More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1197 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1197  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
184 aa  363  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  32.75 
 
 
176 aa  84.3  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  33.14 
 
 
170 aa  84  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  33.14 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  32.12 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  31.61 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  30.23 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  30.23 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  30.23 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  30.57 
 
 
171 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  29.65 
 
 
170 aa  79  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  31.45 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  30.82 
 
 
170 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  30.82 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  30.82 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  30.82 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  31.21 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  30.41 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0195  lipoprotein signal peptidase  31.82 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  31.01 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  29.61 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  31.79 
 
 
159 aa  74.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  30.46 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  31.01 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  31.71 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  28.74 
 
 
167 aa  72  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  32.03 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  29.31 
 
 
170 aa  70.5  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  29.53 
 
 
168 aa  70.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  28.39 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  27.68 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  30.12 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  30.12 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  30.18 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  27.49 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  32.39 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  30.12 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  25.29 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  31.93 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  30.72 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  29.27 
 
 
168 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  27.33 
 
 
163 aa  67  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  29.89 
 
 
165 aa  67.4  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  30.86 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  30.19 
 
 
169 aa  67  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  25.57 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  31.1 
 
 
182 aa  67  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  33.08 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  28.57 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  28.57 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0359  lipoprotein signal peptidase  27.88 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  31.65 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  30.26 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4043  signal peptidase II  29.09 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  29.27 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  25.29 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  24.26 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  28.93 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  28.96 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  26.01 
 
 
358 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  32.08 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  31.08 
 
 
143 aa  63.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  27.06 
 
 
171 aa  63.2  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  30.11 
 
 
159 aa  63.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 
144 aa  63.2  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  24.68 
 
 
357 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  31.76 
 
 
160 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  31.53 
 
 
169 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  29.87 
 
 
166 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  28.76 
 
 
168 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  27.16 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  29.87 
 
 
166 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  29.87 
 
 
166 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  29.87 
 
 
166 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  29.87 
 
 
166 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  29.45 
 
 
272 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  30.72 
 
 
173 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  27.44 
 
 
160 aa  62.4  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0472  lipoprotein signal peptidase  34.75 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  32 
 
 
165 aa  62  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  27.91 
 
 
168 aa  62  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2717  lipoprotein signal peptidase  29.66 
 
 
227 aa  62  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  29.66 
 
 
164 aa  61.6  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  29.87 
 
 
164 aa  61.6  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  27.72 
 
 
180 aa  61.6  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0988  lipoprotein signal peptidase  32.41 
 
 
181 aa  61.2  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00914153  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  28.65 
 
 
212 aa  61.2  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  29.3 
 
 
157 aa  60.8  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  37.04 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  29.94 
 
 
164 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  27.04 
 
 
165 aa  60.8  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  26.95 
 
 
178 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  26.67 
 
 
224 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  37.18 
 
 
171 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0457  lipoprotein signal peptidase  33.9 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0092  lipoprotein signal peptidase  31.97 
 
 
160 aa  60.5  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.142417  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  29.33 
 
 
169 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  29.49 
 
 
168 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  27.04 
 
 
163 aa  60.5  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>