More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_27260 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_27260  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 		 730 aa  1437    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0467711  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1925  ABC transporter related  46.77 
 
 		 726 aa  505  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2928  ABC transporter, HlyB/MsbA family  47.4 
 
 		 602 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.807188  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1444  ABC transporter-like protein  47.4 
 
 		 613 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0895961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3184  ABC transporter related protein  43.04 
 
 		 671 aa  491  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0347906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2881  ABC transporter related protein  47.37 
 
 		 608 aa  479  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000328864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5718  ABC transporter related  45.9 
 
 		 589 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3034  ABC transporter related  47.78 
 
 		 597 aa  464  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624415  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1157  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  48.14 
 
 		 638 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0429798  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3228  ABC transporter related protein  46.17 
 
 		 591 aa  459  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4360  ABC transporter related  46.46 
 
 		 610 aa  458  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3979  ABC transporter related protein  43.17 
 
 		 609 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.52 
 
 		 617 aa  437  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.376239  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3407  ABC transporter related  46.39 
 
 		 625 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3181  ABC transporter related  47.45 
 
 		 625 aa  435  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1493  ABC transporter related protein  44.2 
 
 		 605 aa  410  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.625489  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1995  ABC transporter related protein  42.88 
 
 		 635 aa  399  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.2 
 
 		 606 aa  398  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1209  ABC transporter related  40.5 
 
 		 584 aa  379  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2231  ABC transporter related  43.29 
 
 		 608 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  32.39 
 
 		 1522 aa  259  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  35.07 
 
 		 650 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  35.07 
 
 		 650 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  34.89 
 
 		 641 aa  254  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  36.78 
 
 		 633 aa  253  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  36.02 
 
 		 581 aa  248  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  38.8 
 
 		 1231 aa  243  7e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5006  ABC transporter-related protein  34.93 
 
 		 634 aa  241  5e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  27.23 
 
 		 594 aa  240  8e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  30.76 
 
 		 586 aa  238  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  28.41 
 
 		 578 aa  231  4e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  33.58 
 
 		 606 aa  231  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  33.89 
 
 		 601 aa  228  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  35.34 
 
 		 1284 aa  228  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.67 
 
 		 577 aa  228  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2782  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.99 
 
 		 596 aa  227  5.0000000000000005e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0170515  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  33.7 
 
 		 577 aa  227  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  28.42 
 
 		 586 aa  227  6e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  28.04 
 
 		 593 aa  226  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  27.66 
 
 		 585 aa  226  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  31.82 
 
 		 641 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  29.73 
 
 		 593 aa  223  7e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  30.39 
 
 		 604 aa  223  9e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1889  ABC transporter related  32.03 
 
 		 590 aa  223  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.19709  normal  0.932579 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02160  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.79 
 
 		 608 aa  222  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  29.86 
 
 		 588 aa  221  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  28.17 
 
 		 606 aa  221  3.9999999999999997e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 604 aa  220  6e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0246  ABC lipid efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  32.14 
 
 		 590 aa  220  7e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  34.94 
 
 		 1321 aa  220  7e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  31.15 
 
 		 591 aa  220  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  35.17 
 
 		 589 aa  220  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  31.89 
 
 		 626 aa  220  7.999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.86 
 
 		 622 aa  219  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.89 
 
 		 585 aa  218  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2019  ABC transporter related  32.78 
 
 		 590 aa  218  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.990408 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.74 
 
 		 1257 aa  218  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  29.9 
 
 		 579 aa  218  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3549  ABC transporter related  30.98 
 
 		 614 aa  217  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  28.18 
 
 		 580 aa  217  5.9999999999999996e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  37.31 
 
 		 1194 aa  216  8e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  33.16 
 
 		 640 aa  216  9e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.34 
 
 		 582 aa  216  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  27.74 
 
 		 556 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  31.96 
 
 		 631 aa  216  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  31.79 
 
 		 632 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  34.66 
 
 		 1301 aa  213  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1226  ABC transporter, transmembrane region  31.66 
 
 		 595 aa  213  7.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.56473  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  27.99 
 
 		 582 aa  213  9e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  30.02 
 
 		 577 aa  213  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.96 
 
 		 574 aa  213  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  29.32 
 
 		 575 aa  213  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.1 
 
 		 574 aa  212  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1868  ABC transporter related  31.92 
 
 		 610 aa  212  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1769  ABC transporter related  27.29 
 
 		 614 aa  211  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0624657  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  35.42 
 
 		 984 aa  211  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  28.94 
 
 		 588 aa  211  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  26.77 
 
 		 581 aa  211  5e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2278  ABC transporter related  34.2 
 
 		 591 aa  211  5e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  31.94 
 
 		 620 aa  210  7e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  31.17 
 
 		 581 aa  210  8e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  25.91 
 
 		 588 aa  210  8e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  29.26 
 
 		 586 aa  210  9e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  30.64 
 
 		 622 aa  210  9e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6767  ABC transporter related  32.94 
 
 		 589 aa  210  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406129  normal  0.504103 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  34.09 
 
 		 578 aa  209  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1388  response regulator receiver protein  34.14 
 
 		 921 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251284  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  30.73 
 
 		 1436 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6441  response regulator receiver protein  30.63 
 
 		 933 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6032  response regulator receiver protein  30.63 
 
 		 933 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.340327  normal  0.371985 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  29.94 
 
 		 695 aa  209  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  28.39 
 
 		 649 aa  209  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  32.23 
 
 		 628 aa  209  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  30.77 
 
 		 583 aa  209  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.77 
 
 		 582 aa  208  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  31.05 
 
 		 577 aa  208  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  29.04 
 
 		 587 aa  207  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  33.27 
 
 		 1218 aa  208  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5655  response regulator receiver protein  36.18 
 
 		 935 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  28.14 
 
 		 575 aa  207  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>