More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3160 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3160  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 514 aa  1046    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.404677 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1362  peptidase M48 Ste24p  60.94 
 
 		 516 aa  587  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0606393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  44.92 
 
 		 520 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  44.99 
 
 		 493 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  45.24 
 
 		 524 aa  383  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  44.66 
 
 		 478 aa  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  40.49 
 
 		 497 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  44.23 
 
 		 500 aa  372  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  40.88 
 
 		 496 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  44.23 
 
 		 487 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  45.12 
 
 		 494 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  40.42 
 
 		 503 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  41.79 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  40.97 
 
 		 497 aa  365  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  39.67 
 
 		 488 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  39.87 
 
 		 497 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  42.37 
 
 		 475 aa  345  1e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  41.91 
 
 		 493 aa  340  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  41 
 
 		 476 aa  332  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  37.95 
 
 		 513 aa  323  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  36.92 
 
 		 503 aa  319  7e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  40.09 
 
 		 480 aa  316  5e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  37.47 
 
 		 482 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  36.83 
 
 		 513 aa  311  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  38.79 
 
 		 504 aa  287  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  37.56 
 
 		 471 aa  281  2e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  31.09 
 
 		 479 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  32.3 
 
 		 493 aa  210  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  29.53 
 
 		 513 aa  196  7e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  29.77 
 
 		 489 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  28.4 
 
 		 478 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  29.55 
 
 		 489 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  32.43 
 
 		 490 aa  161  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  29.47 
 
 		 489 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  28.61 
 
 		 493 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 479 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  30.34 
 
 		 489 aa  146  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  29.27 
 
 		 479 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  28.8 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  27.59 
 
 		 513 aa  134  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  32.2 
 
 		 494 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  28.81 
 
 		 479 aa  127  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  29.86 
 
 		 278 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  30.53 
 
 		 436 aa  96.7  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 289 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 424 aa  95.1  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  27.51 
 
 		 285 aa  94.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  32.58 
 
 		 427 aa  94.4  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  36.17 
 
 		 432 aa  93.6  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  31.9 
 
 		 424 aa  92.4  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  35.11 
 
 		 282 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  32.89 
 
 		 529 aa  91.7  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  30.99 
 
 		 280 aa  90.5  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  31.75 
 
 		 284 aa  90.5  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 279 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 279 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  30.35 
 
 		 445 aa  87.8  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  31 
 
 		 278 aa  87.8  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  32.68 
 
 		 307 aa  87.8  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  31.52 
 
 		 268 aa  87.4  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  26.21 
 
 		 288 aa  85.9  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  28.31 
 
 		 561 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  34.21 
 
 		 259 aa  85.5  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  34.9 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0358  peptidase M48, Ste24p  27.45 
 
 		 533 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000622653  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  29.44 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  29.41 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  29.7 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  31.02 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  32.99 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0233  peptidase M48 Ste24p  34.97 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  30.94 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  33.52 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  32.14 
 
 		 480 aa  84  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  28.49 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0222  peptidase M48 Ste24p  34.43 
 
 		 289 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  26.22 
 
 		 553 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  32.58 
 
 		 265 aa  82.4  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  28.9 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  30.94 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  30.68 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1887  peptidase M48, Ste24p  31.82 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0147  peptidase M48, Ste24p  36.36 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0989  peptidase M48 Ste24p  30.98 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168656  hitchhiker  0.00764497 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  30.06 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 		 483 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  25.78 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  31.29 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  29.59 
 
 		 231 aa  79.7  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  28.18 
 
 		 266 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  29.26 
 
 		 292 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  30.41 
 
 		 554 aa  79  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  29.89 
 
 		 484 aa  79  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  26.18 
 
 		 487 aa  79  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  30.73 
 
 		 320 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  28.43 
 
 		 267 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  31.61 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  29.63 
 
 		 502 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  29.78 
 
 		 487 aa  78.2  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>