More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1060 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1060  HlyD family secretion protein  100 
 
 		 366 aa  741    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.409643  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2222  secretion protein HlyD family protein  41 
 
 		 364 aa  270  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.0630551 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  40.17 
 
 		 407 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  40.11 
 
 		 413 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0487  secretion protein HlyD  41.74 
 
 		 387 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0299578  normal  0.132982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0616  secretion protein HlyD  41.21 
 
 		 388 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.77466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7637  efflux pump protein  41.43 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0516  secretion protein HlyD family protein  40.06 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  37.18 
 
 		 351 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  37.64 
 
 		 351 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1890  secretion protein HlyD family protein  38.86 
 
 		 368 aa  230  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2225  secretion protein HlyD family protein  37.86 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670197 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1920  secretion protein HlyD  37.61 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00498247  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  36.44 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0097  secretion protein HlyD family protein  34.38 
 
 		 354 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  38.15 
 
 		 371 aa  193  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  35.54 
 
 		 331 aa  192  7e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2688  secretion protein HlyD family protein  38.59 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  34.94 
 
 		 331 aa  189  9e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2191  secretion protein HlyD family protein  37.61 
 
 		 354 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0912  secretion protein HlyD family protein  35.99 
 
 		 368 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.659301  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2237  membrane fusion protein (MFP) family protein  35.99 
 
 		 368 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  36.29 
 
 		 366 aa  176  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2257  secretion protein HlyD family protein  36.66 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.250908 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4053  secretion protein HlyD family protein  36.18 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.861449 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06903  histidine kinase  33.92 
 
 		 341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0257  secretion protein, HlyD family  36.79 
 
 		 337 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0434  secretion protein HlyD family protein  36.79 
 
 		 337 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.532566  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 374 aa  171  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3743  efflux pump membrane protein  32.68 
 
 		 390 aa  169  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.881561  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3338  efflux pump membrane protein  32.11 
 
 		 390 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.615616  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3460  multidrug resistance protein A  32.11 
 
 		 390 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3201  multidrug resistance protein A  32.11 
 
 		 390 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  34.38 
 
 		 410 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000902  multidrug resistance efflux pump  35.33 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  33.24 
 
 		 375 aa  166  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1744  multidrug resistance protein  34.09 
 
 		 411 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1919  multidrug resistance protein  34.09 
 
 		 411 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1767  multidrug resistance protein  34.09 
 
 		 411 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  35.78 
 
 		 475 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  35.06 
 
 		 460 aa  166  9e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  35.78 
 
 		 475 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  33.02 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  35.06 
 
 		 460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  35.78 
 
 		 470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  30.75 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1386  secretion protein HlyD family protein  34.88 
 
 		 407 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1426  secretion protein HlyD family protein  34.88 
 
 		 405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183071 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1503  putative multidrug resistance protein  33.81 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1057  multidrug resistance protein, putative  33.81 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0394345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0171  putative multidrug resistance protein  33.81 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152509  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0995  putative multidrug resistance protein  33.81 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2816  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  33.33 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106074  normal  0.653781 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1751  efflux pump membrane protein  35.51 
 
 		 407 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0610226 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  35.89 
 
 		 468 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3486  efflux pump membrane protein  31.18 
 
 		 391 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  31.78 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1480  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3583  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  33.92 
 
 		 420 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0766049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1024  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3330  efflux pump membrane protein  31.46 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1504  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 404 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226713  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1730  secretion protein HlyD  31.83 
 
 		 402 aa  160  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1636  efflux pump membrane protein  33.43 
 
 		 424 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00067211 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  32.65 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  35.96 
 
 		 363 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4645  HlyD family secretion protein  33.95 
 
 		 404 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109619  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  34.67 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1725  efflux pump membrane protein  33.61 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  32.94 
 
 		 364 aa  158  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  33.14 
 
 		 422 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  34.42 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0999  efflux pump membrane protein  32.29 
 
 		 390 aa  155  7e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.486081  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02540  multidrug efflux system  32.29 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2968  multidrug resistance protein A  32.29 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1022  efflux pump membrane protein  32.29 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.727271  normal  0.0227655 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2821  multidrug resistance protein A  32.29 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02505  hypothetical protein  32.29 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2807  multidrug resistance protein A  32.29 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000414824  hitchhiker  0.00826621 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  31 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6554  multidrug resistance protein MdtN  33.83 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.89511 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2225  secretion protein HlyD family protein  32.7 
 
 		 397 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3191  multidrug resistance protein A  32 
 
 		 390 aa  153  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.168067  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  34.89 
 
 		 385 aa  153  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  32.61 
 
 		 390 aa  153  5e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  32.31 
 
 		 390 aa  153  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2027  secretion protein HlyD  31.46 
 
 		 413 aa  153  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294658  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  31.89 
 
 		 411 aa  153  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  34.43 
 
 		 413 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  32.66 
 
 		 456 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  31.37 
 
 		 443 aa  152  7e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  32.33 
 
 		 368 aa  152  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  30.55 
 
 		 366 aa  152  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  32.81 
 
 		 349 aa  152  8e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  30.73 
 
 		 351 aa  152  8e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3930  multidrug resistance protein A  32 
 
 		 394 aa  152  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.725166 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  33.97 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3549  secretion protein HlyD family protein  32.39 
 
 		 397 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3748  multidrug resistance protein  31.27 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155411  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2024  secretion protein HlyD  31.44 
 
 		 429 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0436308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>