More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1369 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1369  ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 371 aa  719    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.30886  normal  0.0719579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5242  inner-membrane translocator  97.84 
 
 		 371 aa  644    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1168  inner-membrane translocator  64.25 
 
 		 369 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.748447  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1359  ABC transporter, permease protein  63.91 
 
 		 370 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5657  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  59.18 
 
 		 392 aa  355  6.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.348277  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4621  putative ABC transporter (permease protein)  58.61 
 
 		 369 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4475  inner-membrane translocator  56.93 
 
 		 375 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.973671 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6456  inner-membrane translocator  56.64 
 
 		 375 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.425632  normal  0.0359026 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1116  inner-membrane translocator  58.75 
 
 		 382 aa  325  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0271  inner-membrane translocator  59.35 
 
 		 353 aa  321  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0872978  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0768  ABC transporter permease protein  57.89 
 
 		 365 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0852  inner-membrane translocator  52.79 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0837  inner-membrane translocator  58.1 
 
 		 359 aa  290  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3025  inner-membrane translocator  59.02 
 
 		 370 aa  275  6e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2021  inner-membrane translocator  58.26 
 
 		 385 aa  251  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1702  inner-membrane translocator  58.26 
 
 		 385 aa  250  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.122598 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.08 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  34.39 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 355 aa  159  8e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  37.15 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  34.72 
 
 		 373 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.73 
 
 		 360 aa  155  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  36.13 
 
 		 357 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  36.33 
 
 		 349 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  33.24 
 
 		 366 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  31.69 
 
 		 354 aa  152  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  32.9 
 
 		 361 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 368 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 352 aa  146  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.25 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  32.63 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  29.34 
 
 		 391 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  31.76 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  33.03 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  29.94 
 
 		 357 aa  143  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 347 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 354 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  29.34 
 
 		 367 aa  139  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  26.77 
 
 		 359 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  34 
 
 		 369 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  35.52 
 
 		 368 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  32.33 
 
 		 358 aa  137  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 349 aa  135  9e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  32.1 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  32.28 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  29.48 
 
 		 361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 369 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  32.18 
 
 		 360 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 360 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  34.01 
 
 		 369 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 347 aa  132  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  32.83 
 
 		 350 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 360 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  35.22 
 
 		 363 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  31.13 
 
 		 360 aa  129  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  30.86 
 
 		 364 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  32.54 
 
 		 368 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  34.46 
 
 		 364 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  32.76 
 
 		 360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  32.93 
 
 		 368 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  28.53 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  28.92 
 
 		 364 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 371 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.13 
 
 		 349 aa  127  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 349 aa  126  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  29.19 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2446  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 357 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  30.5 
 
 		 358 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  29.11 
 
 		 365 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  31.97 
 
 		 361 aa  124  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  31.74 
 
 		 360 aa  123  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  30.74 
 
 		 387 aa  124  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  26.11 
 
 		 362 aa  123  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 355 aa  122  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3456  inner-membrane translocator  33.98 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0696875 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  32.55 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1764  inner-membrane translocator  32.85 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382109  normal  0.473467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  30.95 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  30.99 
 
 		 471 aa  120  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 363 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1484  inner-membrane translocator  32.39 
 
 		 370 aa  121  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0529848 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  32.17 
 
 		 365 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 363 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  31.07 
 
 		 369 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  29.65 
 
 		 344 aa  120  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  34.83 
 
 		 349 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2657  inner-membrane translocator  32.47 
 
 		 354 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.142958  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  32.75 
 
 		 362 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  30.4 
 
 		 352 aa  119  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0562  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 340 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 362 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  34.14 
 
 		 349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  28.53 
 
 		 366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4443  inner-membrane translocator  30.91 
 
 		 363 aa  116  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  27.33 
 
 		 365 aa  116  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>