More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4032 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 375 aa  739    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  91.47 
 
 		 375 aa  663    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  94.13 
 
 		 375 aa  701    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  92.53 
 
 		 375 aa  692    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  98.93 
 
 		 375 aa  733    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  92.27 
 
 		 375 aa  688    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  92.53 
 
 		 375 aa  692    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2066  oxidoreductase, FAD-binding family protein  81.4 
 
 		 377 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0474  FAD-dependent oxidoreductase  80.7 
 
 		 377 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0571  FAD-dependent oxidoreductase  80.43 
 
 		 377 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1888  oxidoreductase, FAD-binding family protein  80.7 
 
 		 377 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1418  oxidoreductase, FAD-binding family protein  79.79 
 
 		 380 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0869563  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2196  oxidoreductase, FAD-binding family protein  79.79 
 
 		 380 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270908  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0882  oxidoreductase, FAD-binding family protein  79.16 
 
 		 383 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  68.6 
 
 		 371 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  68.87 
 
 		 371 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1841  FAD dependent oxidoreductase  60.5 
 
 		 374 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5219  FAD dependent oxidoreductase  65.55 
 
 		 368 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4668  FAD dependent oxidoreductase  58.36 
 
 		 379 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0623925  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4561  FAD dependent oxidoreductase  56.68 
 
 		 375 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2500  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 370 aa  345  6e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.50654  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0875  putative oxidoreductase  57.1 
 
 		 376 aa  338  9e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.960065  normal  0.263987 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01436  D-amino acid oxidase  52.72 
 
 		 378 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  37.53 
 
 		 393 aa  173  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  34.63 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  33.86 
 
 		 393 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  32.73 
 
 		 379 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  32.47 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  26.05 
 
 		 391 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  26.93 
 
 		 330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  25.52 
 
 		 391 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  25.52 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  25.52 
 
 		 391 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4726  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  25.52 
 
 		 391 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  25.52 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  25.52 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  29.74 
 
 		 361 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 984 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  28.57 
 
 		 368 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5073  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 427 aa  106  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 983 aa  106  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 		 416 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  33.86 
 
 		 361 aa  104  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  30.93 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2864  glycine oxidase, putative  24.65 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  30.75 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  31.86 
 
 		 416 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 390 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  26.74 
 
 		 418 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 375 aa  99.8  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  30.25 
 
 		 364 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 385 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  31.44 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  28.62 
 
 		 411 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 411 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  26.05 
 
 		 371 aa  97.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 395 aa  96.3  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  30.56 
 
 		 371 aa  96.3  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  29.56 
 
 		 375 aa  95.9  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  29.79 
 
 		 382 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  28.61 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  28.99 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.36 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  31.17 
 
 		 372 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  26.73 
 
 		 417 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  27.2 
 
 		 378 aa  94  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  27.27 
 
 		 375 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 376 aa  93.2  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  24.88 
 
 		 417 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 960 aa  92.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 		 411 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2547  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.97 
 
 		 434 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0867  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.73 
 
 		 429 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.872467  normal  0.695937 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.45 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2102  D-amino-acid dehydrogenase  31.12 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  29.78 
 
 		 404 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  27.29 
 
 		 417 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 374 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0926  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.02 
 
 		 429 aa  90.1  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.531144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  29.77 
 
 		 385 aa  90.1  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0796  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.57 
 
 		 429 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  30.32 
 
 		 413 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  30.31 
 
 		 376 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 414 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 		 376 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 378 aa  87.8  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  30.59 
 
 		 418 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  29.49 
 
 		 405 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  25.66 
 
 		 390 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 		 386 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 441 aa  87.8  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  29.37 
 
 		 454 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  30 
 
 		 413 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  28.88 
 
 		 365 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  29.09 
 
 		 413 aa  87  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  25.5 
 
 		 437 aa  86.7  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 363 aa  85.5  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>