183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1402 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1402  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 162 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  76.54 
 
 		 185 aa  279  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  76.54 
 
 		 190 aa  278  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  75.31 
 
 		 165 aa  276  6e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  75.93 
 
 		 185 aa  276  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  75.31 
 
 		 195 aa  271  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0348  cytochrome c oxidase subunit II  71.6 
 
 		 190 aa  258  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4077  putative cytochrome c oxidase subunit II  68.52 
 
 		 190 aa  249  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0623  cytochrome c oxidase subunit II  68.52 
 
 		 190 aa  248  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  55.56 
 
 		 187 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  40.25 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  37.5 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  37.5 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  43.75 
 
 		 171 aa  97.4  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  34.03 
 
 		 155 aa  90.5  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  47.25 
 
 		 186 aa  90.5  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  43.01 
 
 		 266 aa  88.6  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  32 
 
 		 300 aa  87  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  41.41 
 
 		 158 aa  87  9e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  39.42 
 
 		 172 aa  86.3  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  35.34 
 
 		 168 aa  84.7  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  31.47 
 
 		 262 aa  84.3  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  33.09 
 
 		 162 aa  84  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  36.09 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  30.77 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  26.06 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  30.63 
 
 		 405 aa  58.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  31.2 
 
 		 314 aa  57  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  38.46 
 
 		 316 aa  57  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2249  cytochrome c oxidase, subunit II  32.95 
 
 		 329 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  32.14 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.09 
 
 		 311 aa  54.3  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0186  cytochrome c oxidase subunit II  29.13 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  26.36 
 
 		 243 aa  54.3  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2971  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297195  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0264  cytochrome c oxidase, subunit II  37.8 
 
 		 343 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  25.93 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2667  cytochrome c oxidase, subunit II  36.49 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2712  cytochrome c oxidase, subunit II  32.22 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  38.96 
 
 		 234 aa  52.4  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  32.94 
 
 		 232 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  28.26 
 
 		 380 aa  51.6  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2670  cytochrome c oxidase, subunit II  29.37 
 
 		 265 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0983455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1936  cytochrome c oxidase subunit II  41.18 
 
 		 243 aa  50.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.244228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  28.26 
 
 		 389 aa  50.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 378 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  31.46 
 
 		 260 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  29.35 
 
 		 398 aa  49.7  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  33.71 
 
 		 389 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  29.35 
 
 		 392 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  36.59 
 
 		 426 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.46 
 
 		 316 aa  48.5  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  32.32 
 
 		 275 aa  48.5  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  31.33 
 
 		 320 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 		 318 aa  48.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  28.7 
 
 		 302 aa  48.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  33.72 
 
 		 345 aa  47.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  27.17 
 
 		 389 aa  47.8  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.97 
 
 		 274 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  27.17 
 
 		 389 aa  47.8  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  27.62 
 
 		 342 aa  47.8  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0162  cytochrome c oxidase subunit II  32.94 
 
 		 179 aa  47.8  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  27.91 
 
 		 125 aa  47.4  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  32.1 
 
 		 330 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  31.4 
 
 		 375 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  29.07 
 
 		 316 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  26.92 
 
 		 330 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0142  cytochrome c oxidase, subunit II  34.62 
 
 		 374 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  29.52 
 
 		 288 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  30 
 
 		 315 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4253  cytochrome c oxidase, subunit II  26.74 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04019  cytochrome c oxidase, subunit II  29.07 
 
 		 308 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  31.03 
 
 		 374 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  29.55 
 
 		 520 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  27.59 
 
 		 388 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 		 521 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  31.03 
 
 		 366 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  31.76 
 
 		 351 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  32.5 
 
 		 373 aa  45.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  31.76 
 
 		 350 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  31.76 
 
 		 350 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1618  cytochrome c oxidase subunit II  29.57 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  32.05 
 
 		 512 aa  45.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0480  cytochrome c oxidase, subunit II  29.59 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.671352  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  34.72 
 
 		 519 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  30.38 
 
 		 513 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  26.79 
 
 		 344 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  31.76 
 
 		 350 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  30.14 
 
 		 400 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  32.93 
 
 		 314 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0956  cytochrome c oxidase, subunit II  25.45 
 
 		 280 aa  45.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  27.59 
 
 		 524 aa  45.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  27.69 
 
 		 287 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  30.38 
 
 		 518 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  32.31 
 
 		 384 aa  44.7  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  29.79 
 
 		 375 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  28.74 
 
 		 356 aa  44.7  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2167  cytochrome c oxidase, subunit II  28.79 
 
 		 316 aa  44.7  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.238577  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  29.79 
 
 		 375 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>