More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7422 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6504  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  96.42 
 
 
391 aa  744    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.828947 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7422  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 
391 aa  786    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0466713  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5648  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  95.91 
 
 
391 aa  717    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597007  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6139  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  92.58 
 
 
391 aa  717    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6013  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  95.91 
 
 
391 aa  717    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000590386  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3159  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  52.7 
 
 
398 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2887  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  52.7 
 
 
398 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0709  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  52.44 
 
 
398 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0524  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  52.7 
 
 
398 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.413628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0542  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  52.7 
 
 
398 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0129  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  52.7 
 
 
398 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1459  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  52.7 
 
 
398 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3805  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.34 
 
 
404 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3255  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.26 
 
 
415 aa  96.7  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2019  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.23 
 
 
419 aa  94.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.225254 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1392  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  28.05 
 
 
415 aa  90.5  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0214918  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3735  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.71 
 
 
388 aa  86.7  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0413562  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2435  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.1 
 
 
412 aa  86.7  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0421  putative Orn/DAP/Arg decarboxylase  27.3 
 
 
402 aa  86.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2078  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.83 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192664  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0113  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.18 
 
 
442 aa  82.8  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4030  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.43 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.157056  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2585  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2:Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.13 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.126508  decreased coverage  0.000677908 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1565  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.06 
 
 
411 aa  82  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3734  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.5 
 
 
428 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3425  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.46 
 
 
431 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  0.792047 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1957  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.2 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47769  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0523  diaminopimelate decarboxylase  26.79 
 
 
402 aa  80.1  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2511  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  24.74 
 
 
416 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0136  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  25.85 
 
 
402 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0126  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.62 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4274  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  27.51 
 
 
402 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000282467 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1290  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.39 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0486  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.05 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252649  normal  0.657753 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01927  diaminopimelate decarboxylase  26.89 
 
 
398 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2669  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.4 
 
 
410 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.499942  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0584  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.03 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000391397  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4867  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.15 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155396  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2528  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  25.39 
 
 
416 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0397628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3879  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.78 
 
 
508 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00597643  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4492  putative pyridoxal-dependent decarboxylase  24.37 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.799972  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0700  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.13 
 
 
414 aa  72.8  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2972  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.79 
 
 
362 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.980745 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0790  diaminopimelate decarboxylase  29.44 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.867864 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  26.22 
 
 
417 aa  72  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  26.68 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3620  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.53 
 
 
429 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0244678 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.6 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585964  normal  0.770001 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17190  diaminopimelate decarboxylase  25.51 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.479032  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1835  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.36 
 
 
430 aa  70.5  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.59311  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3058  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.03 
 
 
418 aa  70.1  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.700588  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7006  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  26.65 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015439 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2337  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.38 
 
 
408 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1929  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.37 
 
 
409 aa  68.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0098  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.18 
 
 
440 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  26.98 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0670  diaminopimelate decarboxylase  31.18 
 
 
453 aa  67.8  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00590114 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  25.2 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  28.06 
 
 
422 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2183  Diaminopimelate decarboxylase  24.94 
 
 
412 aa  66.6  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0199  diaminopimelate decarboxylase  23.71 
 
 
443 aa  66.6  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258223 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1043  diaminopimelate decarboxylase  22.99 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4736  diaminopimelate decarboxylase  28.13 
 
 
463 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.775184  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  25 
 
 
859 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8366  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.49 
 
 
392 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  29.97 
 
 
415 aa  66.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  25 
 
 
859 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5043  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.52 
 
 
403 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  27.69 
 
 
417 aa  64.3  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00881  diaminopimelate decarboxylase protein  31.58 
 
 
413 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6020  diaminopimelate decarboxylase  29.01 
 
 
415 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3234  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.02 
 
 
433 aa  63.5  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17502  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1275  diaminopimelate decarboxylase  25.65 
 
 
386 aa  63.5  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162613  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4053  diaminopimelate decarboxylase  29.71 
 
 
484 aa  63.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3816  diaminopimelate decarboxylase  24.69 
 
 
422 aa  63.2  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  26.87 
 
 
878 aa  63.2  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0663  diaminopimelate decarboxylase  33.85 
 
 
453 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  29.01 
 
 
415 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1275  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  21.88 
 
 
421 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.548043  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1629  diaminopimelate decarboxylase  26.75 
 
 
459 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46186  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  28.75 
 
 
415 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2435  diaminopimelate decarboxylase  24.49 
 
 
475 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.588454 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  28.75 
 
 
415 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2676  Diaminopimelate decarboxylase  27.53 
 
 
418 aa  61.2  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.438266  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3140  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.6 
 
 
392 aa  61.6  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0125  diaminopimelate decarboxylase  25.95 
 
 
417 aa  61.2  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.788285  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  27.43 
 
 
423 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0486  diaminopimelate decarboxylase  26.84 
 
 
414 aa  60.8  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.012167  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  27.66 
 
 
414 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  28.97 
 
 
415 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2664  diaminopimelate decarboxylase  25.88 
 
 
434 aa  60.1  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.287942  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0114  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  22.78 
 
 
400 aa  60.1  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  22.78 
 
 
400 aa  60.1  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  26.87 
 
 
451 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1303  diaminopimelate decarboxylase  30.05 
 
 
435 aa  59.7  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  27.86 
 
 
423 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1109  pyridoxal-dependent family decarboxylase  21.63 
 
 
389 aa  58.9  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09300  diaminopimelate decarboxylase  30.94 
 
 
396 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000620759  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3860  diaminopimelate decarboxylase  25.88 
 
 
422 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6954  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.9 
 
 
403 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>