More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6576 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6576  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 583 aa  1178    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.298955 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1504  putative choline dehydrogenase  77.86 
 
 		 591 aa  885    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228546  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6155  glucose-methanol-choline oxidoreductase  77.96 
 
 		 559 aa  886    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  66.49 
 
 		 564 aa  732    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.833385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6668  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.85 
 
 		 576 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.1 
 
 		 577 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1311  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.04 
 
 		 570 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.139852 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4733  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.44 
 
 		 568 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4787  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.6 
 
 		 573 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.824401  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4242  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.65 
 
 		 549 aa  365  1e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.252805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4100  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.44 
 
 		 515 aa  262  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0908626  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6778  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.19 
 
 		 539 aa  260  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4076  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.82 
 
 		 516 aa  257  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00359507  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0102  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.28 
 
 		 518 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.77 
 
 		 546 aa  250  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.296115 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6980  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.89 
 
 		 556 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0315325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06179  choline dehydrogenase  31.23 
 
 		 569 aa  248  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6322  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.89 
 
 		 556 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000364  choline dehydrogenase  30.98 
 
 		 571 aa  247  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1507  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.89 
 
 		 548 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.23617  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3099  choline dehydrogenase  32.54 
 
 		 562 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6326  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.33 
 
 		 554 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1582  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.83 
 
 		 533 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5834  choline dehydrogenase  32.72 
 
 		 577 aa  243  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1199  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.88 
 
 		 530 aa  242  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1098  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.3 
 
 		 529 aa  242  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3595  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.76 
 
 		 549 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2587  choline dehydrogenase  29.9 
 
 		 556 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.676646  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3164  choline dehydrogenase  34.07 
 
 		 551 aa  239  9e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.637341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1383  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.9 
 
 		 551 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00471975  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2042  L-sorbose dehydrogenase, FAD dependent, putative  34.3 
 
 		 544 aa  238  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0700873  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0991  choline dehydrogenase  33.11 
 
 		 552 aa  237  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0436021  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2223  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.4 
 
 		 531 aa  238  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.487572  normal  0.417914 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1487  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.84 
 
 		 551 aa  238  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4081  choline dehydrogenase  30.37 
 
 		 560 aa  237  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4867  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.17 
 
 		 560 aa  236  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348286  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1334  choline dehydrogenase  30.02 
 
 		 560 aa  236  9e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2781  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.38 
 
 		 538 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0926901  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0123  putative alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  32.62 
 
 		 574 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6373  glucose-methanol-choline oxidoreductase:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  30.38 
 
 		 540 aa  233  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2554  choline dehydrogenase  31.26 
 
 		 559 aa  233  6e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0102453  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0877  choline dehydrogenase  34.24 
 
 		 545 aa  233  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.988222  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4749  glucose-methanol-choline oxidoreductase:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  33.5 
 
 		 546 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769541  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1196  choline dehydrogenase  31.24 
 
 		 565 aa  231  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3840  choline dehydrogenase  31.76 
 
 		 561 aa  231  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6705  choline dehydrogenase  34.12 
 
 		 516 aa  231  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425945 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3651  choline dehydrogenase  31.94 
 
 		 553 aa  231  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3840  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.08 
 
 		 544 aa  230  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397758  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0477  Choline dehydrogenase  32.43 
 
 		 531 aa  230  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1035  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.45 
 
 		 609 aa  230  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.77377  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00267  choline dehydrogenase  30.76 
 
 		 556 aa  230  7e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00270  hypothetical protein  30.76 
 
 		 556 aa  230  7e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1739  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.98 
 
 		 541 aa  229  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3295  choline dehydrogenase  30.76 
 
 		 556 aa  229  8e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3312  choline dehydrogenase  30.76 
 
 		 556 aa  229  8e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1832  choline dehydrogenase  31.25 
 
 		 560 aa  229  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.287087  normal  0.448798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2604  choline dehydrogenase  32.48 
 
 		 562 aa  229  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142768 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4716  choline dehydrogenase  33.11 
 
 		 561 aa  229  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.959774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1846  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.29 
 
 		 547 aa  229  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0728  choline dehydrogenase  30.47 
 
 		 566 aa  228  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1119  choline dehydrogenase  31.37 
 
 		 564 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0326  choline dehydrogenase  30.59 
 
 		 556 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0370  choline dehydrogenase  30.59 
 
 		 556 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2378  Choline dehydrogenase  34.13 
 
 		 551 aa  228  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.448643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3717  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.09 
 
 		 531 aa  228  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.975922 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5015  choline dehydrogenase, a flavoprotein  31.88 
 
 		 557 aa  228  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00654928  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3313  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.66 
 
 		 576 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0342  choline dehydrogenase  30.59 
 
 		 562 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02642  choline dehydrogenase  30.65 
 
 		 552 aa  227  5.0000000000000005e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2831  choline dehydrogenase  31.2 
 
 		 567 aa  226  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2917  choline dehydrogenase  31.2 
 
 		 567 aa  226  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.80885  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2072  choline dehydrogenase  30.31 
 
 		 562 aa  226  8e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0373  choline dehydrogenase  30.59 
 
 		 562 aa  226  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.868243  normal  0.338212 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3035  choline dehydrogenase  31.12 
 
 		 561 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.82163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1315  choline dehydrogenase  31.12 
 
 		 561 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1351  choline dehydrogenase  31.12 
 
 		 561 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.875987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3536  choline dehydrogenase  31.29 
 
 		 566 aa  226  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0715  choline dehydrogenase  31.05 
 
 		 572 aa  226  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00120252  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1325  choline dehydrogenase  31.12 
 
 		 561 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0996  alcohol dehydrogenase  32.94 
 
 		 559 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4459  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.67 
 
 		 560 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0573714  hitchhiker  0.00237498 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4456  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.11 
 
 		 531 aa  225  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691807  normal  0.0210476 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5037  choline dehydrogenase  31.31 
 
 		 566 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3310  choline dehydrogenase  32.4 
 
 		 572 aa  225  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.903723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3762  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.19 
 
 		 552 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4010  choline dehydrogenase  30.87 
 
 		 561 aa  224  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0405578  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0553  choline dehydrogenase  32.71 
 
 		 566 aa  224  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0203  glucose-methanol-choline oxidoreductase:GMC oxidoreductase  32.4 
 
 		 559 aa  223  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4377  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.86 
 
 		 551 aa  223  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1072  choline dehydrogenase  31.24 
 
 		 565 aa  223  7e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00240234  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5100  choline dehydrogenase  32.49 
 
 		 566 aa  223  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5182  choline dehydrogenase  32.72 
 
 		 566 aa  223  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3268  choline dehydrogenase  32.49 
 
 		 566 aa  223  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121076  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4512  choline dehydrogenase  31.31 
 
 		 566 aa  223  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.422466 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1515  choline dehydrogenase  31.27 
 
 		 555 aa  223  9e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.307618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1614  glucose-methanol-choline oxidoreductase:GMC oxidoreductase  30.44 
 
 		 547 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0401  choline dehydrogenase  31.74 
 
 		 563 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.726855 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.22 
 
 		 509 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.08 
 
 		 536 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0874  choline dehydrogenase  30.46 
 
 		 565 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526772  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>