More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6116 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6116  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 440 aa  873    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2313  major facilitator superfamily tartrate/H(+)symporter  95.68 
 
 		 440 aa  818    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00746329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  44.77 
 
 		 433 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  45.82 
 
 		 432 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 436 aa  353  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 442 aa  353  5e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  43.93 
 
 		 441 aa  349  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  46.65 
 
 		 435 aa  344  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  44.6 
 
 		 432 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  42 
 
 		 432 aa  336  5.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  45.41 
 
 		 432 aa  330  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  42.48 
 
 		 433 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 437 aa  329  6e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6712  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 449 aa  329  7e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  46 
 
 		 439 aa  327  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  42.21 
 
 		 428 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  42.65 
 
 		 441 aa  325  9e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2717  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 454 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.773246  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  44.71 
 
 		 432 aa  324  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8324  major facilitator superfamily MFS_1  41.4 
 
 		 444 aa  324  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.822515  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  43.44 
 
 		 424 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2715  major facilitator transporter  43.13 
 
 		 440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0840  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 459 aa  320  3e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  43.56 
 
 		 444 aa  319  5e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  45.61 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  45.26 
 
 		 443 aa  318  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  43.17 
 
 		 440 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  41.69 
 
 		 443 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  43.73 
 
 		 430 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  42.43 
 
 		 441 aa  317  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  42.59 
 
 		 449 aa  316  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  43.04 
 
 		 444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  39.45 
 
 		 437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_003296  RS04694  transporter transmembrane protein  42.14 
 
 		 453 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0882283  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  43.71 
 
 		 439 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  42.39 
 
 		 450 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1996  major facilitator transporter  41.4 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  43.59 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  38.99 
 
 		 435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  40 
 
 		 437 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0353  major facilitator transporter  41.29 
 
 		 428 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  41.85 
 
 		 428 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  43.34 
 
 		 435 aa  310  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0364  major facilitator transporter  41.29 
 
 		 428 aa  310  5e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.305692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0374  major facilitator transporter  41.29 
 
 		 428 aa  310  5e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5134  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 436 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2592  major facilitator transporter  43.18 
 
 		 466 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132896  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 436 aa  309  6.999999999999999e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  42.49 
 
 		 445 aa  309  8e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  42.37 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  41.35 
 
 		 436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 434 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  38.77 
 
 		 443 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  41.95 
 
 		 439 aa  306  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3203  major facilitator transporter  42 
 
 		 458 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  41.22 
 
 		 440 aa  306  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  41.12 
 
 		 428 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 434 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 434 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8320  major facilitator superfamily MFS_1  43.38 
 
 		 444 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 434 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3541  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  40.72 
 
 		 439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3978  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0632064 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 		 439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  40.42 
 
 		 440 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  38.33 
 
 		 433 aa  303  5.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  38.33 
 
 		 433 aa  302  6.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 445 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1999  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 443 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0211395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 441 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.23 
 
 		 439 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  39.04 
 
 		 437 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7538  major facilitator superfamily MFS_1  43.18 
 
 		 430 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00256699  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  43.78 
 
 		 435 aa  300  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  41.48 
 
 		 444 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 434 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6697  major facilitator transporter  40.91 
 
 		 442 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6030  major facilitator transporter  39.66 
 
 		 459 aa  299  6e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708548  normal  0.0969149 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5479  major facilitator transporter  40.71 
 
 		 452 aa  299  7e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0112056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  38.22 
 
 		 454 aa  299  8e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  40.54 
 
 		 441 aa  299  8e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  40.54 
 
 		 441 aa  299  8e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4924  major facilitator transporter  40.71 
 
 		 452 aa  298  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.533703 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 426 aa  298  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4251  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 447 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  40.25 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  40.54 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2542  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 437 aa  298  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  42.28 
 
 		 441 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  42.28 
 
 		 441 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  40.54 
 
 		 434 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  41.81 
 
 		 435 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5619  major facilitator transporter  41.85 
 
 		 439 aa  296  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  39.6 
 
 		 443 aa  297  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 441 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>