More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0632 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0632  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 208 aa  422  1e-117  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000140472  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1943  30S ribosomal protein S4  48.02 
 
 		 206 aa  199  3e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000165319  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  46.19 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  45.69 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  43.65 
 
 		 203 aa  179  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  44.67 
 
 		 203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  43.65 
 
 		 203 aa  178  5.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  43.33 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  44.16 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0182  30S ribosomal protein S4  47.24 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162542  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  44.16 
 
 		 203 aa  175  4e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  43.2 
 
 		 200 aa  175  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  45.27 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  44.28 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0685  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  42.13 
 
 		 205 aa  171  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  44.66 
 
 		 200 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  44.08 
 
 		 206 aa  171  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  43.33 
 
 		 206 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  45.27 
 
 		 208 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0429  30S ribosomal protein S4  44.29 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.857828  normal  0.0845292 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0237  30S ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000435795  unclonable  0.0000101717 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  43.81 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0104  30S ribosomal protein S4  43.81 
 
 		 208 aa  169  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4666  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 206 aa  168  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  unclonable  0.00000000965042 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 202 aa  168  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0194  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 206 aa  168  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127646  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  41.35 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  43.33 
 
 		 208 aa  167  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0223  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 206 aa  167  9e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00230473  unclonable  0.0000000000516884 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3735  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000110035  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001718  SSU ribosomal protein S4p (S9e)  44.72 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000581298  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0255  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  43.81 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4295  30S ribosomal protein S4  45.67 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000502229  hitchhiker  0.00000000110473 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0346  ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000340936  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0223  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000007109  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0218  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000114073  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2305  ribosomal protein S4  42.7 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00950883  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00753  30S ribosomal protein S4  44.72 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4146  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0220  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000964484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4032  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000124947  hitchhiker  0.0000000000798632 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2232  30S ribosomal protein S4  43.14 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0017217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0223  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0713336 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2150  30S ribosomal protein S4  44.22 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000017924  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1740  30S ribosomal protein S4  44.12 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0408943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0208  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  165  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000624869  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  42.51 
 
 		 206 aa  165  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  43.33 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1156  ribosomal protein S4  45.61 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000923588  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3727  30S ribosomal protein S4  44.72 
 
 		 206 aa  165  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00253397  hitchhiker  0.00505868 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  45.13 
 
 		 202 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  43.33 
 
 		 208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  41.12 
 
 		 208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0343  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0236416  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  46.01 
 
 		 208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0083  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 206 aa  164  9e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000323728  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  45.71 
 
 		 209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0172  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000508668  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2348  30S ribosomal protein S4  42.11 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  42.38 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0344  30S ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311272  decreased coverage  0.0000419462 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0871  SSU ribosomal protein S4P  40 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406188  hitchhiker  0.0058792 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  43.13 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0652  30S ribosomal protein S4  43.33 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000063481 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0237  30S ribosomal protein S4  43.43 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0862147  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  43.78 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  44.28 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2750  ribosomal protein S4  40.95 
 
 		 208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  41.06 
 
 		 200 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0743  ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.068041  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  40.48 
 
 		 208 aa  161  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  41.12 
 
 		 203 aa  160  9e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03147  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0417  ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174636  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3612  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0916894  normal  0.743877 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3591  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0175638  normal  0.0749349 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3719  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0332489  normal  0.162839 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3682  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00624205  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4618  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000445858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3490  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000164824  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03098  hypothetical protein  43.75 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0417  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.045567  hitchhiker  0.000000319693 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4218  30S ribosomal protein S4  40.8 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5761  ribosomal protein S4  43.69 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3611  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00202112  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  43.2 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3782  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.034256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3779  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105305  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3684  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00775419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0508  30S ribosomal protein S4  45.63 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0219841  normal  0.0757091 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0437  ribosomal protein S4  43 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000069036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5046  30S ribosomal protein S4  41.83 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  43.28 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  45.6 
 
 		 202 aa  159  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4520  30S ribosomal protein S4  43.27 
 
 		 206 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000540597  decreased coverage  0.000000609653 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2613  30S ribosomal protein S4  41.83 
 
 		 206 aa  158  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.872553  normal  0.744433 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0625  30S ribosomal protein S4  41.35 
 
 		 207 aa  158  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>