286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5369 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5369  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  543  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00338778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3819  signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 318 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 631 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 		 339 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 559 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  36.71 
 
 		 1190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 577 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 		 489 aa  109  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4618  signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 454 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5589  sensor histidine kinase  36.06 
 
 		 632 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  37.57 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  37.17 
 
 		 499 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0743  HWE histidine kinase  35.55 
 
 		 483 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5005  signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 		 334 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6624  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 488 aa  105  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  38.12 
 
 		 1160 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  37.68 
 
 		 478 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0559  HWE histidine kinase  32.37 
 
 		 337 aa  102  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.690554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 850 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38.38 
 
 		 846 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 338 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3313  hypothetical protein  37.25 
 
 		 480 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 571 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 713 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5742  signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 398 aa  99.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 586 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  34.76 
 
 		 733 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7680  hypothetical protein  30.4 
 
 		 320 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  33.04 
 
 		 1027 aa  99.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  39.2 
 
 		 1063 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1232  signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0779758  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  37.19 
 
 		 872 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 372 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  33.18 
 
 		 505 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.12 
 
 		 849 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 503 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  35.9 
 
 		 561 aa  96.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 840 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  36.13 
 
 		 488 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  37.23 
 
 		 847 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 488 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 		 500 aa  95.9  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  32.86 
 
 		 460 aa  95.9  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 349 aa  95.5  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  33.04 
 
 		 728 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 728 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 341 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 907 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3364  signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 		 550 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 601 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 387 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 488 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 588 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0007  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 482 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.489749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  35.71 
 
 		 1061 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3338  hypothetical protein  34.17 
 
 		 333 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.18159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 602 aa  93.2  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 507 aa  93.2  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0982  hypothetical protein  38.71 
 
 		 143 aa  93.2  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  36.68 
 
 		 856 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 713 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  35.24 
 
 		 717 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4826  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 553 aa  92  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.788722  normal  0.27838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  35.82 
 
 		 847 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  38.42 
 
 		 1167 aa  91.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  34.34 
 
 		 844 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3666  signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 550 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123232  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  35.82 
 
 		 847 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1628  sensor histidine protein kinase  34 
 
 		 332 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.560713  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 336 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 930 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 759 aa  89.7  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 662 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  34.78 
 
 		 842 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 677 aa  89.7  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5012  putative sensory transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 333 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235153  normal  0.174809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 901 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 465 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 1191 aa  89  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 929 aa  89  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2055  signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 655 aa  89  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.2 
 
 		 844 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5599  signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 389 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  38.04 
 
 		 855 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  33.66 
 
 		 930 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5593  two component sensor kinase  34.22 
 
 		 352 aa  87  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 489 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 934 aa  87  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2072  signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 829 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  33.16 
 
 		 583 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 583 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 336 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2768  signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 333 aa  85.5  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 897 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3933  signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 579 aa  85.5  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939914  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 583 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0574  signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1213  signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 603 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>