More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3155 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  100 
 
 
273 aa  568  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  80.51 
 
 
272 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  47.87 
 
 
281 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  47.87 
 
 
281 aa  248  7e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  47.87 
 
 
292 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  41.03 
 
 
265 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  43.4 
 
 
291 aa  222  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  44.26 
 
 
293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  40.44 
 
 
259 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  38.83 
 
 
268 aa  185  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  38.77 
 
 
266 aa  185  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  38.97 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  40.44 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  37.45 
 
 
269 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  36.36 
 
 
276 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  36.36 
 
 
276 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  39.63 
 
 
266 aa  175  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  37.68 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  38.6 
 
 
264 aa  172  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  41.67 
 
 
259 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  38.89 
 
 
266 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  41.67 
 
 
259 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  39.11 
 
 
263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  38.04 
 
 
272 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  37.17 
 
 
273 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  36.84 
 
 
273 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  36.07 
 
 
287 aa  152  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  36.23 
 
 
265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  35.71 
 
 
286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  35.71 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  38.75 
 
 
282 aa  145  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  36.17 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  38.52 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  36.1 
 
 
274 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  33.1 
 
 
326 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  34.77 
 
 
279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  33.82 
 
 
278 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  32.38 
 
 
274 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  36.46 
 
 
274 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  30.96 
 
 
274 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  35.64 
 
 
275 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  31.12 
 
 
272 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  34.04 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  36.1 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  31.43 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  35.51 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  30.11 
 
 
272 aa  130  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  30.69 
 
 
323 aa  128  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  29.93 
 
 
272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  35.32 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  33.09 
 
 
268 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  33.21 
 
 
273 aa  125  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  32.24 
 
 
316 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  34.04 
 
 
270 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  32.5 
 
 
273 aa  123  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  31.91 
 
 
265 aa  122  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  33.46 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  28.67 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  34.4 
 
 
273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  33.58 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  29.17 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  35.69 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  27.85 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  32.7 
 
 
361 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  32.91 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  32.91 
 
 
367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3679  transglutaminase domain protein  30.72 
 
 
299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  28.87 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  31.75 
 
 
352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2560  transglutaminase-like  31.35 
 
 
319 aa  112  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507077  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0199  transglutaminase domain-containing protein  30.47 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2639  transglutaminase domain-containing protein  33.22 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42963  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  28.38 
 
 
295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  31.55 
 
 
352 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  31.23 
 
 
344 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  28.88 
 
 
275 aa  109  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0045  transglutaminase-like protein  33.33 
 
 
300 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607602  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0069  transglutaminase-like  33.22 
 
 
303 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3417  transglutaminase domain-containing protein  30.16 
 
 
300 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.331503  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3726  transglutaminase domain protein  30.49 
 
 
300 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.262067 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  27.24 
 
 
318 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  30.63 
 
 
280 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3610  transglutaminase domain protein  29.03 
 
 
298 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  hitchhiker  0.0089149  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2551  transglutaminase domain-containing protein  31.06 
 
 
319 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138061  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0590  transglutaminase-like  30.3 
 
 
297 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.92131  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2133  transglutaminase domain-containing protein  29.24 
 
 
283 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00733647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4924  transglutaminase-like domain protein  30.16 
 
 
297 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5373  transglutaminase domain protein  31.14 
 
 
304 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1494  transglutaminase domain protein  27.05 
 
 
304 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  28.91 
 
 
300 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3407  transglutaminase domain protein  28.48 
 
 
326 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5721  transglutaminase domain protein  29.79 
 
 
292 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  27.54 
 
 
299 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1063  transglutaminase domain-containing protein  28.57 
 
 
332 aa  102  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  26.95 
 
 
279 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2949  putative transaminase-like enzyme  30.95 
 
 
292 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3280  transglutaminase domain-containing protein  31.49 
 
 
292 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.867984 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  30.67 
 
 
292 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  28.39 
 
 
292 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0657  transglutaminase domain-containing protein  31.31 
 
 
297 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>