281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6928 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  100 
 
 		 265 aa  542  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  77.33 
 
 		 247 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  49.33 
 
 		 250 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  46.12 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  46.44 
 
 		 251 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  43.62 
 
 		 241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  43.78 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  43.83 
 
 		 256 aa  208  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  43.21 
 
 		 241 aa  208  8e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  45.2 
 
 		 246 aa  208  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  44.26 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  43.8 
 
 		 246 aa  206  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  43.1 
 
 		 247 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  42.34 
 
 		 246 aa  205  7e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  42.34 
 
 		 246 aa  205  7e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  43.39 
 
 		 246 aa  204  9e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  43.39 
 
 		 246 aa  204  9e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  47.32 
 
 		 241 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  41.98 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  45.26 
 
 		 236 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  45.98 
 
 		 245 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  45.98 
 
 		 240 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  43.04 
 
 		 253 aa  198  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  46.26 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  46.25 
 
 		 243 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  44.35 
 
 		 244 aa  191  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1152  putative pili assembly chaperone protein  38.6 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  40.16 
 
 		 260 aa  178  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  40 
 
 		 243 aa  176  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  39.21 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.52 
 
 		 266 aa  176  5e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  39.52 
 
 		 266 aa  175  8e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  38.77 
 
 		 253 aa  175  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  38.77 
 
 		 253 aa  175  9e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  41.46 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  39.09 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  39.09 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  39.09 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  41.88 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  42.59 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  37.34 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  40.91 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  42.52 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  34.45 
 
 		 245 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  34.45 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2656  pili assembly chaperone  35.71 
 
 		 267 aa  158  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0266347 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1790  pili assembly chaperone  35.71 
 
 		 267 aa  158  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0241556  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1679  pili assembly chaperone  35.34 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  39.07 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  38.52 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  34.03 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.91 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  36.68 
 
 		 243 aa  149  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  36.68 
 
 		 243 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  34.78 
 
 		 225 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2273  pili assembly chaperone  36.29 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  36.68 
 
 		 243 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2164  pili assembly chaperone  36.29 
 
 		 243 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11090  chaperone CupB4  35.81 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.97 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  37.95 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.56 
 
 		 266 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  37.83 
 
 		 237 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0167  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.25 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1663  pili assembly chaperone  33.9 
 
 		 275 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.44583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1017  chaperone CupB4  36.7 
 
 		 250 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.23 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.23 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  39.04 
 
 		 226 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  32.62 
 
 		 242 aa  142  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1276  gram-negative pili assembly chaperone  33.8 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.315526 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  35.91 
 
 		 228 aa  139  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  36.48 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  36.48 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  36.48 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  32.5 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  35.44 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  36.48 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  34.07 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  36.28 
 
 		 248 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.48 
 
 		 241 aa  136  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  32.35 
 
 		 264 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  35.68 
 
 		 267 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  37.33 
 
 		 248 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  37.56 
 
 		 253 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  37.56 
 
 		 267 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2276  pili assembly chaperone  36.81 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00485473  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2167  pili assembly chaperone  36.81 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000797941  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  33.74 
 
 		 232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  33.74 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  33.74 
 
 		 232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  37.56 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  37.56 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  36.13 
 
 		 234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  33.74 
 
 		 232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1134  pili assembly chaperone  36.17 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  0.162532 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1272  gram-negative pili assembly chaperone  35.56 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  36.13 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  36.68 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  35.02 
 
 		 227 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>