydrogenase  23.97 
 
 		 237 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2606  short chain dehydrogenase  23.33 
 
 		 240 aa  48.5  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.19 
 
 		 286 aa  48.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.46 
 
 		 285 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11398  normal  0.546447 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.46 
 
 		 285 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  normal  0.0427159 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2124  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.46 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  hitchhiker  0.0000985136 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0264  hypothetical protein  23.12 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3542  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.49 
 
 		 249 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0247071  normal  0.033589 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3131  short chain dehydrogenase  31.62 
 
 		 250 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.17 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0910719 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3239  short chain dehydrogenase  32.17 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161967  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.59 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.64 
 
 		 274 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 		 291 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.60014  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.92 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>