168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6744 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
207 aa  410  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  98.48 
 
 
198 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  99.47 
 
 
188 aa  370  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  75.13 
 
 
189 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  69 
 
 
211 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  64.02 
 
 
190 aa  229  3e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  58.21 
 
 
213 aa  224  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  53.92 
 
 
208 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  53.92 
 
 
219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  57.69 
 
 
186 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  57.46 
 
 
205 aa  205  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  57.46 
 
 
186 aa  204  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  54.49 
 
 
182 aa  184  6e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  36.02 
 
 
185 aa  125  5e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  36.26 
 
 
191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  35.43 
 
 
188 aa  119  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  36.65 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.21 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  33.53 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  34.62 
 
 
184 aa  109  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  31.87 
 
 
181 aa  108  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.52 
 
 
191 aa  108  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  34.68 
 
 
172 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  36.36 
 
 
172 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  34.88 
 
 
184 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  34.62 
 
 
185 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.58 
 
 
186 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.58 
 
 
186 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.8 
 
 
172 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.42 
 
 
172 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  29.89 
 
 
183 aa  105  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  34.1 
 
 
189 aa  104  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
184 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  30.77 
 
 
182 aa  98.6  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.61 
 
 
184 aa  96.3  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.73 
 
 
182 aa  96.7  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  28.8 
 
 
183 aa  96.3  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  31.93 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  28.41 
 
 
180 aa  92  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  28.73 
 
 
182 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.91 
 
 
179 aa  90.5  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.46 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.21 
 
 
181 aa  90.1  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.72 
 
 
181 aa  88.6  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.28 
 
 
188 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  29.48 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  29.21 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  26.14 
 
 
181 aa  82  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.81 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  33.14 
 
 
409 aa  81.3  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.48 
 
 
178 aa  80.9  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3701  alkylhydroperoxidase (AhpD family core domain protein)  32.73 
 
 
151 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.716433  normal  0.202413 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  29.52 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.74 
 
 
178 aa  79  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.81 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.52 
 
 
181 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  26.53 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.77 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  33.1 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.16 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  32.56 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  30.49 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.71 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.7 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.55 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  28.08 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.08 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  28.08 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.58 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  29.71 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.59 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.43 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  30.64 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  25.95 
 
 
192 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  29.24 
 
 
180 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28 
 
 
192 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  24.84 
 
 
178 aa  63.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.82 
 
 
192 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.37 
 
 
192 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  28.48 
 
 
177 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.74 
 
 
190 aa  61.6  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.41 
 
 
192 aa  61.6  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.12 
 
 
192 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  25 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.73 
 
 
192 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.29 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.27 
 
 
192 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  25.7 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.27 
 
 
178 aa  60.1  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.88 
 
 
202 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.47 
 
 
196 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  24.74 
 
 
202 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  27.17 
 
 
195 aa  58.9  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2999  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.79 
 
 
196 aa  58.5  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.73 
 
 
201 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.24 
 
 
192 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  24.24 
 
 
192 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.24 
 
 
192 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>