125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4444 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4444  amidohydrolase 2  100 
 
 		 296 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104105 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4964  amidohydrolase 2  97.3 
 
 		 296 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.088857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3331  amidohydrolase 2  95.61 
 
 		 296 aa  567  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5036  amidohydrolase 2  95.61 
 
 		 296 aa  567  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358392  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5248  amidohydrolase 2  94.26 
 
 		 310 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.765802 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0627  amidohydrolase 2  89.97 
 
 		 290 aa  527  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3602  amidohydrolase 2  89.27 
 
 		 296 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309936  normal  0.902942 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3135  amidohydrolase 2  50.69 
 
 		 295 aa  261  8e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.394121  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0641  amidohydrolase 2  46.5 
 
 		 287 aa  239  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1992  amidohydrolase 2  44.37 
 
 		 275 aa  223  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.776657 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0798  amidohydrolase 2  39.44 
 
 		 276 aa  205  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0898209  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1423  amidohydrolase 2  42.61 
 
 		 280 aa  192  6e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4016  amidohydrolase 2  37.41 
 
 		 276 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4117  amidohydrolase 2  34.74 
 
 		 278 aa  189  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5740  amidohydrolase 2  36.97 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.047706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0572  amidohydrolase 2  38.68 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2469  amidohydrolase 2  41.78 
 
 		 277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.236604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4918  amidohydrolase 2  39.8 
 
 		 285 aa  172  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6094  hypothetical protein  36.71 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0412  amidohydrolase 2  34.62 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.534906 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1610  amidohydrolase 2  38.83 
 
 		 288 aa  169  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4296  amidohydrolase 2  37.37 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.935121 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6914  amidohydrolase 2  36.71 
 
 		 276 aa  158  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165943  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1822  hypothetical protein  38.05 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5130  hypothetical protein  37.7 
 
 		 270 aa  155  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2958  hypothetical protein  36.01 
 
 		 276 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03263  hydrolase  37.2 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5317  amidohydrolase 2  36.27 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1549  amidohydrolase 2  35.56 
 
 		 275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2110  amidohydrolase 2  35.44 
 
 		 278 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279023  normal  0.687393 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0397  amidohydrolase 2  41.2 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6311  amidohydrolase 2  37.85 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1856  amidohydrolase 2  37.89 
 
 		 272 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.931195  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2374  amidohydrolase  38.1 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.732867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1080  hydrolase  38.1 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1250  amidohydrolase 2  34.83 
 
 		 290 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0875  amidohydrolase 2  35.84 
 
 		 275 aa  139  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.370516  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0641  hydrolase  37.7 
 
 		 279 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6470  amidohydrolase 2  37.15 
 
 		 291 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6705  amidohydrolase 2  37.15 
 
 		 291 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.953897  normal  0.160586 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0824  hydrolase  37.7 
 
 		 279 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1787  hydrolase  37.7 
 
 		 279 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1605  hydrolase  35.92 
 
 		 348 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1224  amidohydrolase 2  34.72 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.157082  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3372  amidohydrolase 2  40.96 
 
 		 261 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0801075  normal  0.412706 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1157  hydrolase  37.3 
 
 		 279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3401  amidohydrolase 2  37.85 
 
 		 286 aa  135  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0756  amidohydrolase 2  36.68 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2432  amidohydrolase 2  35.52 
 
 		 277 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5475  amidohydrolase 2  33.56 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1499  amidohydrolase 2  32.34 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00670  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  33.22 
 
 		 291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3732  amidohydrolase 2  32.13 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1030  amidohydrolase 2  29.93 
 
 		 290 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2213  amidohydrolase 2  31.06 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  32.03 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1551  amidohydrolase 2  27.6 
 
 		 307 aa  99.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3005  amidohydrolase 2  29.45 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.053896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1036  amidohydrolase 2  31.58 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.420019  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  31.39 
 
 		 319 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  31.39 
 
 		 319 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3207  amidohydrolase 2  31.19 
 
 		 313 aa  95.9  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0576  putative hydrolase  31.87 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127492  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5067  amidohydrolase 2  31.51 
 
 		 313 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4981  amidohydrolase 2  28.87 
 
 		 278 aa  90.1  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0402782  normal  0.0307592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1983  amidohydrolase 2  27.1 
 
 		 335 aa  90.1  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6380  amidohydrolase 2  28.52 
 
 		 318 aa  89  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294039  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  30.42 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3483  amidohydrolase 2  24.44 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6812  amidohydrolase 2  26.26 
 
 		 291 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0563  amidohydrolase 2  28.01 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4805  hypothetical protein  29.37 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0307  amidohydrolase 2  27.1 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5345  amidohydrolase 2  27.5 
 
 		 374 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2276  amidohydrolase 2  28.96 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3275  hypothetical protein  24.58 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2268  amidohydrolase 2  30.54 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3078  hypothetical protein  26.58 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0378877  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0233  hypothetical protein  27.2 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644966  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4804  amidohydrolase 2  28.48 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2438  putative amidohydrolase 2  28.24 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03740  conserved hypothetical protein  28.83 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.418803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4807  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5399  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5462  amidohydrolase 2  26.56 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.0519457 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7199  amidohydrolase 2  26 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36110  hypothetical protein  25.58 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000843249 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1211  amidohydrolase 2  27.83 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0368  amidohydrolase 2  28.87 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34196  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1034  hypothetical protein  26.95 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897974  normal  0.828268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2843  amidohydrolase 2  26.05 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0739221  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6041  amidohydrolase 2  27.8 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5685  amidohydrolase 2  27.45 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44258  predicted protein  31.25 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8310  amidohydrolase 2  28.05 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4701  amidohydrolase 2  29.52 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63908  L-rhamnono-gamma-lactonase  26.55 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.689755 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3153  amidohydrolase 2  25.61 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2505  amidohydrolase 2  24.51 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0331548  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0947  hypothetical protein  30.04 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>