130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1774 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1774  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  280  5.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1709  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  280  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.181823  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  87.41 
 
 		 143 aa  244  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  58.27 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  53.9 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  55.24 
 
 		 144 aa  150  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  55.24 
 
 		 146 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5732  hypothetical protein  56.64 
 
 		 142 aa  148  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  60.43 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2768  hypothetical protein  52.45 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153392  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4271  hypothetical protein  54.17 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  53.15 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4638  protein of unknown function DUF336  54.17 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4786  protein of unknown function DUF336  54.86 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  52.45 
 
 		 146 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  52.45 
 
 		 146 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  51.75 
 
 		 143 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  51.75 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0298  hypothetical protein  56.43 
 
 		 153 aa  140  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.834122  normal  0.0150212 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2884  hypothetical protein  53.47 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166888  normal  0.653933 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3823  hypothetical protein  57.34 
 
 		 143 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5342  hypothetical protein  54.86 
 
 		 144 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.264154  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1599  hypothetical protein  48.95 
 
 		 146 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0102012  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1726  hypothetical protein  52.38 
 
 		 142 aa  130  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  46.15 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6094  protein of unknown function DUF336  54.86 
 
 		 144 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  52.21 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0513  hypothetical protein  54.03 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507115 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4308  hypothetical protein  47.83 
 
 		 141 aa  124  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1228  protein of unknown function DUF336  53.96 
 
 		 140 aa  123  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805694  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0578  hypothetical protein  50.47 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0157  hypothetical protein  41.73 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3227  cellulose binding, type IV  43.26 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.749428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  35.25 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  38.52 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  38.52 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  37.31 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  37.78 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  34.81 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  36.57 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  37.04 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  36.23 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  31.88 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  33.83 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  30.95 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  36 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  37.84 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  34.15 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  37.31 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  36.79 
 
 		 181 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  35.66 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  30.3 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  31.54 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  29.5 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  34.19 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  33.06 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  33.98 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  32.35 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  34.29 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  32.58 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  32.14 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4253  hypothetical protein  31.08 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874901  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  37.23 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0950  protein of unknown function DUF336  35.34 
 
 		 132 aa  50.4  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  29.86 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  31.3 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0396  protein of unknown function DUF336  38.64 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.296398  normal  0.0672485 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  29.13 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  31.48 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  30.3 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  33.79 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  36.61 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  32.17 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  30.91 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  30.71 
 
 		 163 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  32 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  36.21 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4361  protein of unknown function DUF336  33.02 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  30.56 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  36.04 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4626  hypothetical protein  34.21 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000345923 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  34.65 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  34.04 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  36.88 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  36.88 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  34.51 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2775  hypothetical protein  35.4 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  29.36 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2824  hypothetical protein  35.4 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  30 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3070  hypothetical protein  37.07 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0964642  normal  0.308183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6184  protein of unknown function DUF336  36.59 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285192  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>